38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0568 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0568  adenylate cyclase  100 
 
 		 179 aa  360  9e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0631  adenylate cyclase  74.86 
 
 		 179 aa  263  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1526  adenylate cyclase  69.46 
 
 		 176 aa  233  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0056  adenylate cyclase  64.91 
 
 		 172 aa  222  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1262  adenylate cyclase  58.48 
 
 		 172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102777  normal  0.401901 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1326  adenylate cyclase  57.31 
 
 		 172 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0444909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0323  adenylyl cyclase CyaB  57.83 
 
 		 172 aa  194  5.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.362109  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1389  hypothetical protein  53.22 
 
 		 172 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0080  adenylate cyclase  52.94 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0013  putative adenylate cyclase  52.05 
 
 		 178 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0079  adenylate cyclase  50.28 
 
 		 177 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0071  adenylate cyclase  50.28 
 
 		 177 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3919  adenylate cyclase  51.46 
 
 		 178 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3335  adenylate cyclase  52.94 
 
 		 176 aa  164  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3261  adenylate cyclase  51.46 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3999  adenylate cyclase  52.35 
 
 		 176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2929  adenylate cyclase, putative  52.35 
 
 		 176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2988  putative adenylate cyclase  52.35 
 
 		 176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4073  adenylate cyclase  52.35 
 
 		 176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1614  putative adenylate cyclase  52.35 
 
 		 176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3381  putative adenylate cyclase  52.35 
 
 		 176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0204  adenylate cyclase  52.35 
 
 		 176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0098  adenylate cyclase  50.88 
 
 		 177 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0080  adenylate cyclase  50.88 
 
 		 177 aa  160  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2975  adenylate cyclase  50.88 
 
 		 177 aa  160  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3053  adenylate cyclase  50.29 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3048  adenylate cyclase  41.95 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.128686  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1059  adenylate cyclase  33.89 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.743648  normal  0.0414409 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0038  putative adenylyl cyclase CyaB  27.13 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.318646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0548  adenylate cyclase  27.86 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0735  putative adenylyl cyclase CyaB  21.23 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00219376 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1114  putative adenylyl cyclase CyaB  43.84 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.643274 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3778  adenylate cyclase CyaB, putative  26.71 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1167  adenylyl cyclase CyaB, putative  25.99 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0317  putative adenylyl cyclase CyaB  30.88 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal  0.0901791 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1050  putative adenylate cyclase CyaB  23.86 
 
 		 185 aa  42  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0530  putative adenylyl cyclase CyaB  30.88 
 
 		 187 aa  42  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1595  adenylyl cyclase CyaB  29.41 
 
 		 187 aa  41.6  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0248189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>