43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1389 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1389  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  342  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1262  adenylate cyclase  76.16 
 
 		 172 aa  270  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102777  normal  0.401901 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1326  adenylate cyclase  76.02 
 
 		 172 aa  261  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0444909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0631  adenylate cyclase  55.56 
 
 		 179 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1526  adenylate cyclase  54.12 
 
 		 176 aa  180  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0568  adenylate cyclase  53.22 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0056  adenylate cyclase  53.22 
 
 		 172 aa  173  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0323  adenylyl cyclase CyaB  47.59 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.362109  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0080  adenylate cyclase  48.55 
 
 		 177 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2975  adenylate cyclase  48.24 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0080  adenylate cyclase  48.24 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0098  adenylate cyclase  48.24 
 
 		 177 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0013  putative adenylate cyclase  47.34 
 
 		 178 aa  140  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0079  adenylate cyclase  47.65 
 
 		 177 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0071  adenylate cyclase  47.65 
 
 		 177 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3261  adenylate cyclase  47.65 
 
 		 177 aa  140  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3335  adenylate cyclase  47.65 
 
 		 176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3919  adenylate cyclase  46.15 
 
 		 178 aa  137  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2988  putative adenylate cyclase  48.24 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2929  adenylate cyclase, putative  48.24 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0204  adenylate cyclase  48.24 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4073  adenylate cyclase  48.24 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3999  adenylate cyclase  48.24 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1614  putative adenylate cyclase  48.24 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3381  putative adenylate cyclase  48.24 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3053  adenylate cyclase  47.62 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3048  adenylate cyclase  40.94 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.128686  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1059  adenylate cyclase  32.37 
 
 		 180 aa  94.4  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.743648  normal  0.0414409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0232  adenylyl cyclase CyaB  31.84 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0623  adenylyl cyclase CyaB  25.42 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1648  adenylate cyclase  30.72 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.175687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1572  adenylyl cyclase CyaB  29.46 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.845661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1935  adenylate cyclase  37.18 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00466325  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0875  putative adenylyl cyclase CyaB  29.71 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0842  putative adenylyl cyclase CyaB  29.58 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.112196 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3778  adenylate cyclase CyaB, putative  30.28 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0901  adenylyl cyclase CyaB  29.71 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0814  putative adenylyl cyclase CyaB  29.71 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3125  putative adenylyl cyclase CyaB  29.58 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3104  putative adenylyl cyclase CyaB  28.89 
 
 		 197 aa  42  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0735  putative adenylyl cyclase CyaB  22.91 
 
 		 184 aa  41.6  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00219376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0548  adenylate cyclase  24.14 
 
 		 177 aa  40.8  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2494  adenylate cyclase  39.66 
 
 		 179 aa  40.8  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.262125  normal  0.801077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>