More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0438 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  100 
 
 		 357 aa  726    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  86.22 
 
 		 351 aa  604  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000833124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  83.87 
 
 		 350 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  83.43 
 
 		 349 aa  591  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  71.39 
 
 		 353 aa  494  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  75.38 
 
 		 327 aa  489  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2067  PhoH family protein  75.08 
 
 		 327 aa  484  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3920  PhoH-like protein  69.51 
 
 		 348 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1244  PhoH family protein  61.42 
 
 		 370 aa  402  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0047  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  62.73 
 
 		 345 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  59.94 
 
 		 342 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0451  PhoH family protein  62.22 
 
 		 351 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  59.05 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  60.31 
 
 		 351 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  58.89 
 
 		 349 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0638  PhoH family protein  62.58 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0015  PhoH-like protein  59.52 
 
 		 349 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.945712  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  61.71 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1811  PhoH family protein  60.32 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147763  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3400  PhoH family protein  59.43 
 
 		 368 aa  368  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3181  PhoH family protein  59.51 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0246823  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2896  PhoH family protein  57.73 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.434704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3529  PhoH family protein  58.81 
 
 		 368 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3205  PhoH family protein  57.01 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0234  PhoH family protein  59.51 
 
 		 369 aa  364  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1056  PhoH family protein  57.32 
 
 		 341 aa  353  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563658  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  56.13 
 
 		 360 aa  352  7e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  56.25 
 
 		 333 aa  345  5e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0069  PhoH family protein  52.96 
 
 		 363 aa  341  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0287585 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  57.5 
 
 		 348 aa  341  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2063  PhoH-like protein  56.72 
 
 		 335 aa  340  2e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.590057 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1016  PhoH family protein  56.15 
 
 		 337 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0442383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0700  PhoH-like protein  53.71 
 
 		 373 aa  339  5e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3771  PhoH-like protein  55.31 
 
 		 322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3873  hypothetical protein  51.95 
 
 		 339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3284  PhoH family protein  51.48 
 
 		 346 aa  325  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3599  hypothetical protein  51.48 
 
 		 346 aa  325  7e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3692  PhoH family protein  53.23 
 
 		 375 aa  324  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0188  PhoH-like protein  53.46 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  51.91 
 
 		 319 aa  315  7e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  51.91 
 
 		 319 aa  315  7e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  51.91 
 
 		 319 aa  315  7e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  51.91 
 
 		 319 aa  315  7e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  51.91 
 
 		 319 aa  315  7e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  51.91 
 
 		 319 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  51.91 
 
 		 319 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  51.91 
 
 		 319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  51.59 
 
 		 331 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  51.59 
 
 		 319 aa  311  9e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1436  PhoH family protein  52.35 
 
 		 326 aa  311  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  52.38 
 
 		 339 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  51.59 
 
 		 319 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  51.44 
 
 		 319 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  50.15 
 
 		 319 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1733  PhoH family protein  52.88 
 
 		 326 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  47.28 
 
 		 328 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  54.02 
 
 		 320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  50.62 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  49.53 
 
 		 315 aa  300  3e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  49.7 
 
 		 341 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1184  phosphate starvation-inducible protein PhoH, ATPase  51.27 
 
 		 319 aa  298  7e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  49.52 
 
 		 323 aa  297  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  52.32 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1272  PhoH-like protein protein  47.94 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31699  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  48.74 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  48.74 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4241  PhoH family protein  49.23 
 
 		 316 aa  296  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220372 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  49.21 
 
 		 335 aa  296  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0591  PhoH-like protein  47.74 
 
 		 361 aa  296  4e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  51.42 
 
 		 330 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3301  lipoate synthase  50.15 
 
 		 364 aa  296  5e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2747  PhoH family protein  49.41 
 
 		 348 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  49.21 
 
 		 335 aa  295  9e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6022  PhoH-like protein  47.54 
 
 		 348 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0452  PhoH-like protein  49.69 
 
 		 331 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  47.04 
 
 		 340 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2722  PhoH family protein  48.53 
 
 		 348 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.72441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2082  PhoH-like protein  48.53 
 
 		 348 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  49.38 
 
 		 323 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2694  PhoH family protein  48.53 
 
 		 348 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0225  PhoH family protein  47.66 
 
 		 352 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0242  PhoH family protein  48.25 
 
 		 344 aa  293  4e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2721  PhoH family protein  47.66 
 
 		 352 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2357  PhoH family protein  47.66 
 
 		 352 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2437  PhoH family protein  47.66 
 
 		 352 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  48.45 
 
 		 340 aa  292  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2611  PhoH family protein  48.53 
 
 		 348 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0604  PhoH family protein  47.65 
 
 		 348 aa  292  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  49.25 
 
 		 332 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0723  PhoH family protein  47.38 
 
 		 354 aa  292  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0709  PhoH family protein  47.38 
 
 		 354 aa  292  7e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  49.4 
 
 		 332 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0627  putative PhoH-like protein, ATPase  46.3 
 
 		 361 aa  292  8e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.121399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0888  PhoH family protein  47.38 
 
 		 354 aa  292  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  50.15 
 
 		 365 aa  291  9e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  48.95 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4067  PhoH family protein  49.06 
 
 		 316 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  49.85 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0574  PhoH family protein  47.94 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184118  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3780  PhoH family protein  48.09 
 
 		 350 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.150452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>