59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1510 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2218  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  99.7 
 
 		 330 aa  655    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1656  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  98.18 
 
 		 330 aa  646    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1746  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  99.09 
 
 		 330 aa  651    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000864633  hitchhiker  4.635829999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2231  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  99.7 
 
 		 330 aa  655    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.360309 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01386  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  99.7 
 
 		 330 aa  655    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1607  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  99.39 
 
 		 330 aa  654    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1510  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  100 
 
 		 330 aa  656    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2034  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  99.09 
 
 		 330 aa  652    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00204759  hitchhiker  5.87722e-19 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01397  hypothetical protein  99.7 
 
 		 330 aa  655    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1787  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  87.54 
 
 		 337 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1726  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  87.54 
 
 		 337 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.140642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1733  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  87.54 
 
 		 337 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.933119 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1723  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  87.23 
 
 		 337 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1552  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  87.23 
 
 		 337 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1974  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  81.76 
 
 		 334 aa  529  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2458  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  69.74 
 
 		 327 aa  441  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.692661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2116  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  63.41 
 
 		 322 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4679  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  44.63 
 
 		 342 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2043  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  43.32 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031135 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4011  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  38.68 
 
 		 338 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0482  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  38.1 
 
 		 340 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1367  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  41.75 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1428  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.61 
 
 		 326 aa  106  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.648837  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1275  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  28.52 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.360246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1002  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.92 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0262  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.84 
 
 		 326 aa  104  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.490453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1129  hypothetical protein  25.71 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.392621 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5718  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  28.85 
 
 		 385 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.722941 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0251  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.4 
 
 		 320 aa  92.4  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.448542  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2052  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  21.88 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1964  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.97 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0374  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.19 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.273821  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2607  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.36 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898363  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4485  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  28.34 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0767  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  21.88 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000262712  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0914  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.46 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.120937  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2285  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.31 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1250  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  22.19 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.618998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0140  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.13 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2524  putative C4-dicarboxylate transporter / malic acid transport protein  31.03 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0724806 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1488  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.1 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.138957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3788  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.75 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5797  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.2 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3048  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.57 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.015638  normal  0.0398441 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2391  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.19 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.310248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2959  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.15 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.465608  normal  0.0266391 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0156  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  28.11 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0212  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.93 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1491  putative mvin protein  23.29 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002682  tellurite resistance protein  22.79 
 
 		 324 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0518365  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1906  hypothetical protein  22.89 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0712  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  28.21 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03304  hypothetical protein  21.48 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2530  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  21.25 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0784  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  21.54 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0679  putative C4-dicarboxylate/malic acid transport protein  20.36 
 
 		 329 aa  47  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0950356  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1717  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  21.17 
 
 		 322 aa  46.6  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2878  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  29.21 
 
 		 356 aa  46.2  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0680  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.37 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>