More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3395 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1993  cell cycle protein  95.42 
 
 		 381 aa  665    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3395  cell cycle protein  100 
 
 		 381 aa  749    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4049  cell division protein FtsW  90.48 
 
 		 380 aa  636    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1278  cell cycle protein  83.51 
 
 		 382 aa  617  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.959004  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1050  cell cycle protein  81.2 
 
 		 383 aa  599  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00180763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3307  cell cycle protein  85.45 
 
 		 383 aa  597  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6175  essential cell division protein (stabilizes FtsZ ring)  84.04 
 
 		 383 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.189814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1190  cell division protein FtsW  63.76 
 
 		 399 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1743  cell division protein FtsW  58.49 
 
 		 386 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0466348  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1432  cell division protein FtsW  57.95 
 
 		 385 aa  442  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1389  cell division protein FtsW  57.68 
 
 		 385 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3167  cell cycle protein  55.16 
 
 		 388 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0456428  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2940  cell cycle protein  55.16 
 
 		 388 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3486  cell cycle protein  57.22 
 
 		 398 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3123  cell cycle protein  55.43 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2083  cell division protein FtsW  56.64 
 
 		 384 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  hitchhiker  0.00100012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2008  cell division protein FtsW  57.74 
 
 		 384 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0298176  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2357  cell cycle protein  55.71 
 
 		 388 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2595  cell division protein FtsW  54.45 
 
 		 384 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2855  cell division protein FtsW  54.72 
 
 		 384 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487661 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2892  cell division protein  53.39 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0691  cell cycle protein  55.61 
 
 		 380 aa  411  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145993  normal  0.313961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7444  cell cycle protein  53.8 
 
 		 379 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.727498  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2420  cell division protein FtsW  55.56 
 
 		 382 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.737508 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0948  cell division protein FtsW  51.62 
 
 		 386 aa  389  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104281  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6705  cell cycle protein  54.08 
 
 		 379 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2079  cell division protein FtsW  49.3 
 
 		 375 aa  345  7e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0540467  normal  0.263887 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0951  cell cycle protein  47.41 
 
 		 392 aa  343  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215554  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3667  cell division protein FtsW  45.75 
 
 		 390 aa  328  7e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249047  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3171  cell cycle protein  45.33 
 
 		 387 aa  309  6.999999999999999e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.0069748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0681  cell division protein FtsW  42.55 
 
 		 389 aa  295  9e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0184419 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2761  cell cycle protein  41.27 
 
 		 395 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.355007  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2424  putative cell division protein ftsW  42.7 
 
 		 388 aa  272  8.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0439759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0062  cell cycle protein  43.28 
 
 		 387 aa  256  5e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0692  cell division protein FtsW  42.66 
 
 		 388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2106  cell division protein FtsW  43.21 
 
 		 388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0782  cell division protein FtsW  43.21 
 
 		 388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18598  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1882  cell cycle protein  39.57 
 
 		 410 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3948  cell cycle protein  40.16 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4496  cell division protein FtsW  42.98 
 
 		 389 aa  239  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0394  cell division protein FtsW, putative  39.27 
 
 		 371 aa  219  7e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.612635  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1132  cell cycle protein  39.5 
 
 		 397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.91568  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0754  cell division protein FtsW  34.36 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.138938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4985  cell division protein FtsW  37.43 
 
 		 399 aa  179  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57360  cell division protein FtsW  37.43 
 
 		 399 aa  179  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  33.7 
 
 		 391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  33.7 
 
 		 391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4220  cell division protein FtsW  31.41 
 
 		 403 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3805  cell division protein FtsW  32.43 
 
 		 404 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1980  cell division protein FtsW  32 
 
 		 398 aa  172  9e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1974  cell division protein  34.5 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2430  cell division protein FtsW  33.6 
 
 		 398 aa  170  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0385  cell division protein FtsW  30.63 
 
 		 403 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0110798 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0222  cell division protein FtsW  33.63 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3744  cell division protein FtsW  30.63 
 
 		 403 aa  170  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000784985 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0486  cell division protein FtsW  29.47 
 
 		 403 aa  169  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004491  cell division protein FtsW  31.35 
 
 		 398 aa  169  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2645  cell division protein FtsW  32 
 
 		 400 aa  169  8e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3571  cell division protein FtsW  30.37 
 
 		 403 aa  169  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  33.52 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3454  cell division protein FtsW  29.86 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477404 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1146  cell division protein FtsW  31.46 
 
 		 406 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0353  cell division protein FtsW  31.34 
 
 		 402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000708854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4534  cell division protein FtsW  27.97 
 
 		 404 aa  166  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3812  cell division protein FtsW  30.14 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0354  phosphopantetheine attachment site  30.25 
 
 		 404 aa  164  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00901  hypothetical protein  31.87 
 
 		 398 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  32.87 
 
 		 375 aa  163  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0426  cell division protein FtsW  31.06 
 
 		 403 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2495  cell cycle protein  33.98 
 
 		 386 aa  159  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0943  cell division protein FtsW  35.57 
 
 		 404 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  32.22 
 
 		 363 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4466  cell division protein FtsW  30.93 
 
 		 437 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0412  cell division protein FtsW  31.06 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0401  cell division protein FtsW  31.06 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0400  cell division protein FtsW  31.06 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03259  cell division protein FtsW  32.17 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0180  cell division protein FtsW  33.6 
 
 		 423 aa  157  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.598529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2203  cell cycle protein FtsW  33.52 
 
 		 369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  33.89 
 
 		 359 aa  156  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2092  cell division protein FtsW  34.24 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0166  cell division protein FtsW  33.07 
 
 		 423 aa  155  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.582847  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0409  cell division protein FtsW  27.44 
 
 		 410 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146554 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2191  cell cycle protein  36.84 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.506626  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  30.53 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0567  cell cycle protein  35.23 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  32.85 
 
 		 354 aa  153  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  30.53 
 
 		 368 aa  153  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0921  cell division protein FtsW  35.93 
 
 		 402 aa  153  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.524737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0703  cell cycle protein FtsW  29.21 
 
 		 407 aa  153  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2202  cell division protein FtsW  35.26 
 
 		 400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2615  cell division protein FtsW  33.43 
 
 		 397 aa  152  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000584566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3520  cell division protein FtsW  31.92 
 
 		 487 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  34.82 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4674  cell cycle protein  33.82 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000737984  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2342  cell cycle protein  31.17 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4409  cell division protein FtsW  35.99 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309058  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4513  cell division protein FtsW  36.15 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.444721  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2647  cell division protein FtsW  31.36 
 
 		 539 aa  150  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4103  cell cycle protein  33.43 
 
 		 404 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.715571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>