26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_29520 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_29520  type II secretion system protein  100 
 
 		 136 aa  273  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16140  type II secretion system protein  40 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.426793  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2645  type II secretion system protein  41.22 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.498872  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  29.9 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  39.22 
 
 		 151 aa  42.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  39.22 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  39.22 
 
 		 151 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  39.22 
 
 		 151 aa  42.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  39.22 
 
 		 151 aa  42.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  43.48 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  32.69 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  39.22 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  43.75 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  40.23 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  35 
 
 		 142 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  33.75 
 
 		 142 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  30.23 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  41.86 
 
 		 150 aa  41.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  41.86 
 
 		 157 aa  41.2  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0391  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.588550000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  41.86 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  25.21 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1300  hypothetical protein  39.53 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4248  general secretion pathway protein G  36.96 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0347967 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  28.28 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1319  secretory protein  32.84 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0113151 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>