88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0548 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0548  adenylate cyclase  100 
 
 
177 aa  354  2.9999999999999997e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1935  adenylate cyclase  55.49 
 
 
171 aa  198  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00466325  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2305  adenylyl cyclase CyaB  45.56 
 
 
181 aa  149  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0126885  normal  0.751604 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0514  adenylyl cyclase CyaB  47.75 
 
 
181 aa  144  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0805  adenylyl cyclase CyaB  43.52 
 
 
200 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.763555  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0808  putative adenylyl cyclase CyaB  47.67 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1114  putative adenylyl cyclase CyaB  40.91 
 
 
176 aa  129  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.643274 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0006  adenylate cyclase  43.26 
 
 
182 aa  124  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.136902 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1326  putative adenylyl cyclase CyaB  43.5 
 
 
175 aa  122  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.422285 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0037  adenylate cyclase  40.7 
 
 
176 aa  120  7e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1668  adenylyl cyclase CyaB  44.69 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1167  adenylyl cyclase CyaB, putative  43.5 
 
 
175 aa  119  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0067  adenylyl cyclase CyaB  40.11 
 
 
176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.160565  normal  0.206262 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0933  putative adenylyl cyclase CyaB  44.97 
 
 
176 aa  114  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.164628  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0317  putative adenylyl cyclase CyaB  40 
 
 
187 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal  0.0901791 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0075  putative adenylyl cyclase CyaB  38.37 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109831  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1595  adenylyl cyclase CyaB  40.11 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0248189  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0530  putative adenylyl cyclase CyaB  40.56 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0386  putative adenylyl cyclase CyaB  41.11 
 
 
186 aa  108  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0190069  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0902  putative adenylyl cyclase CyaB  37.78 
 
 
187 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1572  adenylyl cyclase CyaB  38.76 
 
 
175 aa  103  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.845661  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0623  adenylyl cyclase CyaB  37.93 
 
 
169 aa  102  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2432  adenylyl cyclase CyaB  37.5 
 
 
195 aa  102  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0038  putative adenylyl cyclase CyaB  46.32 
 
 
180 aa  102  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.318646  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0735  putative adenylyl cyclase CyaB  36.46 
 
 
184 aa  99.4  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00219376 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3462  adenylyl cyclase CyaB  37.73 
 
 
221 aa  95.1  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1229  adenylyl cyclase CyaB  34.27 
 
 
186 aa  92.4  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1147  hypothetical protein  37.57 
 
 
199 aa  89.4  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2312  putative adenylyl cyclase CyaB  32.37 
 
 
198 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0940  putative adenylyl cyclase CyaB  27.65 
 
 
185 aa  62.4  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0024  adenylate cyclase  26.7 
 
 
183 aa  62  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3104  putative adenylyl cyclase CyaB  27.66 
 
 
197 aa  60.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2494  adenylate cyclase  32.1 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.262125  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0323  adenylyl cyclase CyaB  28.24 
 
 
172 aa  60.1  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.362109  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1050  putative adenylate cyclase CyaB  26.55 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1665  putative adenylyl cyclase CyaB  26.97 
 
 
183 aa  58.9  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3778  adenylate cyclase CyaB, putative  27.66 
 
 
194 aa  58.2  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2101  adenylate cyclase  28.73 
 
 
205 aa  57.8  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.780192  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1517  putative adenylyl cyclase CyaB  26.24 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000378541  normal  0.664583 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0910  putative adenylyl cyclase CyaB  26.76 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1059  adenylate cyclase  28.42 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.743648  normal  0.0414409 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0901  adenylyl cyclase CyaB  25.53 
 
 
195 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0875  putative adenylyl cyclase CyaB  24.82 
 
 
195 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1784  putative adenylyl cyclase CyaB  25.84 
 
 
194 aa  55.5  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0056  adenylate cyclase  36.36 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3461  putative adenylyl cyclase CyaB  26.06 
 
 
195 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1526  adenylate cyclase  28.98 
 
 
176 aa  54.7  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0013  putative adenylate cyclase  23.84 
 
 
178 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0842  putative adenylyl cyclase CyaB  29.46 
 
 
204 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.112196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3125  putative adenylyl cyclase CyaB  29.46 
 
 
204 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3919  adenylate cyclase  23.26 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0814  putative adenylyl cyclase CyaB  29.46 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3053  adenylate cyclase  25.17 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2804  adenylate cyclase, class IV  24.84 
 
 
179 aa  52.4  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1350  adenylate cyclase 2  24.84 
 
 
179 aa  52.4  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0174263 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4073  adenylate cyclase  25.81 
 
 
176 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2988  putative adenylate cyclase  25.81 
 
 
176 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1614  putative adenylate cyclase  25.81 
 
 
176 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3381  putative adenylate cyclase  25.81 
 
 
176 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2929  adenylate cyclase, putative  25.81 
 
 
176 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3999  adenylate cyclase  25.81 
 
 
176 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0204  adenylate cyclase  25.81 
 
 
176 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2975  adenylate cyclase  24.48 
 
 
177 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0080  adenylate cyclase  24.48 
 
 
177 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02204  hypothetical protein  26.16 
 
 
182 aa  51.2  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0098  adenylate cyclase  23.78 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3261  adenylate cyclase  23.78 
 
 
177 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0080  adenylate cyclase  23.78 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678459  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2820  adenylyl cyclase CyaB  29.28 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3335  adenylate cyclase  25.81 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0568  adenylate cyclase  27.86 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0079  adenylate cyclase  23.08 
 
 
177 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0071  adenylate cyclase  23.08 
 
 
177 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0232  adenylyl cyclase CyaB  30.15 
 
 
178 aa  47.8  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0631  adenylate cyclase  26.16 
 
 
179 aa  45.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1537  adenylyl cyclase CyaB  24.34 
 
 
180 aa  45.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3048  adenylate cyclase  27.7 
 
 
179 aa  44.7  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.128686  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2577  adenylate cyclase  38.14 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2502  adenylyl cyclase CyaB  24.78 
 
 
179 aa  44.3  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1326  adenylate cyclase  28.21 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0444909  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1648  adenylate cyclase  32.65 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.175687  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0747  putative adenylyl cyclase CyaB  22.73 
 
 
177 aa  42.4  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.184123  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1559  putative adenylate cyclase  26.88 
 
 
187 aa  42  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0817125  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1352  adenylate cyclase  26.88 
 
 
187 aa  42  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294884  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1262  adenylate cyclase  26.92 
 
 
172 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102777  normal  0.401901 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0460  adenylate cyclase  27.63 
 
 
225 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.43514 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2924  adenylyl cyclase CyaB  21.84 
 
 
180 aa  41.2  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.880007  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1389  hypothetical protein  24.14 
 
 
172 aa  41.2  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>