More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2940 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2357  cell cycle protein  85.05 
 
 		 388 aa  657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3167  cell cycle protein  100 
 
 		 388 aa  780    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0456428  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2940  cell cycle protein  100 
 
 		 388 aa  780    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3123  cell cycle protein  97.42 
 
 		 388 aa  757    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7444  cell cycle protein  78.02 
 
 		 379 aa  567  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.727498  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6705  cell cycle protein  76.68 
 
 		 379 aa  551  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0691  cell cycle protein  60.85 
 
 		 380 aa  448  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145993  normal  0.313961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3486  cell cycle protein  59.44 
 
 		 398 aa  450  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6175  essential cell division protein (stabilizes FtsZ ring)  55.41 
 
 		 383 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.189814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1993  cell cycle protein  54.62 
 
 		 381 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1278  cell cycle protein  54.89 
 
 		 382 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.959004  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1190  cell division protein FtsW  52.71 
 
 		 399 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4049  cell division protein FtsW  55.16 
 
 		 380 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1050  cell cycle protein  54.08 
 
 		 383 aa  394  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00180763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1389  cell division protein FtsW  52.65 
 
 		 385 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1432  cell division protein FtsW  52.65 
 
 		 385 aa  391  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1743  cell division protein FtsW  51.94 
 
 		 386 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0466348  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3395  cell cycle protein  55.16 
 
 		 381 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2892  cell division protein  50.53 
 
 		 384 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2420  cell division protein FtsW  52 
 
 		 382 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.737508 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3307  cell cycle protein  54.22 
 
 		 383 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2008  cell division protein FtsW  50.93 
 
 		 384 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0298176  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2855  cell division protein FtsW  48.18 
 
 		 384 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487661 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2595  cell division protein FtsW  47.66 
 
 		 384 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2083  cell division protein FtsW  47.45 
 
 		 384 aa  355  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  hitchhiker  0.00100012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0951  cell cycle protein  49.31 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215554  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0948  cell division protein FtsW  47.35 
 
 		 386 aa  348  1e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104281  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2079  cell division protein FtsW  47.41 
 
 		 375 aa  322  5e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0540467  normal  0.263887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3667  cell division protein FtsW  43.56 
 
 		 390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249047  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3171  cell cycle protein  45.48 
 
 		 387 aa  295  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.0069748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1882  cell cycle protein  42.67 
 
 		 410 aa  271  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0062  cell cycle protein  40.58 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0681  cell division protein FtsW  40.11 
 
 		 389 aa  259  6e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0184419 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2761  cell cycle protein  40.5 
 
 		 395 aa  253  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.355007  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3948  cell cycle protein  41.58 
 
 		 405 aa  243  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4496  cell division protein FtsW  42.51 
 
 		 389 aa  239  8e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0692  cell division protein FtsW  41.19 
 
 		 388 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2424  putative cell division protein ftsW  41.03 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0439759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0782  cell division protein FtsW  40.22 
 
 		 388 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18598  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2106  cell division protein FtsW  40.22 
 
 		 388 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0394  cell division protein FtsW, putative  33.94 
 
 		 371 aa  194  3e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.612635  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1132  cell cycle protein  43.23 
 
 		 397 aa  193  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.91568  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  32.12 
 
 		 374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2203  cell cycle protein FtsW  36.14 
 
 		 369 aa  173  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0754  cell division protein FtsW  35.13 
 
 		 375 aa  173  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.138938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  34.79 
 
 		 363 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  34.64 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  33.82 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  31.59 
 
 		 368 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1146  cell division protein FtsW  32.8 
 
 		 406 aa  163  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  27.01 
 
 		 378 aa  163  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  31.78 
 
 		 373 aa  163  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  33.14 
 
 		 368 aa  162  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  32.52 
 
 		 509 aa  160  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  32.23 
 
 		 367 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  30.36 
 
 		 374 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  31.15 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  31.15 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  33.85 
 
 		 375 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  31.15 
 
 		 368 aa  158  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  31.15 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  30.64 
 
 		 367 aa  158  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  33.53 
 
 		 374 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  31.15 
 
 		 368 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  32.4 
 
 		 368 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  30.64 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  30.64 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  29.89 
 
 		 368 aa  156  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  34.37 
 
 		 359 aa  155  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  30.75 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  31.15 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  32 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  32.88 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  30.85 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08400  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41497  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  30.53 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  30.75 
 
 		 373 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  34.06 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2202  cell division protein FtsW  34.39 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244408  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  32 
 
 		 391 aa  154  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  37.38 
 
 		 367 aa  153  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  32.52 
 
 		 385 aa  153  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  32.88 
 
 		 420 aa  152  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0177  cell cycle protein  31.27 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186002 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2645  cell division protein FtsW  30.08 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2430  cell division protein FtsW  32.22 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  29.81 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2010  stage V sporulation protein E  32.31 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 376 aa  150  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3771  cell division protein FtsW  34.1 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  29.61 
 
 		 369 aa  150  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5099  cell division protein FtsW  34.14 
 
 		 474 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102633  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  34.59 
 
 		 364 aa  149  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3925  cell division protein FtsW  30.42 
 
 		 543 aa  149  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0424202  normal  0.252874 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0222  cell division protein FtsW  32.42 
 
 		 372 aa  149  9e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  32.41 
 
 		 387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2837  cell division protein FtsW  33.82 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  29.91 
 
 		 368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  33.33 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2674  cell division protein FtsW  33.15 
 
 		 427 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>