47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0170 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0170  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 232 aa  475  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.491703  normal  0.95785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  43.55 
 
 		 274 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  41.94 
 
 		 276 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2411  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 434 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2663  hypothetical protein  37.29 
 
 		 407 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2480  hypothetical protein  37.29 
 
 		 407 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.400243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2698  hypothetical protein  35.59 
 
 		 434 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0139158  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2728  hypothetical protein  35.59 
 
 		 407 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.066619  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 270 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2442  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 434 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000095607  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 290 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2678  hypothetical protein  35.59 
 
 		 434 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000191981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 252 aa  45.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  35.94 
 
 		 275 aa  45.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 141 aa  45.4  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  30.99 
 
 		 245 aa  45.1  0.0009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  42.62 
 
 		 156 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  35.38 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  34.33 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2685  hypothetical protein  35.59 
 
 		 407 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  42.62 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 151 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0023  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 135 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2626  hypothetical protein  35.59 
 
 		 407 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.413901  decreased coverage  0.000000430774 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 150 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 149 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 135 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  32.26 
 
 		 253 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  35.48 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7947  putative transcriptional regulator, MerR family  32.53 
 
 		 124 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  32.81 
 
 		 251 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2256  MerR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 136 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  32.31 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  35.48 
 
 		 284 aa  42.7  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  36.07 
 
 		 151 aa  42.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  36.07 
 
 		 151 aa  42.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  35.63 
 
 		 183 aa  42.4  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  39.34 
 
 		 157 aa  42.4  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3542  transcriptional regulator, MerR family  34.57 
 
 		 143 aa  42.4  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  42.62 
 
 		 135 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 133 aa  42  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 152 aa  42  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  37.7 
 
 		 148 aa  41.6  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 254 aa  41.6  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 158 aa  41.6  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>