51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1517 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1517  putative adenylyl cyclase CyaB  100 
 
 		 193 aa  403  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000378541  normal  0.664583 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1784  putative adenylyl cyclase CyaB  56.28 
 
 		 194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3778  adenylate cyclase CyaB, putative  54.89 
 
 		 194 aa  219  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1665  putative adenylyl cyclase CyaB  56.18 
 
 		 183 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3104  putative adenylyl cyclase CyaB  55.19 
 
 		 197 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1050  putative adenylate cyclase CyaB  56.42 
 
 		 185 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0940  putative adenylyl cyclase CyaB  54.24 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0024  adenylate cyclase  52.78 
 
 		 183 aa  208  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0875  putative adenylyl cyclase CyaB  53.59 
 
 		 195 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0910  putative adenylyl cyclase CyaB  53.59 
 
 		 195 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3461  putative adenylyl cyclase CyaB  53.59 
 
 		 195 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0901  adenylyl cyclase CyaB  53.59 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02204  hypothetical protein  51.14 
 
 		 182 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0814  putative adenylyl cyclase CyaB  53.19 
 
 		 213 aa  192  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0842  putative adenylyl cyclase CyaB  53.63 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.112196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3125  putative adenylyl cyclase CyaB  53.63 
 
 		 204 aa  191  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2407  adenylyl cyclase CyaB  44.25 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1537  adenylyl cyclase CyaB  44.83 
 
 		 180 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2502  adenylyl cyclase CyaB  44.25 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2924  adenylyl cyclase CyaB  44.25 
 
 		 180 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.880007  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2804  adenylate cyclase, class IV  43.68 
 
 		 179 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1350  adenylate cyclase 2  43.68 
 
 		 179 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0174263 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0623  adenylyl cyclase CyaB  31.03 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0735  putative adenylyl cyclase CyaB  26.14 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00219376 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1114  putative adenylyl cyclase CyaB  29.89 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.643274 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1935  adenylate cyclase  27.66 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00466325  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1167  adenylyl cyclase CyaB, putative  29.33 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2305  adenylyl cyclase CyaB  27.12 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0126885  normal  0.751604 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0548  adenylate cyclase  26.24 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2432  adenylyl cyclase CyaB  31.16 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0805  adenylyl cyclase CyaB  26.42 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.763555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0530  putative adenylyl cyclase CyaB  27.37 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1595  adenylyl cyclase CyaB  27.93 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0248189  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0075  putative adenylyl cyclase CyaB  28.57 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0317  putative adenylyl cyclase CyaB  27.37 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal  0.0901791 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0067  adenylyl cyclase CyaB  31.43 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.160565  normal  0.206262 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0037  adenylate cyclase  29.37 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0933  putative adenylyl cyclase CyaB  26.09 
 
 		 176 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.164628  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1147  hypothetical protein  26.34 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0038  putative adenylyl cyclase CyaB  25.9 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.318646  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1326  putative adenylyl cyclase CyaB  24.86 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.422285 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0006  adenylate cyclase  32.22 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.136902 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0514  adenylyl cyclase CyaB  23.45 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0808  putative adenylyl cyclase CyaB  26.85 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1368  adenylate cyclase  28.1 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.013822  normal  0.61284 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3048  adenylate cyclase  24.11 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.128686  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0631  adenylate cyclase  32.53 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0079  adenylate cyclase  24.29 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0080  adenylate cyclase  25 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0071  adenylate cyclase  24.29 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2975  adenylate cyclase  25 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>