68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2906 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2906  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1559  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  88.41 
 
 		 329 aa  593  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.239872 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1498  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  87.2 
 
 		 329 aa  589  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1565  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  86.89 
 
 		 329 aa  589  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2766  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  79.52 
 
 		 332 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0195102 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1697  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  79.52 
 
 		 332 aa  527  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.536393  hitchhiker  0.000152947 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2687  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  79.52 
 
 		 332 aa  527  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2665  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  79.22 
 
 		 332 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2372  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  78.98 
 
 		 334 aa  502  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2874  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  68.55 
 
 		 322 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0144876 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1679  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  67.61 
 
 		 330 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0920499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1717  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  64.98 
 
 		 322 aa  418  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0679  putative C4-dicarboxylate/malic acid transport protein  64.26 
 
 		 329 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0950356  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1504  hypothetical protein  61.15 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.34521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03304  hypothetical protein  61.2 
 
 		 324 aa  368  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0784  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  61.56 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002682  tellurite resistance protein  60.57 
 
 		 324 aa  363  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0518365  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1906  hypothetical protein  60.95 
 
 		 322 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2530  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  62.34 
 
 		 323 aa  350  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1960  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  36.48 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000479  tellurite resistance protein  32.69 
 
 		 315 aa  159  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06234  hypothetical protein  35.06 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1475  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.79 
 
 		 308 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0123  C4-dicarboxylate transporter  29.38 
 
 		 338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0126  C4-dicarboxylate transporter family protein  28.44 
 
 		 338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307461  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0220  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  31.12 
 
 		 329 aa  125  9e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.698092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0457  hypothetical protein  37.98 
 
 		 210 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.5799  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D35  tellurite resistance protein related permease  31.11 
 
 		 323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0741739  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1208  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  29.74 
 
 		 307 aa  112  9e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0424  tellurite resistance protein related permease  34.82 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104982  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1215  hypothetical protein  31.52 
 
 		 305 aa  102  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00293385  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1231  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.68 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1256  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.68 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.816232  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0374  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.83 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.273821  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1275  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.14 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.360246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1428  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.58 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.648837  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2959  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  28.68 
 
 		 315 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.465608  normal  0.0266391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1964  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.58 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2391  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.06 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.310248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3048  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  28.92 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.015638  normal  0.0398441 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0251  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.57 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.448542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2285  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.04 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1129  hypothetical protein  26.49 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.392621 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1002  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  22.58 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2607  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.53 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898363  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1488  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.01 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.138957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5718  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.16 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.722941 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2524  putative C4-dicarboxylate transporter / malic acid transport protein  29.28 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0724806 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4485  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.11 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1491  putative mvin protein  26.74 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1250  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.6 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.618998 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0262  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  22.6 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.490453  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0767  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  22.67 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000262712  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2052  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  22.48 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5797  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  28.03 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0914  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  21.82 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.120937  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0140  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  29.22 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0680  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  28.1 
 
 		 346 aa  54.3  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0699  exfoliative exotoxin B, putative  27.03 
 
 		 295 aa  52.8  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0212  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.88 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0156  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.88 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4679  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  26.81 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0712  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.26 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3375  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.9 
 
 		 353 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4011  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  24.26 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2212  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25 
 
 		 347 aa  42.7  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42513  predicted protein  21.45 
 
 		 1379 aa  42.7  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2914  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.71 
 
 		 369 aa  42.4  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>