45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0079 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0079  adenylate cyclase  100 
 
 
177 aa  354  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0071  adenylate cyclase  100 
 
 
177 aa  354  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0098  adenylate cyclase  96.61 
 
 
177 aa  343  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0080  adenylate cyclase  96.05 
 
 
177 aa  342  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2975  adenylate cyclase  96.05 
 
 
177 aa  342  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3261  adenylate cyclase  95.48 
 
 
177 aa  341  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0080  adenylate cyclase  93.79 
 
 
177 aa  333  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678459  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3335  adenylate cyclase  88.64 
 
 
176 aa  316  9e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2988  putative adenylate cyclase  89.2 
 
 
176 aa  316  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4073  adenylate cyclase  89.2 
 
 
176 aa  316  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0204  adenylate cyclase  89.2 
 
 
176 aa  316  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2929  adenylate cyclase, putative  89.2 
 
 
176 aa  316  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3999  adenylate cyclase  89.2 
 
 
176 aa  316  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3381  putative adenylate cyclase  89.2 
 
 
176 aa  316  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1614  putative adenylate cyclase  89.2 
 
 
176 aa  316  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3919  adenylate cyclase  81.36 
 
 
178 aa  295  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0013  putative adenylate cyclase  81.14 
 
 
178 aa  291  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3053  adenylate cyclase  85.8 
 
 
176 aa  284  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0568  adenylate cyclase  50.28 
 
 
179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0631  adenylate cyclase  50.59 
 
 
179 aa  155  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0056  adenylate cyclase  51.16 
 
 
172 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1526  adenylate cyclase  48.84 
 
 
176 aa  151  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1326  adenylate cyclase  49.41 
 
 
172 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0444909  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1262  adenylate cyclase  48.26 
 
 
172 aa  141  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102777  normal  0.401901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1389  hypothetical protein  47.65 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0323  adenylyl cyclase CyaB  43.71 
 
 
172 aa  132  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.362109  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3048  adenylate cyclase  41.95 
 
 
179 aa  97.1  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.128686  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1059  adenylate cyclase  31.46 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.743648  normal  0.0414409 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1935  adenylate cyclase  26.14 
 
 
171 aa  50.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00466325  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0548  adenylate cyclase  23.08 
 
 
177 aa  48.5  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0940  putative adenylyl cyclase CyaB  26.76 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0024  adenylate cyclase  23.5 
 
 
183 aa  44.7  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1326  putative adenylyl cyclase CyaB  26.86 
 
 
175 aa  44.3  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.422285 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0805  adenylyl cyclase CyaB  27.14 
 
 
200 aa  44.7  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.763555  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3778  adenylate cyclase CyaB, putative  31.82 
 
 
194 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2804  adenylate cyclase, class IV  25.86 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1350  adenylate cyclase 2  25.86 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0174263 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2407  adenylyl cyclase CyaB  24.56 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308065  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1050  putative adenylate cyclase CyaB  25.28 
 
 
185 aa  42.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0910  putative adenylyl cyclase CyaB  23.08 
 
 
195 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0875  putative adenylyl cyclase CyaB  21.68 
 
 
195 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0038  putative adenylyl cyclase CyaB  25.71 
 
 
180 aa  41.6  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.318646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1517  putative adenylyl cyclase CyaB  24.29 
 
 
193 aa  41.6  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000378541  normal  0.664583 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0901  adenylyl cyclase CyaB  22.38 
 
 
195 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3461  putative adenylyl cyclase CyaB  23.08 
 
 
195 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>