More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0188 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0188  PhoH-like protein  100 
 
 
338 aa  687    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1016  PhoH family protein  73.13 
 
 
337 aa  486  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0442383  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3284  PhoH family protein  70.41 
 
 
346 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3599  hypothetical protein  70.41 
 
 
346 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3873  hypothetical protein  70.12 
 
 
339 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0700  PhoH-like protein  70.59 
 
 
373 aa  476  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3692  PhoH family protein  69.88 
 
 
375 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316664  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  55.8 
 
 
342 aa  351  8e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  51.82 
 
 
353 aa  328  8e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  54.35 
 
 
333 aa  328  9e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  50.6 
 
 
349 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  51.21 
 
 
350 aa  325  9e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  52.96 
 
 
327 aa  324  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  53.46 
 
 
357 aa  321  9.000000000000001e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0069  PhoH family protein  49.55 
 
 
363 aa  321  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0287585 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2067  PhoH family protein  52.96 
 
 
327 aa  320  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  52.52 
 
 
351 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000833124 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3771  PhoH-like protein  53.16 
 
 
322 aa  315  5e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3920  PhoH-like protein  51.09 
 
 
348 aa  314  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1811  PhoH family protein  51.85 
 
 
379 aa  305  6e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147763  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  49.7 
 
 
344 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  50.76 
 
 
351 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  49.69 
 
 
340 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  49.69 
 
 
349 aa  301  8.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0047  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  49.12 
 
 
345 aa  301  8.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0015  PhoH-like protein  49.38 
 
 
349 aa  301  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.945712  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0451  PhoH family protein  50 
 
 
351 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1244  PhoH family protein  47.81 
 
 
370 aa  300  2e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  49.06 
 
 
340 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  49.07 
 
 
347 aa  299  4e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  48.62 
 
 
331 aa  298  7e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  50.32 
 
 
352 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2721  PhoH-like protein  48.41 
 
 
354 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  48.76 
 
 
365 aa  297  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4241  PhoH family protein  50.95 
 
 
316 aa  295  7e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.220372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  51.28 
 
 
328 aa  295  8e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  51.25 
 
 
360 aa  294  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2713  PhoH family protein  48.41 
 
 
356 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3239  putative phoH-like protein  50 
 
 
338 aa  294  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004212  phosphate starvation-inducible protein PhoH  49.23 
 
 
365 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00393498  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  51.13 
 
 
335 aa  293  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3135  PhoH family protein  48.47 
 
 
352 aa  293  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2905  PhoH family protein  47.63 
 
 
359 aa  292  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.21329  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2813  PhoH family protein  47.63 
 
 
359 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0995  PhoH-like protein  50.15 
 
 
356 aa  293  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0457768  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  51.13 
 
 
335 aa  292  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02231  putative ATP-binding protein in pho regulon  50.31 
 
 
370 aa  292  6e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1196  PhoH family protein  48.47 
 
 
352 aa  292  7e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3181  PhoH family protein  48.65 
 
 
365 aa  291  8e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0246823  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0483  phoH family protein  48.92 
 
 
367 aa  291  8e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000530716  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4666  PhoH family protein  50.97 
 
 
316 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0238  PhoH-like protein  47.08 
 
 
330 aa  291  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  51.13 
 
 
323 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  49.68 
 
 
339 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  49.07 
 
 
348 aa  290  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01229  hypothetical protein  49.84 
 
 
365 aa  290  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  46.63 
 
 
341 aa  289  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0395  PhoH family protein  48.47 
 
 
343 aa  289  4e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2063  PhoH-like protein  51.76 
 
 
335 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.590057 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09060  PhoH-like protein  50.97 
 
 
336 aa  288  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706372  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4095  PhoH-like protein  50.48 
 
 
337 aa  288  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  48.44 
 
 
332 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3780  PhoH family protein  48.14 
 
 
350 aa  287  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.150452 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2207  PhoH-like protein  48.46 
 
 
345 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.935668  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0749  PhoH family protein  46.48 
 
 
327 aa  287  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019197 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0738  PhoH-like protein  49.36 
 
 
338 aa  287  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0597  PhoH-like protein  46.48 
 
 
340 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2896  PhoH family protein  48.78 
 
 
355 aa  287  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.434704 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2856  PhoH family protein  48.76 
 
 
349 aa  286  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0509  PhoH family protein  51.13 
 
 
345 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  49.54 
 
 
332 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0534  PhoH family protein  46.08 
 
 
342 aa  287  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  48.76 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  48.76 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3006  PhoH family protein  48.19 
 
 
357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.425195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0638  PhoH family protein  48.77 
 
 
338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1830  hypothetical protein  48.19 
 
 
357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1024  PhoH family protein  51.49 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1105  PhoH family protein  48.9 
 
 
348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000125149 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2916  PhoH family protein  48.19 
 
 
357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0010821  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  49.2 
 
 
348 aa  286  4e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1183  PhoH family protein  46.82 
 
 
337 aa  286  4e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  48.61 
 
 
325 aa  285  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1056  PhoH family protein  48.46 
 
 
341 aa  285  7e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563658  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  50.49 
 
 
320 aa  285  8e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0775  PhoH family protein  47.24 
 
 
348 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.774508  normal  0.946623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0714  PhoH family protein  47.24 
 
 
348 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0457534  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0728  PhoH family protein  47.24 
 
 
348 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.93581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  46.75 
 
 
334 aa  285  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0787  PhoH family protein  47.24 
 
 
348 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0823  PhoH family protein  47.24 
 
 
348 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0234  PhoH family protein  47.18 
 
 
369 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3573  phoH family protein  47.26 
 
 
368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189544  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0587  PhoH family protein  47.24 
 
 
346 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.139571  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3529  PhoH family protein  48.92 
 
 
368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1218  PhoH family protein  48.46 
 
 
351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0284374  normal  0.476314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3205  PhoH family protein  48.92 
 
 
368 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1003  PhoH family protein  48.9 
 
 
354 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00802061  normal  0.173492 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1068  PhoH family protein  48.9 
 
 
347 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1007  PhoH family protein  48.9 
 
 
354 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.109119  normal  0.0769537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>