52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0875 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0875  putative adenylyl cyclase CyaB  100 
 
 
195 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0901  adenylyl cyclase CyaB  96.92 
 
 
195 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0910  putative adenylyl cyclase CyaB  96.92 
 
 
195 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3461  putative adenylyl cyclase CyaB  96.91 
 
 
195 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3104  putative adenylyl cyclase CyaB  83.94 
 
 
197 aa  346  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3778  adenylate cyclase CyaB, putative  79.69 
 
 
194 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0842  putative adenylyl cyclase CyaB  80.75 
 
 
204 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.112196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3125  putative adenylyl cyclase CyaB  80.21 
 
 
204 aa  294  5e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0814  putative adenylyl cyclase CyaB  80.85 
 
 
213 aa  292  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1050  putative adenylate cyclase CyaB  69.1 
 
 
185 aa  254  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0024  adenylate cyclase  63.07 
 
 
183 aa  234  5.0000000000000005e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0940  putative adenylyl cyclase CyaB  59.78 
 
 
185 aa  231  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1665  putative adenylyl cyclase CyaB  56.07 
 
 
183 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02204  hypothetical protein  56.25 
 
 
182 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1784  putative adenylyl cyclase CyaB  56.07 
 
 
194 aa  206  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1517  putative adenylyl cyclase CyaB  53.59 
 
 
193 aa  202  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000378541  normal  0.664583 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2804  adenylate cyclase, class IV  49.43 
 
 
179 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1350  adenylate cyclase 2  49.43 
 
 
179 aa  176  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0174263 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2407  adenylyl cyclase CyaB  48.55 
 
 
179 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1537  adenylyl cyclase CyaB  47.98 
 
 
180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2924  adenylyl cyclase CyaB  47.98 
 
 
180 aa  158  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.880007  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2502  adenylyl cyclase CyaB  46.59 
 
 
179 aa  155  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0735  putative adenylyl cyclase CyaB  26.86 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00219376 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0623  adenylyl cyclase CyaB  32.37 
 
 
169 aa  67.8  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1114  putative adenylyl cyclase CyaB  30.06 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.643274 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1326  putative adenylyl cyclase CyaB  30.64 
 
 
175 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.422285 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0808  putative adenylyl cyclase CyaB  30.29 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0037  adenylate cyclase  30.6 
 
 
176 aa  58.9  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0075  putative adenylyl cyclase CyaB  29.17 
 
 
176 aa  58.5  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109831  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0548  adenylate cyclase  24.82 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0067  adenylyl cyclase CyaB  28.48 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.160565  normal  0.206262 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0933  putative adenylyl cyclase CyaB  28.37 
 
 
176 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.164628  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2432  adenylyl cyclase CyaB  29.47 
 
 
195 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0805  adenylyl cyclase CyaB  25.65 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.763555  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1167  adenylyl cyclase CyaB, putative  25 
 
 
175 aa  48.9  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0038  putative adenylyl cyclase CyaB  29.71 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.318646  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2305  adenylyl cyclase CyaB  24.11 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0126885  normal  0.751604 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0514  adenylyl cyclase CyaB  24.81 
 
 
181 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1935  adenylate cyclase  22.41 
 
 
171 aa  46.2  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00466325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1526  adenylate cyclase  24.39 
 
 
176 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1572  adenylyl cyclase CyaB  24.32 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.845661  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0631  adenylate cyclase  27.08 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0056  adenylate cyclase  28.16 
 
 
172 aa  42.4  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1147  hypothetical protein  26.24 
 
 
199 aa  42  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0071  adenylate cyclase  21.68 
 
 
177 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0079  adenylate cyclase  21.68 
 
 
177 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2975  adenylate cyclase  21.68 
 
 
177 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2026  adenylate cyclase  27.12 
 
 
207 aa  41.6  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.836498  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0080  adenylate cyclase  21.68 
 
 
177 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3261  adenylate cyclase  22.38 
 
 
177 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0006  adenylate cyclase  28.07 
 
 
182 aa  41.2  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.136902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3053  adenylate cyclase  21.77 
 
 
176 aa  41.2  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>