88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2524 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2524  putative C4-dicarboxylate transporter / malic acid transport protein  100 
 
 		 325 aa  622  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0724806 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2959  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  58.15 
 
 		 315 aa  328  9e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.465608  normal  0.0266391 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2391  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  51.37 
 
 		 324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.310248 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1275  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  44.82 
 
 		 323 aa  258  7e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.360246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0262  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  39.39 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.490453  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0374  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  43.3 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.273821  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1428  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  35.95 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.648837  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1129  hypothetical protein  37.93 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.392621 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3048  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  43.22 
 
 		 317 aa  205  8e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.015638  normal  0.0398441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1002  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  33.84 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1964  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  36.79 
 
 		 341 aa  199  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0251  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  40.18 
 
 		 320 aa  198  7.999999999999999e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.448542  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1488  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  37.23 
 
 		 326 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.138957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2285  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  38.19 
 
 		 342 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0767  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  34.92 
 
 		 320 aa  186  5e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000262712  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2052  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  34.47 
 
 		 322 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1250  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  37.54 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.618998 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1491  putative mvin protein  38.02 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2607  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  36.42 
 
 		 329 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898363  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0212  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  38.73 
 
 		 335 aa  143  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0156  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  37.73 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0712  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  37.46 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0914  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.38 
 
 		 357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.120937  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4485  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  31.21 
 
 		 331 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0140  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  31.31 
 
 		 322 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4011  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  32.04 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5718  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  31.32 
 
 		 385 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.722941 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3788  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  33.86 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5797  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  33.75 
 
 		 332 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0482  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  33.67 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2458  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  29.13 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.692661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1974  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  29.07 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2218  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  29.69 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1510  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  29.69 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01397  hypothetical protein  29.69 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1607  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  27.88 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2231  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  29.69 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.360309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2034  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  27.88 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00204759  hitchhiker  5.87722e-19 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01386  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  29.69 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1656  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  28.21 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1746  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  29.34 
 
 		 330 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000864633  hitchhiker  4.635829999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1723  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  30.6 
 
 		 337 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1787  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  30.6 
 
 		 337 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1733  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  30.74 
 
 		 337 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.933119 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1726  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  30.74 
 
 		 337 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.140642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2372  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  29.02 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1552  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  30.39 
 
 		 337 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2116  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  27.92 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1559  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  28.68 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.239872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1565  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  28.29 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2906  hypothetical protein  29.28 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1498  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.91 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4679  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  29 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2665  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.46 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2687  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.46 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1697  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.46 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.536393  hitchhiker  0.000152947 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1679  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0920499  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2766  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.05 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0195102 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2530  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.59 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1960  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.79 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1906  hypothetical protein  26.18 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1717  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.35 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002682  tellurite resistance protein  25.56 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0518365  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0784  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.16 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03304  hypothetical protein  24.66 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0679  putative C4-dicarboxylate/malic acid transport protein  26.32 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0950356  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2874  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.82 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0144876 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1504  hypothetical protein  27.57 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.34521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0680  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.46 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2043  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  29.7 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031135 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1367  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  27.57 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3375  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.86 
 
 		 353 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2212  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  22.34 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1475  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.62 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687324  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06234  hypothetical protein  26.5 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D35  tellurite resistance protein related permease  24.54 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0741739  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0424  tellurite resistance protein related permease  27.47 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104982  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000479  tellurite resistance protein  25.71 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2914  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.47 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3436  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.69 
 
 		 375 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0123  C4-dicarboxylate transporter  23.5 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1807  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.34 
 
 		 373 aa  51.2  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0126  C4-dicarboxylate transporter family protein  23.5 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307461  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0220  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.54 
 
 		 329 aa  49.3  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.698092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0457  hypothetical protein  31.13 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.5799  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0542  hypothetical protein  28.78 
 
 		 239 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4391  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.2 
 
 		 395 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4384  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.78 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>