More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6705 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7444  cell cycle protein  92.35 
 
 
379 aa  670    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.727498  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6705  cell cycle protein  100 
 
 
379 aa  754    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2940  cell cycle protein  76.68 
 
 
388 aa  591  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3167  cell cycle protein  76.68 
 
 
388 aa  591  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0456428  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3123  cell cycle protein  76.94 
 
 
388 aa  584  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2357  cell cycle protein  74.87 
 
 
388 aa  559  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0691  cell cycle protein  60.53 
 
 
380 aa  443  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145993  normal  0.313961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3486  cell cycle protein  57.7 
 
 
398 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1993  cell cycle protein  53.53 
 
 
381 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273485  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1050  cell cycle protein  54.26 
 
 
383 aa  393  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00180763  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6175  essential cell division protein (stabilizes FtsZ ring)  55.31 
 
 
383 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.189814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3395  cell cycle protein  54.08 
 
 
381 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1278  cell cycle protein  53.51 
 
 
382 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.959004  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1432  cell division protein FtsW  52.45 
 
 
385 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1389  cell division protein FtsW  52.45 
 
 
385 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1190  cell division protein FtsW  55.11 
 
 
399 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4049  cell division protein FtsW  53.8 
 
 
380 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1743  cell division protein FtsW  52.72 
 
 
386 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0466348  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2892  cell division protein  50.4 
 
 
384 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2420  cell division protein FtsW  53.57 
 
 
382 aa  375  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.737508 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2008  cell division protein FtsW  52.17 
 
 
384 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0298176  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3307  cell cycle protein  53.24 
 
 
383 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2855  cell division protein FtsW  48.93 
 
 
384 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487661 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2595  cell division protein FtsW  48.4 
 
 
384 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2083  cell division protein FtsW  49.2 
 
 
384 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  hitchhiker  0.00100012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0951  cell cycle protein  47.53 
 
 
392 aa  332  5e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215554  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0948  cell division protein FtsW  46.2 
 
 
386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104281  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2079  cell division protein FtsW  47.77 
 
 
375 aa  311  1e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0540467  normal  0.263887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3667  cell division protein FtsW  43.01 
 
 
390 aa  289  6e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249047  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3171  cell cycle protein  43.68 
 
 
387 aa  279  5e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.0069748  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1882  cell cycle protein  42.47 
 
 
410 aa  263  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0681  cell division protein FtsW  41.51 
 
 
389 aa  258  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0184419 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2761  cell cycle protein  42.55 
 
 
395 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.355007  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0062  cell cycle protein  40.27 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2424  putative cell division protein ftsW  42.7 
 
 
388 aa  237  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0439759  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3948  cell cycle protein  40.11 
 
 
405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4496  cell division protein FtsW  42.62 
 
 
389 aa  232  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0692  cell division protein FtsW  41.62 
 
 
388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0782  cell division protein FtsW  41.08 
 
 
388 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18598  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2106  cell division protein FtsW  41.08 
 
 
388 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0394  cell division protein FtsW, putative  35.78 
 
 
371 aa  209  5e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.612635  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1132  cell cycle protein  39.55 
 
 
397 aa  193  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.91568  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0754  cell division protein FtsW  36.1 
 
 
375 aa  170  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.138938  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  33.89 
 
 
363 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  33.15 
 
 
367 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  32.22 
 
 
367 aa  158  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  31.11 
 
 
367 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  31.11 
 
 
367 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  33.71 
 
 
371 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1146  cell division protein FtsW  31.82 
 
 
406 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1276  stage V sporulation protein E  34.67 
 
 
374 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  29.58 
 
 
374 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  31.37 
 
 
368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  31.37 
 
 
368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  31.37 
 
 
368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  31.06 
 
 
368 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  30.56 
 
 
368 aa  151  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  31.82 
 
 
368 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  29.6 
 
 
373 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  31.01 
 
 
374 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2010  stage V sporulation protein E  30.41 
 
 
368 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2788  cell division protein FtsW  34.92 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2203  cell cycle protein FtsW  33.51 
 
 
369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  32.76 
 
 
368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  30.75 
 
 
372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  31.16 
 
 
391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  31.16 
 
 
391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  32.3 
 
 
368 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  33.24 
 
 
368 aa  146  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  34.16 
 
 
364 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2647  cell division protein FtsW  34.29 
 
 
539 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  33.05 
 
 
368 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  32.09 
 
 
368 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  32.22 
 
 
374 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3771  cell division protein FtsW  35.12 
 
 
432 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.351351  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  32.27 
 
 
429 aa  143  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  33.63 
 
 
387 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  31.02 
 
 
368 aa  142  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2851  cell division protein FtsW  31 
 
 
424 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  35.76 
 
 
367 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  33.44 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2430  cell division protein FtsW  31.38 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2474  cell cycle protein  28.42 
 
 
376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3925  cell division protein FtsW  32.6 
 
 
543 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0424202  normal  0.252874 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0166  cell division protein FtsW  32.33 
 
 
423 aa  140  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.582847  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08400  rod shape-determining protein RodA  32.8 
 
 
382 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41497  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  28.8 
 
 
378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0180  cell division protein FtsW  32.6 
 
 
423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.598529  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  32.68 
 
 
374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  30.75 
 
 
368 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  30.79 
 
 
426 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0847  cell division protein FtsW  30.59 
 
 
387 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.830449  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1684  rod shape-determining protein RodA  29.72 
 
 
381 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.199967 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  33.05 
 
 
359 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1251  cell cycle protein  29.16 
 
 
383 aa  138  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.450877  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0635  cell division protein FtsW  29.57 
 
 
414 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.146996  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  31.29 
 
 
373 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3571  cell division protein FtsW  31.2 
 
 
403 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1980  cell division protein FtsW  29.44 
 
 
398 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4220  cell division protein FtsW  30.12 
 
 
403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>