43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2924 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2924  adenylyl cyclase CyaB  100 
 
 
180 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.880007  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1537  adenylyl cyclase CyaB  92.78 
 
 
180 aa  354  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2502  adenylyl cyclase CyaB  70.39 
 
 
179 aa  267  5.9999999999999995e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2407  adenylyl cyclase CyaB  67.04 
 
 
179 aa  258  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308065  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1350  adenylate cyclase 2  52.51 
 
 
179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0174263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2804  adenylate cyclase, class IV  52.51 
 
 
179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1050  putative adenylate cyclase CyaB  48.3 
 
 
185 aa  177  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1665  putative adenylyl cyclase CyaB  48.57 
 
 
183 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3778  adenylate cyclase CyaB, putative  47.98 
 
 
194 aa  167  9e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02204  hypothetical protein  43.68 
 
 
182 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1517  putative adenylyl cyclase CyaB  44.25 
 
 
193 aa  159  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000378541  normal  0.664583 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0024  adenylate cyclase  44.89 
 
 
183 aa  159  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0875  putative adenylyl cyclase CyaB  47.98 
 
 
195 aa  158  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0842  putative adenylyl cyclase CyaB  50.69 
 
 
204 aa  157  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.112196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3125  putative adenylyl cyclase CyaB  50.69 
 
 
204 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0901  adenylyl cyclase CyaB  47.4 
 
 
195 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0910  putative adenylyl cyclase CyaB  47.4 
 
 
195 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3461  putative adenylyl cyclase CyaB  47.4 
 
 
195 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3104  putative adenylyl cyclase CyaB  45.66 
 
 
197 aa  154  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0814  putative adenylyl cyclase CyaB  50.69 
 
 
213 aa  155  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1784  putative adenylyl cyclase CyaB  43.1 
 
 
194 aa  154  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0940  putative adenylyl cyclase CyaB  44.25 
 
 
185 aa  153  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0805  adenylyl cyclase CyaB  28.5 
 
 
200 aa  67  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.763555  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1167  adenylyl cyclase CyaB, putative  30.26 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1326  putative adenylyl cyclase CyaB  29.71 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.422285 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0735  putative adenylyl cyclase CyaB  27.84 
 
 
184 aa  58.9  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00219376 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0514  adenylyl cyclase CyaB  28.09 
 
 
181 aa  56.6  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0623  adenylyl cyclase CyaB  29.89 
 
 
169 aa  55.8  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0317  putative adenylyl cyclase CyaB  25.54 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal  0.0901791 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2305  adenylyl cyclase CyaB  25.99 
 
 
181 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0126885  normal  0.751604 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1595  adenylyl cyclase CyaB  29 
 
 
187 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0248189  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0038  putative adenylyl cyclase CyaB  31.58 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.318646  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0530  putative adenylyl cyclase CyaB  27 
 
 
187 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0933  putative adenylyl cyclase CyaB  27.22 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.164628  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1114  putative adenylyl cyclase CyaB  29.41 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.643274 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0067  adenylyl cyclase CyaB  29.29 
 
 
176 aa  48.9  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.160565  normal  0.206262 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1572  adenylyl cyclase CyaB  28 
 
 
175 aa  49.3  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.845661  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2432  adenylyl cyclase CyaB  25 
 
 
195 aa  48.5  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1648  adenylate cyclase  28.57 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.175687  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1534  adenylate cyclase  27.5 
 
 
203 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.337716  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1229  adenylyl cyclase CyaB  31.52 
 
 
186 aa  42.4  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0548  adenylate cyclase  21.84 
 
 
177 aa  41.2  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0075  putative adenylyl cyclase CyaB  25.93 
 
 
176 aa  41.2  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109831  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>