68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1565 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1565  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  100 
 
 		 329 aa  651    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1498  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  96.96 
 
 		 329 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1559  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  92.71 
 
 		 329 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.239872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2906  hypothetical protein  86.89 
 
 		 332 aa  589  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2766  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  79.51 
 
 		 332 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0195102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2687  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  79.82 
 
 		 332 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1697  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  79.82 
 
 		 332 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.536393  hitchhiker  0.000152947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2665  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  79.75 
 
 		 332 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2372  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  82.33 
 
 		 334 aa  500  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2874  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  67.94 
 
 		 322 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0144876 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1717  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  64.98 
 
 		 322 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1679  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  66.98 
 
 		 330 aa  413  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0920499  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0679  putative C4-dicarboxylate/malic acid transport protein  62.58 
 
 		 329 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0950356  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1504  hypothetical protein  62.42 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.34521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03304  hypothetical protein  60.44 
 
 		 324 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002682  tellurite resistance protein  60.44 
 
 		 324 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0518365  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0784  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  60.26 
 
 		 322 aa  360  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1906  hypothetical protein  61.78 
 
 		 322 aa  355  6.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2530  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  62.66 
 
 		 323 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1960  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  36.36 
 
 		 313 aa  172  9e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000479  tellurite resistance protein  32.79 
 
 		 315 aa  159  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06234  hypothetical protein  33.85 
 
 		 299 aa  152  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1475  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.13 
 
 		 308 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0123  C4-dicarboxylate transporter  29.41 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0126  C4-dicarboxylate transporter family protein  29.41 
 
 		 338 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307461  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0220  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  34.75 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.698092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D35  tellurite resistance protein related permease  31.61 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0741739  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0457  hypothetical protein  38.24 
 
 		 210 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.5799  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1208  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.1 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0424  tellurite resistance protein related permease  34.47 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104982  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1215  hypothetical protein  31.1 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00293385  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1231  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  32.31 
 
 		 315 aa  92.8  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1256  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  32.31 
 
 		 315 aa  92.8  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.816232  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0374  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  28.96 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.273821  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1275  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.62 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.360246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2959  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  28.85 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.465608  normal  0.0266391 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1002  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  22.53 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1428  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  22.07 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.648837  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2391  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.32 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.310248 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0251  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.2 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.448542  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3048  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.91 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.015638  normal  0.0398441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2285  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  22.55 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1964  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  22.33 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5718  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.58 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.722941 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1488  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.27 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.138957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1129  hypothetical protein  25.58 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.392621 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2607  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.52 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898363  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4485  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.17 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0914  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.09 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.120937  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1491  putative mvin protein  26.17 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2524  putative C4-dicarboxylate transporter / malic acid transport protein  28.29 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0724806 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1250  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.618998 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0262  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.08 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.490453  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0767  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  22.01 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000262712  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0680  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.78 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4679  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  27.27 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2052  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  18.99 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0140  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.8 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3375  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.79 
 
 		 353 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5797  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  28.21 
 
 		 332 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0712  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  28.95 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4011  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  23.81 
 
 		 338 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0699  exfoliative exotoxin B, putative  27.68 
 
 		 295 aa  50.1  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0156  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.79 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0212  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.03 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0482  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  24.89 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1552  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  21.79 
 
 		 337 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1974  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  22.61 
 
 		 334 aa  42.7  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>