More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3529 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3400  PhoH family protein  96.74 
 
 
368 aa  721    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161796  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3205  PhoH family protein  98.91 
 
 
368 aa  734    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3529  PhoH family protein  100 
 
 
368 aa  742    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0638  PhoH family protein  86.39 
 
 
338 aa  594  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3181  PhoH family protein  83.04 
 
 
365 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0246823  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0234  PhoH family protein  80.33 
 
 
369 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2896  PhoH family protein  71.17 
 
 
355 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.434704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1056  PhoH family protein  70.21 
 
 
341 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563658  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0047  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  64.78 
 
 
345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0451  PhoH family protein  64.13 
 
 
351 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  61.98 
 
 
344 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  62.81 
 
 
351 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  59.47 
 
 
352 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  62.58 
 
 
349 aa  393  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1811  PhoH family protein  61.66 
 
 
379 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147763  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2067  PhoH family protein  60.82 
 
 
327 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  61.13 
 
 
327 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  55.9 
 
 
353 aa  381  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0015  PhoH-like protein  58.6 
 
 
349 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.945712  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  59.57 
 
 
350 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  57.39 
 
 
351 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000833124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  60.38 
 
 
349 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  58.81 
 
 
357 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3920  PhoH-like protein  58.02 
 
 
348 aa  361  9e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  55.94 
 
 
342 aa  345  8e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1244  PhoH family protein  52.05 
 
 
370 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  51.61 
 
 
348 aa  323  4e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  54.69 
 
 
360 aa  319  5e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0069  PhoH family protein  47.99 
 
 
363 aa  313  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0287585 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  51.52 
 
 
333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3771  PhoH-like protein  52.85 
 
 
322 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2063  PhoH-like protein  53.29 
 
 
335 aa  300  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.590057 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3873  hypothetical protein  52.15 
 
 
339 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1016  PhoH family protein  50.63 
 
 
337 aa  299  5e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0442383  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3599  hypothetical protein  52.15 
 
 
346 aa  298  9e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3284  PhoH family protein  52.15 
 
 
346 aa  298  9e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0700  PhoH-like protein  48.2 
 
 
373 aa  298  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3692  PhoH family protein  50.76 
 
 
375 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316664  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  46.42 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  46.42 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  46.42 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  46.42 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0188  PhoH-like protein  48.92 
 
 
338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  46.42 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  45.96 
 
 
319 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  45.96 
 
 
319 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1733  PhoH family protein  47.48 
 
 
326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  46.11 
 
 
319 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  45.79 
 
 
319 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  45.79 
 
 
319 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  46.73 
 
 
319 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  48.11 
 
 
341 aa  278  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  45.43 
 
 
329 aa  276  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2484  PhoH family protein  45.57 
 
 
320 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3950  PhoH family protein  46.55 
 
 
374 aa  275  6e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.493956 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  46.75 
 
 
323 aa  275  8e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  45.85 
 
 
331 aa  275  8e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0452  PhoH-like protein  48.57 
 
 
331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  43.69 
 
 
328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  46.39 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  46.39 
 
 
365 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  49.84 
 
 
339 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  47.6 
 
 
332 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  44.55 
 
 
359 aa  271  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1436  PhoH family protein  48.3 
 
 
326 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  48.59 
 
 
328 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  48.56 
 
 
332 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0574  PhoH family protein  43.96 
 
 
322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184118  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4346  PhoH-like protein  46.82 
 
 
340 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  48.6 
 
 
319 aa  270  4e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2713  PhoH family protein  47.78 
 
 
356 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0735  PhoH family protein  46.77 
 
 
335 aa  270  4e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.855144  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0604  PhoH family protein  46.06 
 
 
348 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  45.85 
 
 
320 aa  269  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1283  PhoH family protein  49.54 
 
 
333 aa  269  5e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.395155  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  46.89 
 
 
315 aa  269  7e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2721  PhoH-like protein  47 
 
 
354 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3573  phoH family protein  44.38 
 
 
368 aa  268  8e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189544  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  45.62 
 
 
340 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  47.28 
 
 
332 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  47.66 
 
 
325 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1198  PhoH family protein  43.97 
 
 
348 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331138  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  47.28 
 
 
332 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  46.73 
 
 
348 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  46.56 
 
 
340 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2813  PhoH family protein  47 
 
 
359 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2905  PhoH family protein  47 
 
 
359 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.21329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3301  lipoate synthase  46.46 
 
 
364 aa  267  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  46.08 
 
 
347 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0892  PhoH family protein  44.71 
 
 
359 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.427486  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0483  phoH family protein  45.96 
 
 
367 aa  266  5e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000530716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3138  PhoH family protein  48.09 
 
 
346 aa  266  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504008  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2611  PhoH family protein  46.06 
 
 
348 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126253  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  47.02 
 
 
315 aa  265  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  47.02 
 
 
315 aa  265  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2048  PhoH family protein  47.29 
 
 
323 aa  265  7e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  47.3 
 
 
330 aa  265  8e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0395  PhoH family protein  48.42 
 
 
343 aa  265  8e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0255  PhoH family protein  45.25 
 
 
328 aa  265  8.999999999999999e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4805  PhoH-like protein  46.5 
 
 
340 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>