44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02204 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02204  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  380  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1665  putative adenylyl cyclase CyaB  60.11 
 
 
183 aa  241  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0940  putative adenylyl cyclase CyaB  61.67 
 
 
185 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0024  adenylate cyclase  62.15 
 
 
183 aa  234  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1784  putative adenylyl cyclase CyaB  62.71 
 
 
194 aa  233  9e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3778  adenylate cyclase CyaB, putative  57.95 
 
 
194 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0910  putative adenylyl cyclase CyaB  57.39 
 
 
195 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3461  putative adenylyl cyclase CyaB  57.39 
 
 
195 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0901  adenylyl cyclase CyaB  56.82 
 
 
195 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1050  putative adenylate cyclase CyaB  56.9 
 
 
185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0875  putative adenylyl cyclase CyaB  56.25 
 
 
195 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3104  putative adenylyl cyclase CyaB  57.95 
 
 
197 aa  208  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1517  putative adenylyl cyclase CyaB  51.14 
 
 
193 aa  197  9e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000378541  normal  0.664583 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0842  putative adenylyl cyclase CyaB  58.52 
 
 
204 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.112196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3125  putative adenylyl cyclase CyaB  58.52 
 
 
204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0814  putative adenylyl cyclase CyaB  58.96 
 
 
213 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1350  adenylate cyclase 2  46.55 
 
 
179 aa  168  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0174263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2804  adenylate cyclase, class IV  46.55 
 
 
179 aa  168  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2924  adenylyl cyclase CyaB  43.68 
 
 
180 aa  166  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.880007  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1537  adenylyl cyclase CyaB  44.25 
 
 
180 aa  165  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2407  adenylyl cyclase CyaB  44.83 
 
 
179 aa  164  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308065  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2502  adenylyl cyclase CyaB  42.86 
 
 
179 aa  155  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0933  putative adenylyl cyclase CyaB  29.52 
 
 
176 aa  58.2  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.164628  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1114  putative adenylyl cyclase CyaB  28.92 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.643274 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0735  putative adenylyl cyclase CyaB  25.14 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00219376 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1167  adenylyl cyclase CyaB, putative  24.55 
 
 
175 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0623  adenylyl cyclase CyaB  27.95 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0075  putative adenylyl cyclase CyaB  26.95 
 
 
176 aa  52.4  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109831  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0548  adenylate cyclase  26.16 
 
 
177 aa  51.2  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0805  adenylyl cyclase CyaB  27.89 
 
 
200 aa  49.3  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.763555  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0808  putative adenylyl cyclase CyaB  30.19 
 
 
193 aa  48.1  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0037  adenylate cyclase  25.58 
 
 
176 aa  47  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1368  adenylate cyclase  24.22 
 
 
204 aa  45.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.013822  normal  0.61284 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1326  putative adenylyl cyclase CyaB  25 
 
 
175 aa  45.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.422285 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2305  adenylyl cyclase CyaB  24.53 
 
 
181 aa  45.1  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0126885  normal  0.751604 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1595  adenylyl cyclase CyaB  23.16 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0248189  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0514  adenylyl cyclase CyaB  23.94 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0038  putative adenylyl cyclase CyaB  25.55 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.318646  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0232  adenylyl cyclase CyaB  25 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1935  adenylate cyclase  28.47 
 
 
171 aa  42.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00466325  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0317  putative adenylyl cyclase CyaB  22.6 
 
 
187 aa  42.4  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal  0.0901791 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2432  adenylyl cyclase CyaB  25.39 
 
 
195 aa  42.4  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1147  hypothetical protein  25.13 
 
 
199 aa  42  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0530  putative adenylyl cyclase CyaB  23.16 
 
 
187 aa  41.6  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>