More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0951 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0951  cell cycle protein  100 
 
 
392 aa  770    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215554  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3171  cell cycle protein  52.43 
 
 
387 aa  362  9e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.0069748  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2420  cell division protein FtsW  54.27 
 
 
382 aa  359  4e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.737508 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2940  cell cycle protein  49.31 
 
 
388 aa  351  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3167  cell cycle protein  49.31 
 
 
388 aa  351  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0456428  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1389  cell division protein FtsW  45.8 
 
 
385 aa  350  2e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1432  cell division protein FtsW  45.8 
 
 
385 aa  350  3e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1743  cell division protein FtsW  46.22 
 
 
386 aa  347  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0466348  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3123  cell cycle protein  50.14 
 
 
388 aa  347  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1190  cell division protein FtsW  51.92 
 
 
399 aa  344  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2008  cell division protein FtsW  50.27 
 
 
384 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0298176  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3486  cell cycle protein  47.85 
 
 
398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1278  cell cycle protein  48.23 
 
 
382 aa  333  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.959004  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2079  cell division protein FtsW  47.9 
 
 
375 aa  333  3e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0540467  normal  0.263887 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6175  essential cell division protein (stabilizes FtsZ ring)  47.96 
 
 
383 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.189814 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2892  cell division protein  46.83 
 
 
384 aa  332  6e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2357  cell cycle protein  47.93 
 
 
388 aa  329  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1050  cell cycle protein  47.14 
 
 
383 aa  327  3e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00180763  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0691  cell cycle protein  47.28 
 
 
380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145993  normal  0.313961 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2083  cell division protein FtsW  46.01 
 
 
384 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  hitchhiker  0.00100012 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2595  cell division protein FtsW  45.73 
 
 
384 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1993  cell cycle protein  47.96 
 
 
381 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273485  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7444  cell cycle protein  47.38 
 
 
379 aa  322  8e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.727498  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2855  cell division protein FtsW  45.6 
 
 
384 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487661 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0062  cell cycle protein  47.71 
 
 
387 aa  316  5e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3395  cell cycle protein  47.41 
 
 
381 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4049  cell division protein FtsW  48.23 
 
 
380 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3307  cell cycle protein  47.68 
 
 
383 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3667  cell division protein FtsW  45.08 
 
 
390 aa  312  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249047  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6705  cell cycle protein  47.53 
 
 
379 aa  305  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0948  cell division protein FtsW  41.76 
 
 
386 aa  300  4e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104281  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0681  cell division protein FtsW  44.75 
 
 
389 aa  287  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0184419 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2761  cell cycle protein  43.75 
 
 
395 aa  281  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.355007  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1882  cell cycle protein  41.22 
 
 
410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2424  putative cell division protein ftsW  45.48 
 
 
388 aa  257  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0439759  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3948  cell cycle protein  42.32 
 
 
405 aa  253  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0692  cell division protein FtsW  42.51 
 
 
388 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0782  cell division protein FtsW  43.05 
 
 
388 aa  235  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18598  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2106  cell division protein FtsW  43.05 
 
 
388 aa  235  8e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4496  cell division protein FtsW  43.75 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1132  cell cycle protein  39.94 
 
 
397 aa  209  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.91568  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0394  cell division protein FtsW, putative  35.88 
 
 
371 aa  202  9e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.612635  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0754  cell division protein FtsW  36.81 
 
 
375 aa  195  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.138938  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3812  cell division protein FtsW  35.36 
 
 
405 aa  172  9e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4534  cell division protein FtsW  34.16 
 
 
404 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0847  cell division protein FtsW  34.05 
 
 
387 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.830449  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3571  cell division protein FtsW  34.47 
 
 
403 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4220  cell division protein FtsW  33.94 
 
 
403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0385  cell division protein FtsW  34.47 
 
 
403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0110798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3744  cell division protein FtsW  34.47 
 
 
403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000784985 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004491  cell division protein FtsW  33.33 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1980  cell division protein FtsW  32.14 
 
 
398 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0486  cell division protein FtsW  33.42 
 
 
403 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1974  cell division protein  35.82 
 
 
372 aa  162  7e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0957  cell division protein FtsW  35 
 
 
394 aa  162  9e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.343907 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0222  cell division protein FtsW  36.5 
 
 
372 aa  161  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0139  cell division protein FtsW  34 
 
 
414 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.571731  hitchhiker  0.000000336901 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0136  cell division protein FtsW  34 
 
 
414 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0139  cell division protein FtsW  34 
 
 
414 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.919378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0143  cell division protein FtsW  34 
 
 
414 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.247505 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00901  hypothetical protein  32.43 
 
 
398 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0144  cell division protein FtsW  34 
 
 
414 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0378146  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1146  cell division protein FtsW  30.31 
 
 
406 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0409  cell division protein FtsW  34.34 
 
 
410 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146554 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0635  cell division protein FtsW  35.04 
 
 
414 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.146996  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  32.49 
 
 
371 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  31.84 
 
 
363 aa  160  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4466  cell division protein FtsW  32.48 
 
 
437 aa  159  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00090  integral membrane protein involved in stabilizing FstZ ring during cell division  34.65 
 
 
414 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3511  cell division protein FtsW  34.65 
 
 
414 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0095  cell division protein FtsW  34.65 
 
 
414 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.747639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0091  cell division protein FtsW  34.65 
 
 
414 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00890066  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00089  hypothetical protein  34.65 
 
 
414 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0094  cell division protein FtsW  34.65 
 
 
414 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.251291  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3568  cell division protein FtsW  34.65 
 
 
414 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655548 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0097  cell division protein FtsW  34.65 
 
 
414 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.301255  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3454  cell division protein FtsW  32.33 
 
 
404 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477404 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0180  cell division protein FtsW  36.96 
 
 
423 aa  158  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.598529  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3805  cell division protein FtsW  33.15 
 
 
404 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4569  cell division protein FtsW  34.06 
 
 
418 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0082  cell division protein FtsW  34.93 
 
 
414 aa  157  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  30.62 
 
 
374 aa  155  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  33.15 
 
 
368 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  33.51 
 
 
391 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0354  phosphopantetheine attachment site  34.24 
 
 
404 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  34.29 
 
 
368 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  33.51 
 
 
391 aa  155  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3428  cell division protein FtsW  37.61 
 
 
409 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  31.51 
 
 
368 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1112  cell division protein FtsW  31.75 
 
 
393 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0166  cell division protein FtsW  34.41 
 
 
423 aa  155  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.582847  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  32.78 
 
 
509 aa  154  4e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2645  cell division protein FtsW  32.12 
 
 
400 aa  154  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3499  cell cycle protein  34.62 
 
 
387 aa  153  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00851666  normal  0.20091 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  35.71 
 
 
354 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0740  cell division protein FtsW  33.73 
 
 
380 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0760  cell division protein FtsW  33.06 
 
 
400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682655  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0820  cell division protein FtsW  32.79 
 
 
427 aa  152  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.671328 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  29.25 
 
 
374 aa  152  8e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  30.24 
 
 
378 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>