39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3053 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_3053  adenylate cyclase  100 
 
 
176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3919  adenylate cyclase  89.89 
 
 
178 aa  323  6e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0013  putative adenylate cyclase  89.89 
 
 
178 aa  321  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3335  adenylate cyclase  84.09 
 
 
176 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2929  adenylate cyclase, putative  86.98 
 
 
176 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0204  adenylate cyclase  86.98 
 
 
176 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2988  putative adenylate cyclase  86.98 
 
 
176 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4073  adenylate cyclase  86.98 
 
 
176 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3999  adenylate cyclase  86.98 
 
 
176 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1614  putative adenylate cyclase  86.98 
 
 
176 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3381  putative adenylate cyclase  86.98 
 
 
176 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0079  adenylate cyclase  85.8 
 
 
177 aa  300  9e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0071  adenylate cyclase  85.8 
 
 
177 aa  300  9e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0080  adenylate cyclase  85.21 
 
 
177 aa  298  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678459  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0080  adenylate cyclase  85.21 
 
 
177 aa  297  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2975  adenylate cyclase  85.21 
 
 
177 aa  297  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3261  adenylate cyclase  85.21 
 
 
177 aa  298  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0098  adenylate cyclase  85.21 
 
 
177 aa  297  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0568  adenylate cyclase  50.29 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1326  adenylate cyclase  50.6 
 
 
172 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0444909  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0631  adenylate cyclase  50.59 
 
 
179 aa  155  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1526  adenylate cyclase  48.52 
 
 
176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0056  adenylate cyclase  50.29 
 
 
172 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1262  adenylate cyclase  48.82 
 
 
172 aa  144  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102777  normal  0.401901 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0323  adenylyl cyclase CyaB  46.11 
 
 
172 aa  137  7.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.362109  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1389  hypothetical protein  47.62 
 
 
172 aa  127  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3048  adenylate cyclase  42.96 
 
 
179 aa  90.1  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.128686  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1059  adenylate cyclase  31.82 
 
 
180 aa  89.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.743648  normal  0.0414409 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1935  adenylate cyclase  28.32 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00466325  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0548  adenylate cyclase  25.17 
 
 
177 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0024  adenylate cyclase  27.18 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0514  adenylyl cyclase CyaB  27.57 
 
 
181 aa  46.2  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3778  adenylate cyclase CyaB, putative  27.65 
 
 
194 aa  45.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1050  putative adenylate cyclase CyaB  27.86 
 
 
185 aa  45.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0940  putative adenylyl cyclase CyaB  23.53 
 
 
185 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0910  putative adenylyl cyclase CyaB  20.69 
 
 
195 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1326  putative adenylyl cyclase CyaB  26.14 
 
 
175 aa  42  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.422285 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0875  putative adenylyl cyclase CyaB  21.77 
 
 
195 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0038  putative adenylyl cyclase CyaB  28.24 
 
 
180 aa  41.6  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.318646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>