More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0234 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0234  PhoH family protein  100 
 
 
369 aa  735    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3181  PhoH family protein  91.8 
 
 
365 aa  647    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0246823  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3400  PhoH family protein  80.87 
 
 
368 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161796  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3205  PhoH family protein  80.6 
 
 
368 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3529  PhoH family protein  80.33 
 
 
368 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0638  PhoH family protein  81.42 
 
 
338 aa  545  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2896  PhoH family protein  72.29 
 
 
355 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.434704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1056  PhoH family protein  68.84 
 
 
341 aa  455  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563658  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1811  PhoH family protein  63.13 
 
 
379 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147763  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0047  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  64.58 
 
 
345 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  63.95 
 
 
351 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0451  PhoH family protein  63.38 
 
 
351 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  63.64 
 
 
344 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  63.01 
 
 
349 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0015  PhoH-like protein  61.76 
 
 
349 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.945712  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  61.13 
 
 
352 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  56.89 
 
 
353 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  58.9 
 
 
327 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2067  PhoH family protein  58.59 
 
 
327 aa  368  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  59.82 
 
 
350 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  59.51 
 
 
349 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  59.51 
 
 
357 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  58.26 
 
 
351 aa  363  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000833124 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3920  PhoH-like protein  57.61 
 
 
348 aa  357  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  55.28 
 
 
342 aa  335  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1244  PhoH family protein  52.69 
 
 
370 aa  331  1e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  51.46 
 
 
348 aa  310  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  54.18 
 
 
360 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0069  PhoH family protein  49.44 
 
 
363 aa  305  7e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0287585 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  53.8 
 
 
333 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1016  PhoH family protein  51.26 
 
 
337 aa  301  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0442383  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3771  PhoH-like protein  52.7 
 
 
322 aa  300  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3692  PhoH family protein  52.35 
 
 
375 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316664  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3873  hypothetical protein  49.85 
 
 
339 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3599  hypothetical protein  49.56 
 
 
346 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3284  PhoH family protein  49.56 
 
 
346 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0700  PhoH-like protein  48.64 
 
 
373 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2063  PhoH-like protein  52.38 
 
 
335 aa  288  7e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.590057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0188  PhoH-like protein  47.18 
 
 
338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1733  PhoH family protein  49.38 
 
 
326 aa  279  6e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  47.42 
 
 
329 aa  278  8e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  43.54 
 
 
328 aa  276  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  45.12 
 
 
319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  45.12 
 
 
319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  45.12 
 
 
319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  47.27 
 
 
323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  45.12 
 
 
319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  45.12 
 
 
319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  44.82 
 
 
319 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  44.92 
 
 
333 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  44.82 
 
 
319 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  46.62 
 
 
319 aa  271  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  46.3 
 
 
319 aa  270  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  44.51 
 
 
319 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3330  PhoH family protein  44.41 
 
 
357 aa  269  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.128023 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  47.45 
 
 
319 aa  269  5e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0604  PhoH family protein  47.26 
 
 
348 aa  268  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0629  putative PhoH-family protein  44.6 
 
 
359 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  44.75 
 
 
331 aa  267  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2696  PhoH-like protein  46.93 
 
 
346 aa  267  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  47.19 
 
 
359 aa  267  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3950  PhoH family protein  48.35 
 
 
374 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.493956 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  45.99 
 
 
341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0723  PhoH family protein  45.3 
 
 
354 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0709  PhoH family protein  45.3 
 
 
354 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95861  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2611  PhoH family protein  45.91 
 
 
348 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126253  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0892  PhoH family protein  46.04 
 
 
359 aa  265  7e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.427486  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2484  PhoH family protein  43.29 
 
 
320 aa  265  8e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  48.89 
 
 
325 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0225  PhoH family protein  45.53 
 
 
352 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2357  PhoH family protein  45.53 
 
 
352 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2437  PhoH family protein  45.53 
 
 
352 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2082  PhoH-like protein  46.78 
 
 
348 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2721  PhoH family protein  45.53 
 
 
352 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2694  PhoH family protein  46.78 
 
 
348 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2722  PhoH family protein  46.78 
 
 
348 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.72441  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  46.88 
 
 
315 aa  264  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0411  PhoH family protein  44.13 
 
 
362 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.234067 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3239  putative phoH-like protein  47.98 
 
 
338 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0888  PhoH family protein  46.09 
 
 
354 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  47.32 
 
 
339 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6022  PhoH-like protein  46.4 
 
 
348 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611976  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0590  PhoH family protein  45.04 
 
 
358 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.178371  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0452  PhoH-like protein  45.68 
 
 
331 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1198  PhoH family protein  43.41 
 
 
348 aa  264  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331138  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0866  PhoH family protein  48.1 
 
 
339 aa  264  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0735  PhoH family protein  48.69 
 
 
335 aa  262  4.999999999999999e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.855144  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2721  PhoH-like protein  45.28 
 
 
354 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2713  PhoH family protein  46.11 
 
 
356 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2747  PhoH family protein  45.78 
 
 
348 aa  262  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  46.01 
 
 
315 aa  262  6.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  46.01 
 
 
315 aa  262  6.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  46.54 
 
 
330 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  45.71 
 
 
340 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0579  PhoH family protein  45.43 
 
 
318 aa  261  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.818814  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1436  PhoH family protein  47.66 
 
 
326 aa  261  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  45.59 
 
 
320 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  45.2 
 
 
332 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  46.6 
 
 
319 aa  261  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3301  lipoate synthase  46.39 
 
 
364 aa  260  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0967934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>