42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1648 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1648  adenylate cyclase  100 
 
 
179 aa  359  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.175687  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2494  adenylate cyclase  63.48 
 
 
179 aa  202  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.262125  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0232  adenylyl cyclase CyaB  49.43 
 
 
178 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0933  putative adenylyl cyclase CyaB  31.25 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.164628  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0805  adenylyl cyclase CyaB  41.03 
 
 
200 aa  52.8  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.763555  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3778  adenylate cyclase CyaB, putative  29.79 
 
 
194 aa  51.2  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1167  adenylyl cyclase CyaB, putative  28 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0323  adenylyl cyclase CyaB  35.06 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.362109  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0940  putative adenylyl cyclase CyaB  27.66 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1350  adenylate cyclase 2  28.83 
 
 
179 aa  48.5  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0174263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2804  adenylate cyclase, class IV  28.83 
 
 
179 aa  48.5  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1389  hypothetical protein  30.72 
 
 
172 aa  48.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0842  putative adenylyl cyclase CyaB  28.87 
 
 
204 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.112196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3125  putative adenylyl cyclase CyaB  28.87 
 
 
204 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0814  putative adenylyl cyclase CyaB  28.87 
 
 
213 aa  47.8  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3461  putative adenylyl cyclase CyaB  26.09 
 
 
195 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0875  putative adenylyl cyclase CyaB  26.95 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0037  adenylate cyclase  38.4 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0901  adenylyl cyclase CyaB  26.09 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0067  adenylyl cyclase CyaB  41.77 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.160565  normal  0.206262 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0910  putative adenylyl cyclase CyaB  26.38 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1326  putative adenylyl cyclase CyaB  29.71 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.422285 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0623  adenylyl cyclase CyaB  24.82 
 
 
169 aa  46.2  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2924  adenylyl cyclase CyaB  24.57 
 
 
180 aa  45.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.880007  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0735  putative adenylyl cyclase CyaB  29.93 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00219376 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3104  putative adenylyl cyclase CyaB  27.65 
 
 
197 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0006  adenylate cyclase  31.62 
 
 
182 aa  45.4  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.136902 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1534  adenylate cyclase  31.54 
 
 
203 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.337716  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1050  putative adenylate cyclase CyaB  26.76 
 
 
185 aa  45.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1537  adenylyl cyclase CyaB  26.06 
 
 
180 aa  45.1  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1114  putative adenylyl cyclase CyaB  29.89 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.643274 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0038  putative adenylyl cyclase CyaB  30.22 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.318646  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0460  adenylate cyclase  30.61 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.43514 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1517  putative adenylyl cyclase CyaB  27.97 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000378541  normal  0.664583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2407  adenylyl cyclase CyaB  25.9 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308065  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0548  adenylate cyclase  32.65 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0530  putative adenylyl cyclase CyaB  24.28 
 
 
187 aa  42.4  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1935  adenylate cyclase  45.16 
 
 
171 aa  42  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00466325  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0075  putative adenylyl cyclase CyaB  30.7 
 
 
176 aa  42  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109831  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1595  adenylyl cyclase CyaB  23.84 
 
 
187 aa  41.6  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0248189  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1326  adenylate cyclase  29.45 
 
 
172 aa  40.8  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0444909  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2820  adenylyl cyclase CyaB  33.33 
 
 
187 aa  41.2  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>