14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1352 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1352  adenylate cyclase  100 
 
 
187 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294884  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1559  putative adenylate cyclase  98.4 
 
 
187 aa  363  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0817125  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0910  hypothetical protein  62.32 
 
 
77 aa  93.2  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.230597  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0779  adenylate cyclase  34.48 
 
 
176 aa  88.2  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2305  adenylyl cyclase CyaB  25.41 
 
 
181 aa  61.2  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0126885  normal  0.751604 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1668  adenylyl cyclase CyaB  29.77 
 
 
180 aa  49.3  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1935  adenylate cyclase  27.27 
 
 
171 aa  46.2  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00466325  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1431  adenylate cyclase  23.78 
 
 
213 aa  44.7  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.433047  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4542  adenylate cyclase  26.82 
 
 
180 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0548  adenylate cyclase  26.88 
 
 
177 aa  42  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0805  adenylyl cyclase CyaB  23.17 
 
 
200 aa  42  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.763555  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0902  putative adenylyl cyclase CyaB  28.3 
 
 
187 aa  41.6  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0317  putative adenylyl cyclase CyaB  30.99 
 
 
187 aa  42  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal  0.0901791 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0460  adenylate cyclase  22.04 
 
 
225 aa  41.2  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.43514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>