62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1050 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1050  putative adenylate cyclase CyaB  100 
 
 		 185 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3104  putative adenylyl cyclase CyaB  69.66 
 
 		 197 aa  254  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0901  adenylyl cyclase CyaB  69.66 
 
 		 195 aa  254  5e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0875  putative adenylyl cyclase CyaB  69.1 
 
 		 195 aa  254  5e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3461  putative adenylyl cyclase CyaB  69.66 
 
 		 195 aa  253  8e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0910  putative adenylyl cyclase CyaB  69.1 
 
 		 195 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0024  adenylate cyclase  65.56 
 
 		 183 aa  249  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3778  adenylate cyclase CyaB, putative  66.1 
 
 		 194 aa  249  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0940  putative adenylyl cyclase CyaB  63.28 
 
 		 185 aa  237  6.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0842  putative adenylyl cyclase CyaB  68.97 
 
 		 204 aa  231  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.112196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3125  putative adenylyl cyclase CyaB  68.97 
 
 		 204 aa  230  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0814  putative adenylyl cyclase CyaB  68.97 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1665  putative adenylyl cyclase CyaB  59.43 
 
 		 183 aa  228  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1784  putative adenylyl cyclase CyaB  60.34 
 
 		 194 aa  222  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02204  hypothetical protein  56.9 
 
 		 182 aa  212  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1517  putative adenylyl cyclase CyaB  56.42 
 
 		 193 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000378541  normal  0.664583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2407  adenylyl cyclase CyaB  48.86 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1537  adenylyl cyclase CyaB  48.3 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2924  adenylyl cyclase CyaB  48.3 
 
 		 180 aa  177  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.880007  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1350  adenylate cyclase 2  48.86 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0174263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2804  adenylate cyclase, class IV  48.86 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2502  adenylyl cyclase CyaB  48.3 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0623  adenylyl cyclase CyaB  33.75 
 
 		 169 aa  77.4  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0735  putative adenylyl cyclase CyaB  22.86 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00219376 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0805  adenylyl cyclase CyaB  28.34 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.763555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0548  adenylate cyclase  26.55 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1595  adenylyl cyclase CyaB  26.11 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0248189  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0317  putative adenylyl cyclase CyaB  26.11 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal  0.0901791 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2432  adenylyl cyclase CyaB  29.95 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1114  putative adenylyl cyclase CyaB  28.81 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.643274 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0530  putative adenylyl cyclase CyaB  25.56 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0808  putative adenylyl cyclase CyaB  29.92 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0514  adenylyl cyclase CyaB  27.84 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0933  putative adenylyl cyclase CyaB  29.37 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.164628  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1167  adenylyl cyclase CyaB, putative  25.86 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0075  putative adenylyl cyclase CyaB  26.9 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1147  hypothetical protein  27.08 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2305  adenylyl cyclase CyaB  26.01 
 
 		 181 aa  52  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0126885  normal  0.751604 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1326  putative adenylyl cyclase CyaB  29.89 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.422285 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1935  adenylate cyclase  26.16 
 
 		 171 aa  51.2  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00466325  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1229  adenylyl cyclase CyaB  28.66 
 
 		 186 aa  51.2  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0037  adenylate cyclase  27.98 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1526  adenylate cyclase  24.12 
 
 		 176 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0006  adenylate cyclase  28 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.136902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0232  adenylyl cyclase CyaB  26.54 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0631  adenylate cyclase  26.01 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0013  putative adenylate cyclase  24.85 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3919  adenylate cyclase  24.85 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0902  putative adenylyl cyclase CyaB  26.97 
 
 		 187 aa  44.7  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0386  putative adenylyl cyclase CyaB  29.63 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0190069  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0323  adenylyl cyclase CyaB  22.86 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.362109  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2026  adenylate cyclase  26.86 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.836498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2975  adenylate cyclase  26.04 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0080  adenylate cyclase  26.04 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0079  adenylate cyclase  25.28 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0067  adenylyl cyclase CyaB  26.04 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.160565  normal  0.206262 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0071  adenylate cyclase  25.28 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0568  adenylate cyclase  23.86 
 
 		 179 aa  42  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0098  adenylate cyclase  25.38 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3335  adenylate cyclase  23.49 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0056  adenylate cyclase  29.87 
 
 		 172 aa  41.2  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0038  putative adenylyl cyclase CyaB  27.27 
 
 		 180 aa  41.2  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.318646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>