15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1559 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1559  putative adenylate cyclase  100 
 
 		 187 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0817125  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1352  adenylate cyclase  98.4 
 
 		 187 aa  363  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0910  hypothetical protein  62.32 
 
 		 77 aa  93.2  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.230597  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0779  adenylate cyclase  33.91 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2305  adenylyl cyclase CyaB  25.41 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0126885  normal  0.751604 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1668  adenylyl cyclase CyaB  29.01 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1935  adenylate cyclase  27.27 
 
 		 171 aa  46.2  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00466325  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1431  adenylate cyclase  23.78 
 
 		 213 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.433047  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0805  adenylyl cyclase CyaB  23.78 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.763555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0317  putative adenylyl cyclase CyaB  31.58 
 
 		 187 aa  44.7  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal  0.0901791 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0530  putative adenylyl cyclase CyaB  29.41 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4542  adenylate cyclase  26.26 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0514  adenylyl cyclase CyaB  22.94 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0548  adenylate cyclase  26.88 
 
 		 177 aa  42  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1595  adenylyl cyclase CyaB  28.82 
 
 		 187 aa  41.2  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0248189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>