More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0339 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0339  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 426 aa  863    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  68.69 
 
 		 427 aa  579  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 429 aa  566  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  65.46 
 
 		 429 aa  567  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1810  phosphopyruvate hydratase  65.94 
 
 		 434 aa  558  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  66.11 
 
 		 429 aa  559  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  66.91 
 
 		 431 aa  558  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  67.22 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  65.62 
 
 		 427 aa  557  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2216  phosphopyruvate hydratase  65.29 
 
 		 432 aa  556  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  66.26 
 
 		 427 aa  554  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3222  phosphopyruvate hydratase  64.66 
 
 		 430 aa  554  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  66.03 
 
 		 429 aa  554  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  65.29 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  64.81 
 
 		 427 aa  551  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  65.38 
 
 		 428 aa  552  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  66.26 
 
 		 429 aa  551  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  65.79 
 
 		 429 aa  553  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  66.26 
 
 		 429 aa  551  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  64.81 
 
 		 428 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  65.38 
 
 		 428 aa  551  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2659  phosphopyruvate hydratase  65.21 
 
 		 437 aa  548  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  65.13 
 
 		 428 aa  549  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  66.02 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  65.94 
 
 		 429 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  63.01 
 
 		 428 aa  546  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  66.18 
 
 		 426 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  64.56 
 
 		 427 aa  547  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  64.9 
 
 		 433 aa  545  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  63.81 
 
 		 430 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  65.14 
 
 		 428 aa  542  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  64.35 
 
 		 430 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  66.02 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  65.29 
 
 		 427 aa  541  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  66.02 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  64.23 
 
 		 431 aa  541  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  64.23 
 
 		 431 aa  541  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  65.78 
 
 		 427 aa  541  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  63.26 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  66.02 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  64.83 
 
 		 430 aa  544  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  63.22 
 
 		 425 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  65.53 
 
 		 427 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  64.22 
 
 		 433 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  63.35 
 
 		 425 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  66.26 
 
 		 427 aa  538  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  63.35 
 
 		 425 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  65.78 
 
 		 427 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  65.78 
 
 		 427 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  65.62 
 
 		 425 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  65.78 
 
 		 427 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1424  phosphopyruvate hydratase  63.46 
 
 		 424 aa  538  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  65.05 
 
 		 427 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  65.78 
 
 		 427 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  65.53 
 
 		 427 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  65.22 
 
 		 429 aa  539  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  63.29 
 
 		 427 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  65.53 
 
 		 427 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  65.62 
 
 		 429 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  64.2 
 
 		 431 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  65.53 
 
 		 427 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  64.2 
 
 		 431 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  64.2 
 
 		 431 aa  535  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  64.44 
 
 		 431 aa  536  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  65.53 
 
 		 427 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  62.86 
 
 		 425 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  65.53 
 
 		 427 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  64.2 
 
 		 431 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  65.53 
 
 		 427 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  65.53 
 
 		 427 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  63.86 
 
 		 427 aa  536  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  61.69 
 
 		 422 aa  535  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  63.35 
 
 		 425 aa  538  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  65.53 
 
 		 427 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  65.53 
 
 		 427 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  61.78 
 
 		 425 aa  536  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  65.38 
 
 		 429 aa  536  1e-151  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  63.22 
 
 		 429 aa  532  1e-150  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  63.68 
 
 		 428 aa  532  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  64.2 
 
 		 431 aa  534  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  65.79 
 
 		 432 aa  533  1e-150  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  64.89 
 
 		 428 aa  532  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0451  phosphopyruvate hydratase  66.91 
 
 		 432 aa  533  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0149  phosphopyruvate hydratase  63.37 
 
 		 426 aa  534  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.1066  normal  0.0543425 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  62.95 
 
 		 433 aa  531  1e-150  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  65.46 
 
 		 426 aa  534  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  64.32 
 
 		 424 aa  533  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1726  phosphopyruvate hydratase  64.44 
 
 		 431 aa  529  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000127224  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2109  phosphopyruvate hydratase  65.3 
 
 		 424 aa  529  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  63.61 
 
 		 426 aa  530  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  64.56 
 
 		 428 aa  528  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  64.73 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  63.5 
 
 		 425 aa  529  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  65.05 
 
 		 427 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  63.37 
 
 		 431 aa  530  1e-149  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  63.46 
 
 		 429 aa  528  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  63.92 
 
 		 433 aa  530  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  65.3 
 
 		 426 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  64.73 
 
 		 429 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1794  phosphopyruvate hydratase  65.54 
 
 		 424 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181517  decreased coverage  0.000641423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>