84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0212 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0212  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  100 
 
 		 335 aa  630  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0156  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  97.16 
 
 		 335 aa  559  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0712  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  85.2 
 
 		 335 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0914  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  43.21 
 
 		 357 aa  291  8e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.120937  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2607  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  45.16 
 
 		 329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898363  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4485  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  41.61 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0140  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  40.13 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5797  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  42.12 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2052  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  32.6 
 
 		 322 aa  185  7e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1964  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  36.88 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2285  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  38.21 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0767  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  31.33 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000262712  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1275  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  39.72 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.360246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3048  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  38.61 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.015638  normal  0.0398441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1002  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  31.49 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1428  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  32.14 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.648837  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0251  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  35.14 
 
 		 320 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.448542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0374  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  34.07 
 
 		 321 aa  126  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.273821  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1488  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  31.34 
 
 		 326 aa  125  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.138957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0262  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.57 
 
 		 326 aa  125  9e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.490453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1129  hypothetical protein  34.15 
 
 		 319 aa  123  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.392621 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2959  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  34.91 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.465608  normal  0.0266391 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2524  putative C4-dicarboxylate transporter / malic acid transport protein  38.73 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0724806 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2391  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  35.05 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.310248 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1250  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  31.25 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.618998 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1491  putative mvin protein  29.9 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5718  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  29.33 
 
 		 385 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.722941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4011  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  33.12 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4679  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  31.51 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2043  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  34.41 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031135 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3788  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  31.44 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0482  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  29.45 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1960  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  22.68 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2458  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  28.3 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.692661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2116  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  25.64 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0404  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.44 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1367  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  29.03 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1787  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  27.63 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1974  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  26.75 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1723  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  28.2 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2665  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.14 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2687  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.14 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1697  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.14 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.536393  hitchhiker  0.000152947 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06234  hypothetical protein  30.82 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1552  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  27.3 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1906  hypothetical protein  24.73 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1726  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  27.3 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.140642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1733  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  27.3 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.933119 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000479  tellurite resistance protein  30.14 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2034  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  26.98 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00204759  hitchhiker  5.87722e-19 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01397  hypothetical protein  26.98 
 
 		 330 aa  57  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2218  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.98 
 
 		 330 aa  57  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1510  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  26.98 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01386  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  26.98 
 
 		 330 aa  57  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2231  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  26.98 
 
 		 330 aa  57  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.360309 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2766  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  29.45 
 
 		 332 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0195102 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0679  putative C4-dicarboxylate/malic acid transport protein  25 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0950356  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2372  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.13 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1607  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  26.67 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1656  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  26.67 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1679  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.9 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0920499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1746  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  26.67 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000864633  hitchhiker  4.635829999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2530  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.07 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0784  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.88 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1559  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.48 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.239872 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2874  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.44 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0144876 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1498  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.58 
 
 		 329 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03304  hypothetical protein  23.74 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2906  hypothetical protein  24.88 
 
 		 332 aa  51.2  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002682  tellurite resistance protein  23.16 
 
 		 324 aa  49.7  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0518365  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1807  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.85 
 
 		 373 aa  49.7  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0042  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.44 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0041  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.44 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.299856  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1565  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.03 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3436  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.21 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0680  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.25 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1717  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.94 
 
 		 322 aa  46.6  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3375  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25 
 
 		 353 aa  46.2  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0457  hypothetical protein  35.05 
 
 		 210 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.5799  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0126  C4-dicarboxylate transporter family protein  20.92 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307461  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0123  C4-dicarboxylate transporter  20.92 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0591  putative tellurite resistance protein  32.76 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.761237  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1664  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  33.75 
 
 		 383 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537362  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1475  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  22.43 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>