More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2083 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2595  cell division protein FtsW  80.73 
 
 		 384 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2855  cell division protein FtsW  80.73 
 
 		 384 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487661 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2083  cell division protein FtsW  100 
 
 		 384 aa  759    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  hitchhiker  0.00100012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2892  cell division protein  77.86 
 
 		 384 aa  615  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1432  cell division protein FtsW  66.85 
 
 		 385 aa  523  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1389  cell division protein FtsW  66.58 
 
 		 385 aa  521  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1743  cell division protein FtsW  67.12 
 
 		 386 aa  520  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0466348  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2008  cell division protein FtsW  63.59 
 
 		 384 aa  481  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0298176  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6175  essential cell division protein (stabilizes FtsZ ring)  55.68 
 
 		 383 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.189814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1993  cell cycle protein  56.37 
 
 		 381 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3395  cell cycle protein  56.64 
 
 		 381 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0948  cell division protein FtsW  53.12 
 
 		 386 aa  411  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104281  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1050  cell cycle protein  54.52 
 
 		 383 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00180763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4049  cell division protein FtsW  56.15 
 
 		 380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1278  cell cycle protein  54.74 
 
 		 382 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.959004  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3486  cell cycle protein  52.91 
 
 		 398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0691  cell cycle protein  51.88 
 
 		 380 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145993  normal  0.313961 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3307  cell cycle protein  55.04 
 
 		 383 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1190  cell division protein FtsW  52.36 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3167  cell cycle protein  47.45 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0456428  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2940  cell cycle protein  47.45 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3123  cell cycle protein  47.99 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2420  cell division protein FtsW  50.55 
 
 		 382 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.737508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2357  cell cycle protein  48.37 
 
 		 388 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7444  cell cycle protein  49.2 
 
 		 379 aa  358  9e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.727498  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2079  cell division protein FtsW  50.7 
 
 		 375 aa  351  1e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0540467  normal  0.263887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6705  cell cycle protein  49.2 
 
 		 379 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0951  cell cycle protein  46.01 
 
 		 392 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215554  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3667  cell division protein FtsW  46.3 
 
 		 390 aa  331  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249047  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3171  cell cycle protein  40.86 
 
 		 387 aa  293  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.0069748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0681  cell division protein FtsW  45.86 
 
 		 389 aa  291  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0184419 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2761  cell cycle protein  42.93 
 
 		 395 aa  273  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.355007  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2424  putative cell division protein ftsW  44.47 
 
 		 388 aa  272  6e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0439759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4496  cell division protein FtsW  44.72 
 
 		 389 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1882  cell cycle protein  38.04 
 
 		 410 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3948  cell cycle protein  37.63 
 
 		 405 aa  245  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0782  cell division protein FtsW  42.89 
 
 		 388 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18598  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2106  cell division protein FtsW  42.89 
 
 		 388 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0692  cell division protein FtsW  42.89 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0062  cell cycle protein  37.63 
 
 		 387 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0394  cell division protein FtsW, putative  38.84 
 
 		 371 aa  227  2e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.612635  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1132  cell cycle protein  40.33 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.91568  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1980  cell division protein FtsW  32.69 
 
 		 398 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3812  cell division protein FtsW  33.05 
 
 		 405 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2430  cell division protein FtsW  33.94 
 
 		 398 aa  171  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0754  cell division protein FtsW  34.44 
 
 		 375 aa  170  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.138938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004491  cell division protein FtsW  32.21 
 
 		 398 aa  169  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4220  cell division protein FtsW  33.52 
 
 		 403 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3571  cell division protein FtsW  33.8 
 
 		 403 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0385  cell division protein FtsW  33.8 
 
 		 403 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0110798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3744  cell division protein FtsW  33.8 
 
 		 403 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000784985 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0567  cell cycle protein  31.81 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3805  cell division protein FtsW  32.87 
 
 		 404 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2495  cell cycle protein  33.42 
 
 		 386 aa  166  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0486  cell division protein FtsW  32.69 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00901  hypothetical protein  31.65 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4534  cell division protein FtsW  31.37 
 
 		 404 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  32.1 
 
 		 391 aa  162  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  32.1 
 
 		 391 aa  162  7e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0353  cell division protein FtsW  31.51 
 
 		 402 aa  162  7e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000708854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  32.29 
 
 		 373 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4466  cell division protein FtsW  30.79 
 
 		 437 aa  159  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3454  cell division protein FtsW  33.06 
 
 		 404 aa  159  9e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477404 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0354  phosphopantetheine attachment site  31.75 
 
 		 404 aa  159  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2203  cell cycle protein FtsW  31.71 
 
 		 369 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  30.81 
 
 		 373 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0426  cell division protein FtsW  33.05 
 
 		 403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  31.48 
 
 		 373 aa  156  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1146  cell division protein FtsW  31.55 
 
 		 406 aa  155  9e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0412  cell division protein FtsW  32.77 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0401  cell division protein FtsW  32.77 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0400  cell division protein FtsW  32.77 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  35.11 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0601  cell division protein FtsW  33.94 
 
 		 441 aa  153  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.190924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2270  cell cycle protein  32.19 
 
 		 392 aa  153  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.011941 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  29.04 
 
 		 374 aa  152  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  31.51 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0409  cell division protein FtsW  31.65 
 
 		 410 aa  149  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146554 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4985  cell division protein FtsW  32.21 
 
 		 399 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57360  cell division protein FtsW  32.21 
 
 		 399 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  29.08 
 
 		 368 aa  149  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  32.3 
 
 		 371 aa  149  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0222  cell division protein FtsW  32.63 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  30.81 
 
 		 373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1974  cell division protein  32.84 
 
 		 372 aa  149  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  30.41 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2645  cell division protein FtsW  31.82 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  30.29 
 
 		 371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  30.03 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  30.03 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  30.03 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004223  rod shape-determining protein RodA  31.09 
 
 		 373 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000217373  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  29.49 
 
 		 368 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  29.49 
 
 		 368 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  29.49 
 
 		 368 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  29.49 
 
 		 368 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  32.03 
 
 		 364 aa  146  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0647  cell division protein FtsW  32.45 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159842  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  29.3 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>