More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3307 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3307  cell cycle protein  100 
 
 		 383 aa  755    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1278  cell cycle protein  86.16 
 
 		 382 aa  634    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.959004  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1993  cell cycle protein  87.33 
 
 		 381 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1050  cell cycle protein  84.07 
 
 		 383 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00180763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6175  essential cell division protein (stabilizes FtsZ ring)  84.07 
 
 		 383 aa  606  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.189814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3395  cell cycle protein  86.25 
 
 		 381 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4049  cell division protein FtsW  85.12 
 
 		 380 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1190  cell division protein FtsW  65.94 
 
 		 399 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1743  cell division protein FtsW  57.84 
 
 		 386 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0466348  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1432  cell division protein FtsW  55.29 
 
 		 385 aa  425  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1389  cell division protein FtsW  55.03 
 
 		 385 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3486  cell cycle protein  56.76 
 
 		 398 aa  420  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3123  cell cycle protein  54.08 
 
 		 388 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2940  cell cycle protein  54.08 
 
 		 388 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2008  cell division protein FtsW  59.13 
 
 		 384 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0298176  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3167  cell cycle protein  54.08 
 
 		 388 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0456428  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2595  cell division protein FtsW  54.3 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2855  cell division protein FtsW  54.03 
 
 		 384 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487661 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2357  cell cycle protein  54.21 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0691  cell cycle protein  55.21 
 
 		 380 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145993  normal  0.313961 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2083  cell division protein FtsW  55.04 
 
 		 384 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  hitchhiker  0.00100012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2420  cell division protein FtsW  56.87 
 
 		 382 aa  402  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.737508 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2892  cell division protein  52.15 
 
 		 384 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7444  cell cycle protein  51.59 
 
 		 379 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.727498  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0948  cell division protein FtsW  50 
 
 		 386 aa  375  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104281  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6705  cell cycle protein  52.38 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2079  cell division protein FtsW  49.01 
 
 		 375 aa  344  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0540467  normal  0.263887 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0951  cell cycle protein  47.68 
 
 		 392 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215554  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3667  cell division protein FtsW  47.12 
 
 		 390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249047  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3171  cell cycle protein  44.23 
 
 		 387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.0069748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0681  cell division protein FtsW  43.09 
 
 		 389 aa  291  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0184419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2424  putative cell division protein ftsW  42.2 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0439759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0062  cell cycle protein  40.69 
 
 		 387 aa  253  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2761  cell cycle protein  38.78 
 
 		 395 aa  253  6e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.355007  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0692  cell division protein FtsW  44.08 
 
 		 388 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2106  cell division protein FtsW  44.35 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0782  cell division protein FtsW  44.35 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18598  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1882  cell cycle protein  39.63 
 
 		 410 aa  241  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4496  cell division protein FtsW  43.32 
 
 		 389 aa  235  9e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3948  cell cycle protein  39.35 
 
 		 405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1132  cell cycle protein  40.38 
 
 		 397 aa  215  8e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.91568  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0394  cell division protein FtsW, putative  37.2 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.612635  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0754  cell division protein FtsW  33.52 
 
 		 375 aa  178  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.138938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3805  cell division protein FtsW  32.65 
 
 		 404 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3812  cell division protein FtsW  31.17 
 
 		 405 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0486  cell division protein FtsW  31.94 
 
 		 403 aa  172  9e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  34.39 
 
 		 391 aa  170  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  34.39 
 
 		 391 aa  170  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4985  cell division protein FtsW  35.69 
 
 		 399 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57360  cell division protein FtsW  35.69 
 
 		 399 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1980  cell division protein FtsW  31.78 
 
 		 398 aa  169  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004491  cell division protein FtsW  32.17 
 
 		 398 aa  169  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0222  cell division protein FtsW  32.96 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1974  cell division protein  33.15 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3571  cell division protein FtsW  32.04 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0385  cell division protein FtsW  31.39 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0110798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3744  cell division protein FtsW  31.39 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000784985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4534  cell division protein FtsW  32.46 
 
 		 404 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4220  cell division protein FtsW  31.77 
 
 		 403 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2645  cell division protein FtsW  32.62 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1146  cell division protein FtsW  31.32 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  35.2 
 
 		 359 aa  163  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0354  phosphopantetheine attachment site  30.99 
 
 		 404 aa  162  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00901  hypothetical protein  31.62 
 
 		 398 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3454  cell division protein FtsW  32.47 
 
 		 404 aa  162  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  32.49 
 
 		 368 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0353  cell division protein FtsW  30.38 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000708854 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0166  cell division protein FtsW  33.25 
 
 		 423 aa  158  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.582847  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  32.39 
 
 		 374 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2430  cell division protein FtsW  31.66 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  32.21 
 
 		 375 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0567  cell cycle protein  33.24 
 
 		 389 aa  158  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  32.21 
 
 		 368 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0943  cell division protein FtsW  34.93 
 
 		 404 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  32.59 
 
 		 363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0180  cell division protein FtsW  32.41 
 
 		 423 aa  156  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.598529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0409  cell division protein FtsW  31.2 
 
 		 410 aa  155  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146554 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0601  cell division protein FtsW  31.64 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.190924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0426  cell division protein FtsW  30.81 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0921  cell division protein FtsW  35.15 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.524737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  32.95 
 
 		 354 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2203  cell cycle protein FtsW  33.7 
 
 		 369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2495  cell cycle protein  32.95 
 
 		 386 aa  153  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00090  integral membrane protein involved in stabilizing FstZ ring during cell division  32.56 
 
 		 414 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3511  cell division protein FtsW  32.56 
 
 		 414 aa  152  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0400  cell division protein FtsW  30.81 
 
 		 403 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0401  cell division protein FtsW  30.81 
 
 		 403 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0095  cell division protein FtsW  32.56 
 
 		 414 aa  152  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.747639  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0094  cell division protein FtsW  32.56 
 
 		 414 aa  152  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.251291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0097  cell division protein FtsW  32.56 
 
 		 414 aa  152  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.301255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0412  cell division protein FtsW  30.81 
 
 		 403 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3568  cell division protein FtsW  32.56 
 
 		 414 aa  152  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655548 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0091  cell division protein FtsW  32.56 
 
 		 414 aa  152  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00890066  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00089  hypothetical protein  32.56 
 
 		 414 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0703  cell cycle protein FtsW  31.08 
 
 		 407 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2615  cell division protein FtsW  31.98 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000584566 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0847  cell division protein FtsW  32.89 
 
 		 387 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.830449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0760  cell division protein FtsW  32.14 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2342  cell cycle protein  30.62 
 
 		 398 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2191  cell cycle protein  34.32 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.506626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>