More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1278 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1050  cell cycle protein  92.69 
 
 
383 aa  657    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00180763  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1278  cell cycle protein  100 
 
 
382 aa  755    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.959004  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3307  cell cycle protein  86.16 
 
 
383 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1993  cell cycle protein  83.29 
 
 
381 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273485  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3395  cell cycle protein  84.1 
 
 
381 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6175  essential cell division protein (stabilizes FtsZ ring)  81.96 
 
 
383 aa  584  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.189814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4049  cell division protein FtsW  81.41 
 
 
380 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1190  cell division protein FtsW  64.48 
 
 
399 aa  455  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1743  cell division protein FtsW  58.11 
 
 
386 aa  438  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0466348  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1432  cell division protein FtsW  57.3 
 
 
385 aa  432  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1389  cell division protein FtsW  57.3 
 
 
385 aa  432  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3486  cell cycle protein  56.43 
 
 
398 aa  423  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2855  cell division protein FtsW  55.11 
 
 
384 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487661 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2940  cell cycle protein  54.89 
 
 
388 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2595  cell division protein FtsW  55.11 
 
 
384 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3167  cell cycle protein  54.89 
 
 
388 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0456428  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3123  cell cycle protein  55.43 
 
 
388 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0691  cell cycle protein  55.65 
 
 
380 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145993  normal  0.313961 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2083  cell division protein FtsW  55.14 
 
 
384 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  hitchhiker  0.00100012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2420  cell division protein FtsW  56.64 
 
 
382 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.737508 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2008  cell division protein FtsW  57.18 
 
 
384 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0298176  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2357  cell cycle protein  55.38 
 
 
388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2892  cell division protein  53.49 
 
 
384 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7444  cell cycle protein  53.78 
 
 
379 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.727498  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0948  cell division protein FtsW  51.23 
 
 
386 aa  380  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104281  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6705  cell cycle protein  52.65 
 
 
379 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0951  cell cycle protein  48.23 
 
 
392 aa  348  7e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215554  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2079  cell division protein FtsW  48.18 
 
 
375 aa  342  9e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0540467  normal  0.263887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3667  cell division protein FtsW  47.25 
 
 
390 aa  331  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249047  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3171  cell cycle protein  45.88 
 
 
387 aa  312  7.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.0069748  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0681  cell division protein FtsW  42.55 
 
 
389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0184419 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0062  cell cycle protein  42.55 
 
 
387 aa  259  6e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2424  putative cell division protein ftsW  41.73 
 
 
388 aa  256  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0439759  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1882  cell cycle protein  41.73 
 
 
410 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2761  cell cycle protein  38.42 
 
 
395 aa  250  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.355007  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0692  cell division protein FtsW  42.25 
 
 
388 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2106  cell division protein FtsW  42.78 
 
 
388 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0782  cell division protein FtsW  42.78 
 
 
388 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18598  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3948  cell cycle protein  38.69 
 
 
405 aa  236  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4496  cell division protein FtsW  42.66 
 
 
389 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0394  cell division protein FtsW, putative  38.14 
 
 
371 aa  220  3.9999999999999997e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.612635  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1132  cell cycle protein  39.95 
 
 
397 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.91568  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0754  cell division protein FtsW  35.41 
 
 
375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.138938  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  33.77 
 
 
391 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  33.77 
 
 
391 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4985  cell division protein FtsW  36.52 
 
 
399 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57360  cell division protein FtsW  36.52 
 
 
399 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3812  cell division protein FtsW  32.53 
 
 
405 aa  176  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3805  cell division protein FtsW  31.34 
 
 
404 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4534  cell division protein FtsW  28.76 
 
 
404 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1146  cell division protein FtsW  31.23 
 
 
406 aa  169  9e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0486  cell division protein FtsW  29.21 
 
 
403 aa  168  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0385  cell division protein FtsW  29.21 
 
 
403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0110798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3744  cell division protein FtsW  29.21 
 
 
403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000784985 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1980  cell division protein FtsW  31.87 
 
 
398 aa  166  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  33.7 
 
 
368 aa  166  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3571  cell division protein FtsW  28.95 
 
 
403 aa  166  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004491  cell division protein FtsW  30.69 
 
 
398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0567  cell cycle protein  32.74 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2495  cell cycle protein  34.86 
 
 
386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0354  phosphopantetheine attachment site  29.27 
 
 
404 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4220  cell division protein FtsW  28.68 
 
 
403 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1974  cell division protein  32.01 
 
 
372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2203  cell cycle protein FtsW  33.7 
 
 
369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3454  cell division protein FtsW  28.49 
 
 
404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477404 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0222  cell division protein FtsW  31.75 
 
 
372 aa  162  6e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00901  hypothetical protein  30.65 
 
 
398 aa  163  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  33.43 
 
 
368 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  33.06 
 
 
363 aa  162  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  34.26 
 
 
359 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2645  cell division protein FtsW  31.18 
 
 
400 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0353  cell division protein FtsW  29.19 
 
 
402 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000708854 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  34.08 
 
 
374 aa  161  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2430  cell division protein FtsW  32.8 
 
 
398 aa  159  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0426  cell division protein FtsW  29.86 
 
 
403 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  32.59 
 
 
375 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0409  cell division protein FtsW  28.23 
 
 
410 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0412  cell division protein FtsW  29.86 
 
 
403 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0400  cell division protein FtsW  29.86 
 
 
403 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0401  cell division protein FtsW  29.86 
 
 
403 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0921  cell division protein FtsW  34.96 
 
 
402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.524737  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0943  cell division protein FtsW  33.43 
 
 
404 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3520  cell division protein FtsW  33.33 
 
 
487 aa  155  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0703  cell cycle protein FtsW  30 
 
 
407 aa  155  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1173  cell cycle protein  31.2 
 
 
412 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0716597  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1195  cell cycle protein  31.2 
 
 
412 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0273855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  31.01 
 
 
367 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2202  cell division protein FtsW  34.41 
 
 
400 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244408  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0166  cell division protein FtsW  33.68 
 
 
423 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.582847  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4466  cell division protein FtsW  32.75 
 
 
437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2191  cell cycle protein  34.29 
 
 
394 aa  153  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.506626  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0601  cell division protein FtsW  31.77 
 
 
441 aa  152  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.190924  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  31.65 
 
 
374 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0180  cell division protein FtsW  33.42 
 
 
423 aa  152  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.598529  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  33.14 
 
 
354 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2615  cell division protein FtsW  32.56 
 
 
397 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000584566 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0768  cell division protein FtsW  32.36 
 
 
400 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.626093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  31.86 
 
 
371 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13240  cell division protein FtsW  34.66 
 
 
406 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.681757  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0847  cell division protein FtsW  33.33 
 
 
387 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.830449  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>