More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1236 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1236  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
325 aa  669    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0981  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.37 
 
 
327 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.741695  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2561  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.4 
 
 
321 aa  443  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1727  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.35 
 
 
323 aa  434  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0524  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.26 
 
 
315 aa  409  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0925599  normal  0.564293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1463  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.57 
 
 
324 aa  369  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1228  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.07 
 
 
318 aa  361  9e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000110941  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0050  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.82 
 
 
317 aa  361  9e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.83 
 
 
326 aa  358  8e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  55.05 
 
 
325 aa  354  1e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.35 
 
 
327 aa  350  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1362  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.82 
 
 
326 aa  349  4e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.414153  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.25 
 
 
326 aa  346  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.68 
 
 
324 aa  345  6e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.68 
 
 
325 aa  345  6e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1161  Porphobilinogen synthase  55.15 
 
 
336 aa  345  7e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.353722  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0015  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.21 
 
 
326 aa  345  8.999999999999999e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.767271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.78 
 
 
352 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2032  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.28 
 
 
327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10895  normal  0.787355 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  56.31 
 
 
336 aa  342  4e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.33 
 
 
341 aa  342  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.76 
 
 
326 aa  341  9e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1836  Porphobilinogen synthase  53.38 
 
 
326 aa  339  2.9999999999999998e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.07 
 
 
325 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.73 
 
 
341 aa  338  8e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.55 
 
 
325 aa  338  9e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.08 
 
 
326 aa  336  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.43 
 
 
341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2019  Porphobilinogen synthase  52.12 
 
 
333 aa  336  3.9999999999999995e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.84 
 
 
341 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.01 
 
 
329 aa  334  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.8 
 
 
324 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.19 
 
 
326 aa  333  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.7 
 
 
329 aa  333  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.39 
 
 
324 aa  333  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.35 
 
 
325 aa  333  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.7 
 
 
329 aa  332  4e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.7 
 
 
329 aa  332  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.7 
 
 
329 aa  332  4e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  52.76 
 
 
328 aa  332  4e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.7 
 
 
329 aa  332  4e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.7 
 
 
329 aa  332  4e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.08 
 
 
329 aa  332  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.68 
 
 
326 aa  331  9e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.55 
 
 
329 aa  331  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.85 
 
 
322 aa  330  2e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  53.99 
 
 
330 aa  329  3e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  52.62 
 
 
330 aa  329  4e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.78 
 
 
329 aa  329  4e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.85 
 
 
322 aa  329  4e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0188  Porphobilinogen synthase  53.27 
 
 
341 aa  329  4e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.08 
 
 
329 aa  328  6e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0925  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.67 
 
 
326 aa  328  7e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412734  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52 
 
 
322 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3550  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.92 
 
 
335 aa  327  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0688  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.3 
 
 
326 aa  326  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000853777  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  54.43 
 
 
324 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.54 
 
 
337 aa  325  6e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.69 
 
 
325 aa  325  7e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.92 
 
 
339 aa  325  7e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.02 
 
 
325 aa  325  7e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0571  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52 
 
 
322 aa  325  7e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.718551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.62 
 
 
339 aa  324  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1232  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.53 
 
 
324 aa  324  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.92 
 
 
321 aa  323  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.61 
 
 
321 aa  323  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0916  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.24 
 
 
326 aa  322  4e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.24 
 
 
322 aa  322  8e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.851978  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2576  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.32 
 
 
331 aa  321  8e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1027  Porphobilinogen synthase  48.76 
 
 
325 aa  321  9.999999999999999e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0739722  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1771  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.6 
 
 
328 aa  319  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.845142  normal  0.720869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1560  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.6 
 
 
328 aa  319  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1726  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.91 
 
 
324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.192115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.91 
 
 
324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0215  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.61 
 
 
336 aa  318  5e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000475247  normal  0.0306727 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0141  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.07 
 
 
327 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.76 
 
 
325 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5932  Porphobilinogen synthase  54.84 
 
 
327 aa  318  1e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4525  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.6 
 
 
329 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1701  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 
323 aa  316  3e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2392  Porphobilinogen synthase  50.63 
 
 
325 aa  316  4e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.62 
 
 
323 aa  316  4e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1740  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.82 
 
 
347 aa  315  6e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.77 
 
 
324 aa  315  8e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0573  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.72 
 
 
346 aa  314  9.999999999999999e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000688177  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0171  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.91 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0709  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.23 
 
 
315 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0545  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.68 
 
 
322 aa  313  1.9999999999999998e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0403399  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1073  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.29 
 
 
327 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104677 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.72 
 
 
334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000102643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4300  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.41 
 
 
343 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4544  porphobilinogen synthase  50.61 
 
 
325 aa  311  9e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1772  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.48 
 
 
331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1372  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.76 
 
 
331 aa  309  4e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.31 
 
 
327 aa  308  6.999999999999999e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0288  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.38 
 
 
328 aa  308  8e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3144  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.07 
 
 
324 aa  308  8e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0687619  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2902  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.61 
 
 
333 aa  308  9e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.118535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>