55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0006 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0006  adenylate cyclase  100 
 
 
182 aa  359  1e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.136902 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1229  adenylyl cyclase CyaB  40 
 
 
186 aa  124  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0548  adenylate cyclase  43.26 
 
 
177 aa  124  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0038  putative adenylyl cyclase CyaB  40.56 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.318646  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1114  putative adenylyl cyclase CyaB  38.69 
 
 
176 aa  114  6e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.643274 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0808  putative adenylyl cyclase CyaB  41.52 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1147  hypothetical protein  38.55 
 
 
199 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1167  adenylyl cyclase CyaB, putative  41.95 
 
 
175 aa  105  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0317  putative adenylyl cyclase CyaB  41.44 
 
 
187 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal  0.0901791 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1595  adenylyl cyclase CyaB  41.44 
 
 
187 aa  101  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0248189  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1935  adenylate cyclase  40.12 
 
 
171 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00466325  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0933  putative adenylyl cyclase CyaB  39.44 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.164628  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0735  putative adenylyl cyclase CyaB  33.7 
 
 
184 aa  98.2  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00219376 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0075  putative adenylyl cyclase CyaB  36.72 
 
 
176 aa  97.8  7e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109831  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1326  putative adenylyl cyclase CyaB  37.21 
 
 
175 aa  97.8  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.422285 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0530  putative adenylyl cyclase CyaB  40.33 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2305  adenylyl cyclase CyaB  35.63 
 
 
181 aa  95.5  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0126885  normal  0.751604 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0037  adenylate cyclase  35.06 
 
 
176 aa  94.7  6e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0805  adenylyl cyclase CyaB  32.63 
 
 
200 aa  94.7  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.763555  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0623  adenylyl cyclase CyaB  37.93 
 
 
169 aa  94.7  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0386  putative adenylyl cyclase CyaB  39.56 
 
 
186 aa  93.6  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0190069  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0067  adenylyl cyclase CyaB  35.71 
 
 
176 aa  91.7  6e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.160565  normal  0.206262 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0514  adenylyl cyclase CyaB  37.33 
 
 
181 aa  91.3  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0902  putative adenylyl cyclase CyaB  33.88 
 
 
187 aa  88.2  6e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1572  adenylyl cyclase CyaB  37.93 
 
 
175 aa  86.3  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.845661  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2432  adenylyl cyclase CyaB  35.45 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1668  adenylyl cyclase CyaB  33.86 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1059  adenylate cyclase  32.76 
 
 
180 aa  55.5  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.743648  normal  0.0414409 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3462  adenylyl cyclase CyaB  35.79 
 
 
221 aa  53.9  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0232  adenylyl cyclase CyaB  26.74 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2494  adenylate cyclase  33.33 
 
 
179 aa  52.4  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.262125  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2804  adenylate cyclase, class IV  29.19 
 
 
179 aa  51.6  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1350  adenylate cyclase 2  29.19 
 
 
179 aa  51.6  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0174263 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3125  putative adenylyl cyclase CyaB  30.97 
 
 
204 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0842  putative adenylyl cyclase CyaB  30.97 
 
 
204 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.112196 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1050  putative adenylate cyclase CyaB  28 
 
 
185 aa  48.5  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1665  putative adenylyl cyclase CyaB  31.58 
 
 
183 aa  48.5  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0323  adenylyl cyclase CyaB  37.93 
 
 
172 aa  48.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.362109  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0814  putative adenylyl cyclase CyaB  30.09 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1784  putative adenylyl cyclase CyaB  28.57 
 
 
194 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2502  adenylyl cyclase CyaB  30.87 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0024  adenylate cyclase  29.29 
 
 
183 aa  45.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1648  adenylate cyclase  35.37 
 
 
179 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.175687  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3778  adenylate cyclase CyaB, putative  29.66 
 
 
194 aa  45.1  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0417  adenylate cyclase  30.37 
 
 
169 aa  44.7  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1517  putative adenylyl cyclase CyaB  32.22 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000378541  normal  0.664583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2820  adenylyl cyclase CyaB  26.55 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013513 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3104  putative adenylyl cyclase CyaB  27.97 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2407  adenylyl cyclase CyaB  28.08 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0901  adenylyl cyclase CyaB  26.15 
 
 
195 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0910  putative adenylyl cyclase CyaB  26.15 
 
 
195 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3461  putative adenylyl cyclase CyaB  26.15 
 
 
195 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1537  adenylyl cyclase CyaB  27.84 
 
 
180 aa  41.6  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0875  putative adenylyl cyclase CyaB  28.07 
 
 
195 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2026  adenylate cyclase  28.8 
 
 
207 aa  40.8  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.836498  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>