60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1504 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1504  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  660    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.34521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2665  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  62.7 
 
 		 332 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1697  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  62.7 
 
 		 332 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.536393  hitchhiker  0.000152947 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2687  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  62.7 
 
 		 332 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2766  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  62.38 
 
 		 332 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0195102 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1565  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  62.42 
 
 		 329 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1559  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  61.78 
 
 		 329 aa  371  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.239872 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1498  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  61.46 
 
 		 329 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2906  hypothetical protein  61.15 
 
 		 332 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2372  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  62.82 
 
 		 334 aa  366  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2874  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  61.29 
 
 		 322 aa  360  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0144876 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1679  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  58.41 
 
 		 330 aa  352  4e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0920499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1717  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  58.06 
 
 		 322 aa  350  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1906  hypothetical protein  57.52 
 
 		 322 aa  323  3e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0679  putative C4-dicarboxylate/malic acid transport protein  56.44 
 
 		 329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0950356  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03304  hypothetical protein  55.16 
 
 		 324 aa  318  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0784  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  55.3 
 
 		 322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002682  tellurite resistance protein  54.19 
 
 		 324 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0518365  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2530  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  55.77 
 
 		 323 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000479  tellurite resistance protein  35.69 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06234  hypothetical protein  36.68 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1475  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  29.43 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687324  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1960  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  34.98 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0457  hypothetical protein  39.52 
 
 		 210 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.5799  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0220  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  33.58 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.698092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1208  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.95 
 
 		 307 aa  123  5e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0123  C4-dicarboxylate transporter  26.79 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0126  C4-dicarboxylate transporter family protein  26.48 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307461  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1215  hypothetical protein  32.43 
 
 		 305 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00293385  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D35  tellurite resistance protein related permease  30.28 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0741739  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1231  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.66 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1256  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.66 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.816232  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0424  tellurite resistance protein related permease  30.8 
 
 		 280 aa  100  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104982  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0374  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  29.13 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.273821  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1488  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.7 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.138957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2959  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.48 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.465608  normal  0.0266391 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1428  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.87 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.648837  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1964  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.39 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1250  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  28.12 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.618998 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0251  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  28.71 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.448542  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1002  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.04 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1275  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  28.04 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.360246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2391  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.18 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.310248 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1129  hypothetical protein  26.05 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.392621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2285  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.41 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1491  putative mvin protein  29.54 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3048  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  32.59 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.015638  normal  0.0398441 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0262  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  21.77 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.490453  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5718  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.27 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.722941 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2524  putative C4-dicarboxylate transporter / malic acid transport protein  27.57 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0724806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4679  potassium-tellurite ethidium and proflavin transporter  28.62 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2052  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.35 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0699  exfoliative exotoxin B, putative  28.17 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0914  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.21 
 
 		 357 aa  50.8  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.120937  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0140  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.05 
 
 		 322 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0767  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  22.98 
 
 		 320 aa  50.1  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000262712  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2607  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.71 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898363  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0680  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.87 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4485  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.4 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5797  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.1 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>