More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2892 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2892  cell division protein  100 
 
 
384 aa  762    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2595  cell division protein FtsW  77.08 
 
 
384 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2855  cell division protein FtsW  77.34 
 
 
384 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487661 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2083  cell division protein FtsW  77.86 
 
 
384 aa  592  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  hitchhiker  0.00100012 
 
 
-
 
NC_004310  BR1432  cell division protein FtsW  63.86 
 
 
385 aa  491  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1389  cell division protein FtsW  63.59 
 
 
385 aa  489  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1743  cell division protein FtsW  63.04 
 
 
386 aa  488  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0466348  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2008  cell division protein FtsW  60.87 
 
 
384 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0298176  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3486  cell cycle protein  55.5 
 
 
398 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0948  cell division protein FtsW  53.66 
 
 
386 aa  404  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104281  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6175  essential cell division protein (stabilizes FtsZ ring)  54.18 
 
 
383 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.189814 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0691  cell cycle protein  54.57 
 
 
380 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145993  normal  0.313961 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1278  cell cycle protein  53.49 
 
 
382 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.959004  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1050  cell cycle protein  53.49 
 
 
383 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00180763  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3167  cell cycle protein  50.53 
 
 
388 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0456428  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1993  cell cycle protein  53.39 
 
 
381 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273485  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2940  cell cycle protein  50.53 
 
 
388 aa  381  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3395  cell cycle protein  53.39 
 
 
381 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2420  cell division protein FtsW  52.47 
 
 
382 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.737508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2079  cell division protein FtsW  53.48 
 
 
375 aa  376  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0540467  normal  0.263887 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3123  cell cycle protein  50.53 
 
 
388 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4049  cell division protein FtsW  52.57 
 
 
380 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3307  cell cycle protein  52.86 
 
 
383 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7444  cell cycle protein  51.77 
 
 
379 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.727498  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1190  cell division protein FtsW  50.95 
 
 
399 aa  363  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2357  cell cycle protein  50.14 
 
 
388 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6705  cell cycle protein  50.4 
 
 
379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0951  cell cycle protein  46.83 
 
 
392 aa  332  6e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215554  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3667  cell division protein FtsW  47.68 
 
 
390 aa  322  9.000000000000001e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249047  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0681  cell division protein FtsW  46.8 
 
 
389 aa  294  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0184419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2424  putative cell division protein ftsW  44.47 
 
 
388 aa  286  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0439759  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3171  cell cycle protein  43.09 
 
 
387 aa  282  6.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.0069748  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2761  cell cycle protein  43.75 
 
 
395 aa  279  7e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.355007  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2106  cell division protein FtsW  47.28 
 
 
388 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0782  cell division protein FtsW  47.28 
 
 
388 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18598  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0692  cell division protein FtsW  47.55 
 
 
388 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1882  cell cycle protein  40.49 
 
 
410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4496  cell division protein FtsW  45.55 
 
 
389 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3948  cell cycle protein  39.35 
 
 
405 aa  246  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0062  cell cycle protein  38.3 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0394  cell division protein FtsW, putative  38.53 
 
 
371 aa  221  9.999999999999999e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.612635  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1132  cell cycle protein  39.29 
 
 
397 aa  206  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.91568  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2430  cell division protein FtsW  34.13 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0754  cell division protein FtsW  34.75 
 
 
375 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.138938  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0567  cell cycle protein  33.33 
 
 
389 aa  167  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004491  cell division protein FtsW  31.34 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1980  cell division protein FtsW  32.33 
 
 
398 aa  159  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  32.12 
 
 
373 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3812  cell division protein FtsW  31.37 
 
 
405 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  34.88 
 
 
373 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0385  cell division protein FtsW  31.47 
 
 
403 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0110798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3744  cell division protein FtsW  31.47 
 
 
403 aa  158  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000784985 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3571  cell division protein FtsW  31.2 
 
 
403 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2194  cell division protein FtsW  33.24 
 
 
401 aa  157  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.689364  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  32.43 
 
 
371 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  32.3 
 
 
391 aa  156  7e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  32.3 
 
 
391 aa  156  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  32.92 
 
 
373 aa  155  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1146  cell division protein FtsW  31.84 
 
 
406 aa  155  9e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2764  rod shape-determining protein RodA  31.38 
 
 
359 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2203  cell cycle protein FtsW  31.83 
 
 
369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3805  cell division protein FtsW  30.83 
 
 
404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4220  cell division protein FtsW  30.93 
 
 
403 aa  153  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  31.87 
 
 
367 aa  153  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  31.87 
 
 
367 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  31.87 
 
 
367 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00901  hypothetical protein  30.05 
 
 
398 aa  152  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4985  cell division protein FtsW  33.06 
 
 
399 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  31.94 
 
 
368 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57360  cell division protein FtsW  33.06 
 
 
399 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  31.32 
 
 
368 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  31.32 
 
 
368 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0486  cell division protein FtsW  30.67 
 
 
403 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  31.32 
 
 
368 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  31.28 
 
 
368 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  31.32 
 
 
368 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0449  cell division protein FtsW  32.96 
 
 
415 aa  151  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  33.07 
 
 
384 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0601  cell division protein FtsW  32.71 
 
 
441 aa  150  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.190924  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4103  cell cycle protein  35.19 
 
 
404 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.715571 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  31.15 
 
 
413 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3454  cell division protein FtsW  31.3 
 
 
404 aa  150  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0943  cell division protein FtsW  32.13 
 
 
404 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0635  cell division protein FtsW  31.68 
 
 
414 aa  150  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.146996  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2092  cell division protein FtsW  32.81 
 
 
395 aa  149  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2495  cell cycle protein  32.98 
 
 
386 aa  149  7e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2270  cell cycle protein  32.27 
 
 
392 aa  149  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.011941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4409  cell division protein FtsW  34.84 
 
 
404 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309058  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  32.65 
 
 
376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  32.23 
 
 
368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2862  cell cycle protein, FtsW  35.96 
 
 
384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00502116  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0768  cell division protein FtsW  32.58 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.626093  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  31.39 
 
 
363 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  32.68 
 
 
420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  30.77 
 
 
372 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4534  cell division protein FtsW  31.22 
 
 
404 aa  146  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2615  cell division protein FtsW  32.17 
 
 
397 aa  146  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000584566 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  31.77 
 
 
367 aa  146  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  32.92 
 
 
371 aa  146  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4674  cell cycle protein  30.73 
 
 
405 aa  146  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000737984  normal  0.479047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>