52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2645 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2645  type II secretion system protein  100 
 
 
144 aa  292  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.498872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16140  type II secretion system protein  31.78 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.426793  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0728  hypothetical protein  32.12 
 
 
174 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0727  hypothetical protein  31.21 
 
 
173 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  39.19 
 
 
164 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29520  type II secretion system protein  41.22 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  40.38 
 
 
188 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  44.68 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  44.68 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  44.68 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  31.4 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  32.32 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0692  hypothetical protein  30.5 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  41.67 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  54.29 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0866  hypothetical protein  40.82 
 
 
701 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  50 
 
 
186 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  47.37 
 
 
185 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1030  hypothetical protein  54.05 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.163763 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  32.84 
 
 
175 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  50 
 
 
156 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  42 
 
 
144 aa  41.6  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  33.33 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  44.68 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  51.35 
 
 
201 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  37.14 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  52.78 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  52.63 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  54.05 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  51.35 
 
 
201 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  54.05 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  47.5 
 
 
172 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  30.86 
 
 
172 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  43.24 
 
 
193 aa  40.4  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  30.84 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  37.78 
 
 
163 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  54.84 
 
 
176 aa  40.4  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  26.73 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  54.55 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  32.81 
 
 
155 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  38.1 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  50 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  50 
 
 
144 aa  40  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  61.29 
 
 
168 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  51.43 
 
 
126 aa  40  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  43.24 
 
 
177 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  51.35 
 
 
192 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  50 
 
 
165 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>