More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1933 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1933  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
421 aa  863    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0321  enolase  70.31 
 
 
423 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  58.27 
 
 
429 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  57.48 
 
 
433 aa  499  1e-140  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  57.24 
 
 
429 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0055  enolase  58.51 
 
 
431 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  57.42 
 
 
422 aa  491  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  58.27 
 
 
428 aa  490  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1726  phosphopyruvate hydratase  58.16 
 
 
431 aa  488  1e-137  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000127224  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  58.23 
 
 
429 aa  491  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  57.55 
 
 
428 aa  490  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  60.19 
 
 
434 aa  491  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  57.79 
 
 
429 aa  490  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  59.04 
 
 
433 aa  489  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  57.79 
 
 
429 aa  490  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  57.55 
 
 
428 aa  486  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  57.79 
 
 
429 aa  488  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0949  phosphopyruvate hydratase  57.69 
 
 
433 aa  483  1e-135  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  58.03 
 
 
429 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  58.85 
 
 
430 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  58.03 
 
 
426 aa  482  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  58 
 
 
431 aa  483  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  59.62 
 
 
428 aa  483  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  58.55 
 
 
425 aa  482  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2515  enolase  59.09 
 
 
427 aa  479  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  57.11 
 
 
429 aa  478  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  55.16 
 
 
423 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  57.11 
 
 
429 aa  479  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  56.77 
 
 
431 aa  479  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  56.77 
 
 
431 aa  479  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  57.7 
 
 
425 aa  480  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1614  enolase  60.19 
 
 
426 aa  479  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  56.49 
 
 
428 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  58 
 
 
427 aa  475  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0568  phosphopyruvate hydratase  56.56 
 
 
428 aa  478  1e-133  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.183822  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  57.07 
 
 
431 aa  475  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  57.07 
 
 
431 aa  475  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  57.31 
 
 
431 aa  476  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  57.07 
 
 
431 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  57.07 
 
 
431 aa  475  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0213  phosphopyruvate hydratase  55.13 
 
 
451 aa  476  1e-133  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  58.41 
 
 
428 aa  478  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  57.31 
 
 
431 aa  476  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  57.25 
 
 
427 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5032  enolase  56.53 
 
 
426 aa  474  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  57.89 
 
 
430 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  57.79 
 
 
430 aa  476  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  58.61 
 
 
432 aa  476  1e-133  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  57.07 
 
 
426 aa  474  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  55.37 
 
 
430 aa  471  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_002936  DET0593  phosphopyruvate hydratase  55.85 
 
 
428 aa  474  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  55.53 
 
 
428 aa  471  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0151  enolase  55.16 
 
 
427 aa  473  1e-132  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  56.51 
 
 
428 aa  471  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1424  phosphopyruvate hydratase  56.63 
 
 
424 aa  474  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  57.25 
 
 
427 aa  473  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  55.9 
 
 
424 aa  474  1e-132  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_533  enolase  56.09 
 
 
428 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  57.84 
 
 
427 aa  471  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2093  phosphopyruvate hydratase  57.28 
 
 
416 aa  474  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.470329  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0494  phosphopyruvate hydratase  55.58 
 
 
424 aa  470  1.0000000000000001e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.288428  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  57.04 
 
 
426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  54.44 
 
 
431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0003  enolase  56.14 
 
 
422 aa  468  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  56.27 
 
 
428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  56.94 
 
 
427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3133  enolase  56.22 
 
 
427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00432064  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  55.95 
 
 
435 aa  466  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  54.81 
 
 
427 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  55.77 
 
 
428 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  56.39 
 
 
427 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  56.31 
 
 
433 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2216  phosphopyruvate hydratase  55.4 
 
 
432 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0069  enolase  59.47 
 
 
427 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3132  enolase  58.51 
 
 
426 aa  462  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0229642  normal  0.046336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4616  enolase  56.67 
 
 
427 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  55.02 
 
 
427 aa  462  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1810  phosphopyruvate hydratase  55.99 
 
 
434 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1786  phosphopyruvate hydratase  56.23 
 
 
415 aa  462  1e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.897912  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  56.23 
 
 
431 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1722  phosphopyruvate hydratase  55.18 
 
 
432 aa  464  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1042  phosphopyruvate hydratase  56.76 
 
 
428 aa  464  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06630  enolase  55.24 
 
 
427 aa  462  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2659  phosphopyruvate hydratase  55.66 
 
 
437 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  56.8 
 
 
431 aa  463  1e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0615  phosphopyruvate hydratase  57.04 
 
 
416 aa  464  1e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  57.31 
 
 
431 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  55.37 
 
 
431 aa  460  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1482  phosphopyruvate hydratase  56.43 
 
 
427 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.379573  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2001  phosphopyruvate hydratase  56.23 
 
 
421 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000177738  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0210  phosphopyruvate hydratase  54.81 
 
 
430 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0339  phosphopyruvate hydratase  58.94 
 
 
426 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  57.07 
 
 
431 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  56.51 
 
 
428 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02281  phosphopyruvate hydratase  55.05 
 
 
430 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.879614  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1865  phosphopyruvate hydratase  56.43 
 
 
428 aa  458  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32250  enolase  58.13 
 
 
428 aa  458  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.236497 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  55.53 
 
 
432 aa  461  9.999999999999999e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  56.32 
 
 
429 aa  460  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0200  phosphopyruvate hydratase  55.28 
 
 
416 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.969162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>