294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1088 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1088  purine phosphorylase family 2  100 
 
 
223 aa  447  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0767  purine phosphorylase family 2  67.57 
 
 
223 aa  311  6.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.125387  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1028  purine or other phosphorylase family 1  62.56 
 
 
223 aa  270  9e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.703485  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1053  methylthioadenosine phosphorylase  52.68 
 
 
223 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.853329  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1049  purine phosphorylase family 2  52.49 
 
 
224 aa  226  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.644102  normal  0.0916633 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1889  methylthioadenosine phosphorylase  40.52 
 
 
241 aa  162  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.313662  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1925  purine phosphorylase family 2  38.16 
 
 
232 aa  147  9e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0767  purine phosphorylase family 2  36.82 
 
 
253 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1184  purine phosphorylase family 2  36.82 
 
 
253 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0926  purine phosphorylase family 2  36.74 
 
 
252 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1647  methylthioadenosine phosphorylase  37.67 
 
 
265 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1491  methylthioadenosine phosphorylase  35.82 
 
 
253 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0928  methylthioadenosine phosphorylase  34.71 
 
 
263 aa  121  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.563621  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0704  methylthioadenosine phosphorylase  33.76 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.226582  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1185  5'-methylthioadenosine phosphorylase  34.17 
 
 
261 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000207741  normal  0.0524668 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0780  purine or other phosphorylase family 1  36.89 
 
 
224 aa  119  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.863354  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0705  5'-methylthioadenosine phosphorylase  34.03 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052258 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1187  purine phosphorylase family 2  32.87 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1738  5'-methylthioadenosine phosphorylase  34.98 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.53 
 
 
263 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.279888  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1467  5'-methylthioadenosine phosphorylase  34.94 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1401  methylthioadenosine phosphorylase  33.61 
 
 
263 aa  112  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0647  methylthioadenosine phosphorylase  35.84 
 
 
292 aa  111  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.161691  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.56 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1135  methylthioadenosine phosphorylase  29.77 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000013269  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0963  methylthioadenosine phosphorylase  34.44 
 
 
268 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1259  purine phosphorylase family 2  34.68 
 
 
243 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0650  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.04 
 
 
248 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.464101  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1246  methylthioadenosine phosphorylase  31.02 
 
 
250 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1782  methylthioadenosine phosphorylase  29.8 
 
 
244 aa  105  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2065  5'-methylthioadenosine phosphorylase  34.09 
 
 
263 aa  104  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801301  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1329  methylthioadenosine phosphorylase  33.33 
 
 
245 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.590217  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0155  methylthioadenosine phosphorylase  31.02 
 
 
270 aa  101  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3594  methylthioadenosine phosphorylase  33.19 
 
 
258 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1793  methylthioadenosine phosphorylase  34.67 
 
 
252 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000109165  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0182  methylthioadenosine phosphorylase  31.56 
 
 
254 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00638501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3766  purine or other phosphorylase family 1  32.59 
 
 
258 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000828667  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2182  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.98 
 
 
245 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1225  purine phosphorylase family 2  32.56 
 
 
245 aa  100  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.338671  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0622  methylthioadenosine phosphorylase  31.15 
 
 
268 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3869  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.9 
 
 
245 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0618  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  34.3 
 
 
262 aa  98.6  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2966  5'-methylthioadenosine phosphorylase  33.33 
 
 
248 aa  96.7  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329142  hitchhiker  0.0000516298 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3506  phosphorylase, family 2  34.03 
 
 
246 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.941342  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1878  purine phosphorylase family 2  32.74 
 
 
256 aa  96.3  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276636  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1523  5'-methylthioadenosine phosphorylase  33.33 
 
 
248 aa  95.1  8e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  32.86 
 
 
248 aa  93.2  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2340  methylthioadenosine phosphorylase  35.83 
 
 
264 aa  92.8  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2155  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.54 
 
 
245 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3280  5'-methylthioadenosine phosphorylase  33.19 
 
 
246 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01730  5'-methylthioadenosine phosphorylase  30.67 
 
 
243 aa  92.8  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0134  purine phosphorylase family 2  30.16 
 
 
280 aa  92  6e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042299  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2924  methylthioadenosine phosphorylase  33.6 
 
 
263 aa  92  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3192  methylthioadenosine phosphorylase  31.54 
 
 
264 aa  91.7  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0493  methylthioadenosine phosphorylase  31.28 
 
 
294 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1396  methylthioadenosine phosphorylase  31.36 
 
 
255 aa  90.9  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25210  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.54 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.379247  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_458  methylthioadenosine phosphorylase  31.69 
 
 
294 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.137534  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0689  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  28.46 
 
 
269 aa  89.4  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000166903  unclonable  0.000000263743 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1935  purine phosphorylase family 2  31.98 
 
 
262 aa  89.4  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0517  methylthioadenosine phosphorylase  31.69 
 
 
294 aa  89  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1361  methylthioadenosine phosphorylase  28.05 
 
 
257 aa  89  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000221812  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1572  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  32.44 
 
 
280 aa  88.6  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1751  methylthioadenosine phosphorylase  32.51 
 
 
248 aa  88.6  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2403  methylthioadenosine phosphorylase  34.95 
 
 
276 aa  88.2  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.901577  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0276  5'-methylthioadenosine phosphorylase  31.15 
 
 
305 aa  87.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0582  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  31.43 
 
 
280 aa  87.8  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000568497 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1752  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  31.97 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000364775  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1392  methylthioadenosine phosphorylase  30.49 
 
 
302 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1577  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  31.15 
 
 
286 aa  87  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00552276  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0922  5'-methylthioadenosine phosphorylase  32.08 
 
 
267 aa  86.3  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.824829  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  29.67 
 
 
291 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0703  5'-methylthioadenosine phosphorylase  31.4 
 
 
258 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0717  5'-methylthioadenosine phosphorylase  31.4 
 
 
258 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100018  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0697  5'-methylthioadenosine phosphorylase  34.43 
 
 
258 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346474  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8654  methylthioadenosine phosphorylase  33.61 
 
 
269 aa  85.5  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14550  5'-methylthioadenosine phosphorylase  31.93 
 
 
245 aa  85.1  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0365  methylthioadenosine phosphorylase  31.43 
 
 
270 aa  85.1  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0535  methylthioadenosine phosphorylase  31.43 
 
 
270 aa  85.1  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.145655  unclonable  0.0000000000337191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1591  5'-methylthioadenosine phosphorylase  33.79 
 
 
245 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.737464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6331  methylthioadenosine phosphorylase  28.51 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3088  methylthioadenosine phosphorylase  32.29 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2618  methylthioadenosine phosphorylase  31.17 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2590  methylthioadenosine phosphorylase  27.64 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0904  methylthioadenosine phosphorylase  29.88 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1131  purine phosphorylase family 2  30.23 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1035  5'-methylthioadenosine phosphorylase  31.05 
 
 
267 aa  82  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556909  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0524  purine nucleoside phosphorylase  34.48 
 
 
267 aa  81.6  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0303  methylthioadenosine phosphorylase  30.65 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.388658  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0435  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  32.79 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03251  5'-methylthioadenosine phosphorylase  30.36 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5308  5'-methylthioadenosine phosphorylase  32.06 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2145  5'-methylthioadenosine phosphorylase  33.01 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4332  S-methyl-5'-thioadenosine phosphorylase  33.67 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0739  methylthioadenosine phosphorylase  29.1 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.104422 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03271  5'-methylthioadenosine phosphorylase  30.77 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0422  methylthioadenosine phosphorylase  28.74 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.200646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2207  purine nucleoside phosphorylase  35.85 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.672659  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2286  purine nucleoside phosphorylase  35.85 
 
 
266 aa  79  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.667426  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>