More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3486 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3486  cell cycle protein  100 
 
 		 398 aa  784    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0691  cell cycle protein  81.4 
 
 		 380 aa  597  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145993  normal  0.313961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2940  cell cycle protein  59.44 
 
 		 388 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3167  cell cycle protein  59.44 
 
 		 388 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0456428  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3123  cell cycle protein  59.69 
 
 		 388 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2357  cell cycle protein  61.35 
 
 		 388 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7444  cell cycle protein  57.7 
 
 		 379 aa  430  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.727498  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1432  cell division protein FtsW  56.68 
 
 		 385 aa  418  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1389  cell division protein FtsW  56.68 
 
 		 385 aa  419  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1993  cell cycle protein  57.22 
 
 		 381 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1278  cell cycle protein  56.43 
 
 		 382 aa  418  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.959004  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6705  cell cycle protein  57.7 
 
 		 379 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1743  cell division protein FtsW  54.48 
 
 		 386 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0466348  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1050  cell cycle protein  56.88 
 
 		 383 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00180763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1190  cell division protein FtsW  56.88 
 
 		 399 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2892  cell division protein  55.5 
 
 		 384 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4049  cell division protein FtsW  57.71 
 
 		 380 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3395  cell cycle protein  57.49 
 
 		 381 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6175  essential cell division protein (stabilizes FtsZ ring)  56.43 
 
 		 383 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.189814 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2008  cell division protein FtsW  53.54 
 
 		 384 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0298176  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2420  cell division protein FtsW  55.11 
 
 		 382 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.737508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2855  cell division protein FtsW  54.96 
 
 		 384 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487661 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2595  cell division protein FtsW  54.42 
 
 		 384 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3307  cell cycle protein  56.76 
 
 		 383 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2083  cell division protein FtsW  52.91 
 
 		 384 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  hitchhiker  0.00100012 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0948  cell division protein FtsW  51.6 
 
 		 386 aa  360  3e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104281  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2079  cell division protein FtsW  51.1 
 
 		 375 aa  348  9e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0540467  normal  0.263887 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0951  cell cycle protein  47.85 
 
 		 392 aa  345  5e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215554  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3667  cell division protein FtsW  46.22 
 
 		 390 aa  323  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249047  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3171  cell cycle protein  47.31 
 
 		 387 aa  317  3e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.0069748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0681  cell division protein FtsW  42.08 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0184419 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2761  cell cycle protein  41.62 
 
 		 395 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.355007  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0062  cell cycle protein  42.18 
 
 		 387 aa  257  3e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2424  putative cell division protein ftsW  44.86 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0439759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1882  cell cycle protein  41.29 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4496  cell division protein FtsW  41.91 
 
 		 389 aa  239  9e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0692  cell division protein FtsW  42.13 
 
 		 388 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3948  cell cycle protein  40.59 
 
 		 405 aa  229  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2106  cell division protein FtsW  41.87 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0782  cell division protein FtsW  41.87 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18598  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1132  cell cycle protein  39.56 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.91568  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0394  cell division protein FtsW, putative  33.23 
 
 		 371 aa  187  2e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.612635  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0754  cell division protein FtsW  34 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.138938  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  31.59 
 
 		 391 aa  166  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  31.59 
 
 		 391 aa  166  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  33.43 
 
 		 373 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2851  cell division protein FtsW  33.51 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2645  cell division protein FtsW  32.19 
 
 		 400 aa  160  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  32.39 
 
 		 374 aa  159  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  34.36 
 
 		 385 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1980  cell division protein FtsW  31.14 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2203  cell cycle protein FtsW  33.52 
 
 		 369 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1146  cell division protein FtsW  31.79 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  33.64 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3805  cell division protein FtsW  30.32 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  33.52 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4534  cell division protein FtsW  30.32 
 
 		 404 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  35.36 
 
 		 371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  33.8 
 
 		 375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0354  phosphopantetheine attachment site  31.79 
 
 		 404 aa  154  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  33.43 
 
 		 368 aa  153  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  31.87 
 
 		 363 aa  153  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  32.77 
 
 		 368 aa  152  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  32.42 
 
 		 372 aa  152  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  32.58 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0567  cell cycle protein  32.12 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  32.39 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  33.13 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  31.62 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  31.62 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  32.11 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  32.72 
 
 		 389 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  30.96 
 
 		 367 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  31.19 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3812  cell division protein FtsW  30.3 
 
 		 405 aa  150  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  31.31 
 
 		 368 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  31.31 
 
 		 368 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  31.31 
 
 		 368 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  31.31 
 
 		 368 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00901  hypothetical protein  30.19 
 
 		 398 aa  149  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  33.13 
 
 		 368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  31.8 
 
 		 368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  33.43 
 
 		 373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004491  cell division protein FtsW  28.61 
 
 		 398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0143  cell division protein FtsW  31.25 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.247505 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0139  cell division protein FtsW  31.25 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.571731  hitchhiker  0.000000336901 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0136  cell division protein FtsW  31.25 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0144  cell division protein FtsW  31.25 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0378146  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0139  cell division protein FtsW  31.25 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.919378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4985  cell division protein FtsW  32.86 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348028  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1107  rod shape-determining protein  34.06 
 
 		 381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12070  rod shape-determining protein  34.06 
 
 		 367 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57360  cell division protein FtsW  32.86 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0486  cell division protein FtsW  29.67 
 
 		 403 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 413 aa  146  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  32.51 
 
 		 372 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0409  cell division protein FtsW  29.97 
 
 		 410 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146554 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3744  cell division protein FtsW  30.22 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000784985 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3571  cell division protein FtsW  30.22 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>