More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3181 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0234  PhoH family protein  91.8 
 
 		 369 aa  668    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3181  PhoH family protein  100 
 
 		 365 aa  726    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0246823  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3400  PhoH family protein  82.54 
 
 		 368 aa  580  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3205  PhoH family protein  81.97 
 
 		 368 aa  578  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3529  PhoH family protein  81.28 
 
 		 368 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0638  PhoH family protein  82.09 
 
 		 338 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2896  PhoH family protein  72.81 
 
 		 355 aa  482  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.434704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1056  PhoH family protein  69.85 
 
 		 341 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563658  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1811  PhoH family protein  64.01 
 
 		 379 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147763  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  62.65 
 
 		 351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0047  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  63.58 
 
 		 345 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0451  PhoH family protein  63.22 
 
 		 351 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  63.64 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0015  PhoH-like protein  61.77 
 
 		 349 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.945712  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  61.77 
 
 		 349 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  61.76 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2067  PhoH family protein  59.7 
 
 		 327 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  60 
 
 		 327 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  59.34 
 
 		 353 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  59.76 
 
 		 349 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  60.18 
 
 		 350 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  57.69 
 
 		 351 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000833124 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  59.51 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3920  PhoH-like protein  60.79 
 
 		 348 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1244  PhoH family protein  54.03 
 
 		 370 aa  346  5e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  56.11 
 
 		 342 aa  339  5e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  54.21 
 
 		 360 aa  320  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  52.76 
 
 		 348 aa  317  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0069  PhoH family protein  51.01 
 
 		 363 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0287585 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  53.48 
 
 		 333 aa  309  5e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3873  hypothetical protein  51.5 
 
 		 339 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1016  PhoH family protein  51.08 
 
 		 337 aa  305  7e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0442383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3599  hypothetical protein  51.2 
 
 		 346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3284  PhoH family protein  51.2 
 
 		 346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3692  PhoH family protein  53.61 
 
 		 375 aa  305  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3771  PhoH-like protein  52.7 
 
 		 322 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2063  PhoH-like protein  54.09 
 
 		 335 aa  297  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.590057 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0700  PhoH-like protein  48.08 
 
 		 373 aa  296  3e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0188  PhoH-like protein  48.22 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  49.18 
 
 		 329 aa  289  4e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1733  PhoH family protein  49.69 
 
 		 326 aa  288  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  46.04 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  46.04 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  46.04 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  46.04 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  46.04 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  45.73 
 
 		 319 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  45.73 
 
 		 319 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  47.27 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  45.43 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  47.27 
 
 		 319 aa  280  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  45.96 
 
 		 331 aa  279  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  47.71 
 
 		 323 aa  278  9e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  45.37 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3950  PhoH family protein  48.81 
 
 		 374 aa  277  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.493956 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  45.43 
 
 		 319 aa  275  7e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2713  PhoH family protein  47.63 
 
 		 356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  42.18 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  47.38 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2721  PhoH-like protein  46.86 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  49.06 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0888  PhoH family protein  46.15 
 
 		 354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0709  PhoH family protein  46.15 
 
 		 354 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0723  PhoH family protein  46.15 
 
 		 354 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  46.29 
 
 		 341 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0604  PhoH family protein  46.51 
 
 		 348 aa  272  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  48.57 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0225  PhoH family protein  46.15 
 
 		 352 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2437  PhoH family protein  46.15 
 
 		 352 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  47.06 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0735  PhoH family protein  48.87 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.855144  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2721  PhoH family protein  46.15 
 
 		 352 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  45.09 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  45.43 
 
 		 340 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2357  PhoH family protein  46.15 
 
 		 352 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  44.48 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0590  PhoH family protein  45.89 
 
 		 358 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.178371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  45.12 
 
 		 340 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1436  PhoH family protein  46.93 
 
 		 326 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2611  PhoH family protein  46.49 
 
 		 348 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0452  PhoH-like protein  45.99 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2082  PhoH-like protein  46.65 
 
 		 348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2722  PhoH family protein  46.65 
 
 		 348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.72441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2694  PhoH family protein  46.65 
 
 		 348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1198  PhoH family protein  43.41 
 
 		 348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331138  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0892  PhoH family protein  45.27 
 
 		 359 aa  269  4e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.427486  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  46.71 
 
 		 315 aa  269  5e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3239  putative phoH-like protein  48.58 
 
 		 338 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0579  PhoH family protein  45.77 
 
 		 318 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.818814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0411  PhoH family protein  45.24 
 
 		 362 aa  268  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.234067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  44.48 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  46.13 
 
 		 315 aa  268  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0629  putative PhoH-family protein  45.3 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2484  PhoH family protein  44.17 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2747  PhoH family protein  46.39 
 
 		 348 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  46.13 
 
 		 315 aa  268  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  47.17 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19541  PhoH-like phosphate starvation-inducible protein  45.12 
 
 		 323 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47675 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3301  lipoate synthase  46.77 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2905  PhoH family protein  46.23 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.21329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>