More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf431 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf431  ribosomal protein L24  100 
 
 
112 aa  222  1e-57  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19921  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  43.01 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  38.89 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17263  Plastid ribosomal protein L24 large ribosomal subunit  43.4 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00177842  decreased coverage  0.00283524 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1118  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  40.54 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  38.94 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17381  50S ribosomal protein L24  40 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1639  50S ribosomal protein L24  40 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17541  50S ribosomal protein L24  40 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  36.28 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  35.85 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  35.85 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  36.7 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  38.32 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  38.32 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4354  ribosomal protein L24  37.86 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283369  normal  0.0433971 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17291  50S ribosomal protein L24  38.18 
 
 
118 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  38.32 
 
 
103 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  38.32 
 
 
103 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  38.32 
 
 
103 aa  62.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  35.65 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  38.32 
 
 
103 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  38.32 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  38.32 
 
 
103 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 
80 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000123735  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0192  50S ribosomal protein L24  42.42 
 
 
80 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0553712  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1966  50S ribosomal protein L24  49.25 
 
 
118 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0365  50S ribosomal protein L24  37.04 
 
 
118 aa  62.8  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.889516  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  38.32 
 
 
103 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  38.32 
 
 
103 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  38.32 
 
 
103 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  38.32 
 
 
103 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  38.32 
 
 
103 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2053  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 
80 aa  62.8  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000596769  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2218  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 
80 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000567909  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  35.85 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  38.38 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  36.7 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  38.05 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  42.05 
 
 
103 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  37.04 
 
 
103 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  38.32 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2570  50S ribosomal protein L24  34.91 
 
 
115 aa  62  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949988  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  37.04 
 
 
106 aa  61.6  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  37.38 
 
 
122 aa  61.6  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  38.32 
 
 
103 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  40.19 
 
 
101 aa  60.8  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3656  50S ribosomal protein L24  41.23 
 
 
105 aa  60.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000160911  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0437  50S ribosomal protein L24  41.28 
 
 
105 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000277232  hitchhiker  0.0000906767 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  32.74 
 
 
107 aa  60.8  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  37.78 
 
 
104 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23131  50S ribosomal protein L24  37.38 
 
 
118 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  39.25 
 
 
101 aa  60.1  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  36.46 
 
 
104 aa  60.1  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16671  50S ribosomal protein L24  37.04 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  33.64 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  37.5 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  37.04 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  36.04 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  36.63 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2412  50S ribosomal protein L24  43.94 
 
 
80 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000749977  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17050  50S ribosomal protein L24  40.78 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000932171  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0500  50S ribosomal protein L24  41.28 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000146538  decreased coverage  0.00101346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1840  50S ribosomal protein L24  43.94 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0647015  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  38.32 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  36.54 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23690  LSU ribosomal protein L24P  33.94 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0826239  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  33.93 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  43.14 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  39.81 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3420  ribosomal protein L24  34.58 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  36.89 
 
 
104 aa  57.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  34.38 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  35.14 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0495  50S ribosomal protein L24  40.37 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000419023  normal  0.0253858 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  35.51 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  41.43 
 
 
100 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  35.56 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  34.58 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0300  50S ribosomal protein L24  42.42 
 
 
80 aa  57.8  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  36.45 
 
 
115 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  36.04 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  38.96 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  36.27 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 
117 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000192817  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  34.23 
 
 
104 aa  57  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0602  50S ribosomal protein L24  35.19 
 
 
101 aa  57  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  35.51 
 
 
103 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0598  ribosomal protein L24  41.57 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  38.89 
 
 
108 aa  57  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2621  50S ribosomal protein L24  38.53 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.199386  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3735  50S ribosomal protein L24  38.53 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000153975  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3057  50S ribosomal protein L24  38.53 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000284312  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3158  50S ribosomal protein L24  38.53 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000569435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3793  50S ribosomal protein L24  38.53 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>