More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0681 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0681  cell division protein FtsW  100 
 
 
389 aa  771    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0184419 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0782  cell division protein FtsW  75 
 
 
388 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18598  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2106  cell division protein FtsW  75 
 
 
388 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2424  putative cell division protein ftsW  69.85 
 
 
388 aa  521  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0439759  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0692  cell division protein FtsW  74.23 
 
 
388 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2761  cell cycle protein  65.98 
 
 
395 aa  507  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.355007  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4496  cell division protein FtsW  70.51 
 
 
389 aa  498  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1389  cell division protein FtsW  46.7 
 
 
385 aa  308  8e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1432  cell division protein FtsW  46.7 
 
 
385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1743  cell division protein FtsW  46.15 
 
 
386 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0466348  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2420  cell division protein FtsW  47.57 
 
 
382 aa  301  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.737508 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2892  cell division protein  46.8 
 
 
384 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1190  cell division protein FtsW  49.18 
 
 
399 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2079  cell division protein FtsW  44.38 
 
 
375 aa  291  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0540467  normal  0.263887 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0951  cell cycle protein  44.75 
 
 
392 aa  287  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215554  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3667  cell division protein FtsW  44.81 
 
 
390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249047  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2083  cell division protein FtsW  45.86 
 
 
384 aa  279  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  hitchhiker  0.00100012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1993  cell cycle protein  42.82 
 
 
381 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273485  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3395  cell cycle protein  42.55 
 
 
381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4049  cell division protein FtsW  43.89 
 
 
380 aa  272  9e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2008  cell division protein FtsW  42.9 
 
 
384 aa  269  8e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0298176  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1050  cell cycle protein  42.82 
 
 
383 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00180763  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6175  essential cell division protein (stabilizes FtsZ ring)  43.35 
 
 
383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.189814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1278  cell cycle protein  42.55 
 
 
382 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.959004  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3486  cell cycle protein  42.08 
 
 
398 aa  265  8e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3307  cell cycle protein  43.09 
 
 
383 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2595  cell division protein FtsW  41.48 
 
 
384 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3167  cell cycle protein  40.11 
 
 
388 aa  259  6e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0456428  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2940  cell cycle protein  40.11 
 
 
388 aa  259  6e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2855  cell division protein FtsW  42.03 
 
 
384 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3123  cell cycle protein  40.39 
 
 
388 aa  256  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0948  cell division protein FtsW  39.78 
 
 
386 aa  255  8e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104281  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3171  cell cycle protein  40.9 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.0069748  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2357  cell cycle protein  40.67 
 
 
388 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7444  cell cycle protein  41.78 
 
 
379 aa  250  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.727498  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0691  cell cycle protein  41.24 
 
 
380 aa  246  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145993  normal  0.313961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6705  cell cycle protein  41.51 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0062  cell cycle protein  38.68 
 
 
387 aa  218  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3948  cell cycle protein  41.69 
 
 
405 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1882  cell cycle protein  38.61 
 
 
410 aa  206  5e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0754  cell division protein FtsW  36.49 
 
 
375 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.138938  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  34.95 
 
 
368 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1132  cell cycle protein  36.24 
 
 
397 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.91568  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0394  cell division protein FtsW, putative  33.97 
 
 
371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.612635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  34.77 
 
 
368 aa  166  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2927  cell division protein FtsW  33.85 
 
 
417 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0957  cell division protein FtsW  33.24 
 
 
394 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.343907 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  31.18 
 
 
367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1146  cell division protein FtsW  31.25 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3925  cell division protein FtsW  33.33 
 
 
543 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0424202  normal  0.252874 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  30.36 
 
 
374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  29.81 
 
 
374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  33.43 
 
 
359 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  33.15 
 
 
363 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1112  cell division protein FtsW  30.11 
 
 
393 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  32.13 
 
 
374 aa  143  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  31.81 
 
 
375 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  33.23 
 
 
373 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  33.98 
 
 
367 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  31.71 
 
 
371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0449  cell division protein FtsW  33.08 
 
 
415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  34.17 
 
 
413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  30.62 
 
 
391 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0177  cell cycle protein  30.35 
 
 
402 aa  140  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.186002 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  34.07 
 
 
420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  30.62 
 
 
391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4012  cell cycle protein  33.79 
 
 
427 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.15873  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0671  cell division protein FtsW  33.24 
 
 
381 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3499  cell cycle protein  34.27 
 
 
387 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00851666  normal  0.20091 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1786  rod shape-determining protein RodA  30.39 
 
 
380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  32.67 
 
 
354 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  33.23 
 
 
372 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2092  cell division protein FtsW  32.45 
 
 
395 aa  137  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2788  cell division protein FtsW  36.29 
 
 
371 aa  137  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0740  cell division protein FtsW  31.28 
 
 
380 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  31.91 
 
 
364 aa  136  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  33.66 
 
 
379 aa  136  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  32.82 
 
 
371 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2495  cell cycle protein  31.98 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  29.38 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0929  putative rod shape determining protein  29.75 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0567  cell cycle protein  31.2 
 
 
389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  31.71 
 
 
374 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0768  cell division protein FtsW  34.81 
 
 
400 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.626093  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08400  rod shape-determining protein RodA  32.72 
 
 
382 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41497  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3771  cell division protein FtsW  32.15 
 
 
432 aa  133  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.351351  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4036  rod shape-determining protein RodA  30.26 
 
 
380 aa  133  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.924124  normal  0.245 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00090  integral membrane protein involved in stabilizing FstZ ring during cell division  30.29 
 
 
414 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3511  cell division protein FtsW  30.29 
 
 
414 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0094  cell division protein FtsW  30.29 
 
 
414 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.251291  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0091  cell division protein FtsW  30.29 
 
 
414 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00890066  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00089  hypothetical protein  30.29 
 
 
414 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3568  cell division protein FtsW  30.29 
 
 
414 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655548 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0097  cell division protein FtsW  30.29 
 
 
414 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.301255  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0095  cell division protein FtsW  30.29 
 
 
414 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.747639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  31.4 
 
 
378 aa  132  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  32.29 
 
 
423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0166  cell division protein FtsW  33.24 
 
 
423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.582847  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6114  cell division protein FtsW  31.14 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309326  normal  0.0125207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3064  cell division protein FtsW  30.39 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>