More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4049 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_1993  cell cycle protein  92.72 
 
 
381 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273485  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4049  cell division protein FtsW  100 
 
 
380 aa  748    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3395  cell cycle protein  91.37 
 
 
381 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1278  cell cycle protein  81.41 
 
 
382 aa  608  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.959004  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6175  essential cell division protein (stabilizes FtsZ ring)  83.07 
 
 
383 aa  591  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.189814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3307  cell cycle protein  85.12 
 
 
383 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1050  cell cycle protein  80.59 
 
 
383 aa  590  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00180763  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1190  cell division protein FtsW  62.83 
 
 
399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1743  cell division protein FtsW  57.29 
 
 
386 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0466348  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1432  cell division protein FtsW  56.61 
 
 
385 aa  437  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1389  cell division protein FtsW  56.35 
 
 
385 aa  435  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3167  cell cycle protein  55.16 
 
 
388 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0456428  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2940  cell cycle protein  55.16 
 
 
388 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3486  cell cycle protein  57.71 
 
 
398 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3123  cell cycle protein  55.43 
 
 
388 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2357  cell cycle protein  54.5 
 
 
388 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2008  cell division protein FtsW  59.62 
 
 
384 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0298176  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2083  cell division protein FtsW  56.15 
 
 
384 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  hitchhiker  0.00100012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0691  cell cycle protein  56.42 
 
 
380 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145993  normal  0.313961 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2855  cell division protein FtsW  53.91 
 
 
384 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487661 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2595  cell division protein FtsW  54.18 
 
 
384 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2892  cell division protein  52.57 
 
 
384 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7444  cell cycle protein  53.53 
 
 
379 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.727498  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2420  cell division protein FtsW  53.56 
 
 
382 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.737508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6705  cell cycle protein  53.8 
 
 
379 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0948  cell division protein FtsW  50.54 
 
 
386 aa  380  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104281  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2079  cell division protein FtsW  49.58 
 
 
375 aa  347  2e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0540467  normal  0.263887 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0951  cell cycle protein  48.23 
 
 
392 aa  345  6e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215554  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3667  cell division protein FtsW  47.45 
 
 
390 aa  339  5e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249047  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3171  cell cycle protein  45.88 
 
 
387 aa  312  6.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.0069748  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0681  cell division protein FtsW  43.48 
 
 
389 aa  296  3e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0184419 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2761  cell cycle protein  40.88 
 
 
395 aa  271  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.355007  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2424  putative cell division protein ftsW  43.36 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0439759  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0692  cell division protein FtsW  42.98 
 
 
388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0062  cell cycle protein  43.01 
 
 
387 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2106  cell division protein FtsW  43.53 
 
 
388 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0782  cell division protein FtsW  43.53 
 
 
388 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18598  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1882  cell cycle protein  40.11 
 
 
410 aa  247  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3948  cell cycle protein  39.89 
 
 
405 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4496  cell division protein FtsW  43.09 
 
 
389 aa  239  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0394  cell division protein FtsW, putative  38.42 
 
 
371 aa  216  5e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.612635  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1132  cell cycle protein  40.5 
 
 
397 aa  214  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.91568  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0754  cell division protein FtsW  35.25 
 
 
375 aa  184  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.138938  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4985  cell division protein FtsW  37.54 
 
 
399 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57360  cell division protein FtsW  37.54 
 
 
399 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3805  cell division protein FtsW  30.65 
 
 
404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00901  hypothetical protein  32.6 
 
 
398 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4220  cell division protein FtsW  29.58 
 
 
403 aa  170  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004491  cell division protein FtsW  31.38 
 
 
398 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3812  cell division protein FtsW  30.27 
 
 
405 aa  169  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1974  cell division protein  32.88 
 
 
372 aa  169  9e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0222  cell division protein FtsW  32.6 
 
 
372 aa  168  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2645  cell division protein FtsW  31.72 
 
 
400 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0486  cell division protein FtsW  28.8 
 
 
403 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0385  cell division protein FtsW  28.8 
 
 
403 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0110798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3744  cell division protein FtsW  28.8 
 
 
403 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000784985 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  32.45 
 
 
391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  32.45 
 
 
391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1146  cell division protein FtsW  31.65 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3571  cell division protein FtsW  28.8 
 
 
403 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0353  cell division protein FtsW  29.7 
 
 
402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000708854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4534  cell division protein FtsW  28.57 
 
 
404 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0943  cell division protein FtsW  35.57 
 
 
404 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1980  cell division protein FtsW  29.64 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3454  cell division protein FtsW  30.81 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477404 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0354  phosphopantetheine attachment site  30.62 
 
 
404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  33.15 
 
 
375 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  33.33 
 
 
374 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2430  cell division protein FtsW  33.51 
 
 
398 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2495  cell cycle protein  34.97 
 
 
386 aa  160  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  32.87 
 
 
363 aa  159  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4466  cell division protein FtsW  33.07 
 
 
437 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0426  cell division protein FtsW  29.06 
 
 
403 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  29.78 
 
 
374 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0412  cell division protein FtsW  29.06 
 
 
403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0400  cell division protein FtsW  29.06 
 
 
403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0401  cell division protein FtsW  29.06 
 
 
403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4674  cell cycle protein  32.39 
 
 
405 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000737984  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4513  cell division protein FtsW  35.57 
 
 
404 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.444721  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  31.94 
 
 
368 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0409  cell division protein FtsW  29.08 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146554 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2191  cell cycle protein  35.54 
 
 
394 aa  154  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.506626  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3520  cell division protein FtsW  30.54 
 
 
487 aa  153  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0921  cell division protein FtsW  36.03 
 
 
402 aa  153  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.524737  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  33.61 
 
 
359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2092  cell division protein FtsW  33.7 
 
 
395 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  32.23 
 
 
368 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  32.56 
 
 
354 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1336  cell division protein FtsW  35.29 
 
 
404 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.820801  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0601  cell division protein FtsW  31.64 
 
 
441 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.190924  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4388  cell division protein FtsW  35.29 
 
 
404 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.503964  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2202  cell division protein FtsW  34.68 
 
 
400 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244408  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2203  cell cycle protein FtsW  31.89 
 
 
369 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0567  cell cycle protein  31.61 
 
 
389 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  30.28 
 
 
374 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0703  cell cycle protein FtsW  28.31 
 
 
407 aa  149  8e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0180  cell division protein FtsW  33.42 
 
 
423 aa  149  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.598529  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2342  cell cycle protein  32.52 
 
 
398 aa  149  8e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0760  cell division protein FtsW  30.75 
 
 
400 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682655  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03259  cell division protein FtsW  31.45 
 
 
470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>