More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3692 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3692  PhoH family protein  100 
 
 		 375 aa  753    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3599  hypothetical protein  72.19 
 
 		 346 aa  484  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3284  PhoH family protein  72.19 
 
 		 346 aa  484  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3873  hypothetical protein  73.08 
 
 		 339 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1016  PhoH family protein  72.96 
 
 		 337 aa  482  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0442383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0700  PhoH-like protein  69.39 
 
 		 373 aa  474  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0188  PhoH-like protein  69.28 
 
 		 338 aa  460  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  56.17 
 
 		 342 aa  362  7.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  57.23 
 
 		 333 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  54.75 
 
 		 351 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000833124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  53.71 
 
 		 350 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  53.78 
 
 		 349 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0069  PhoH family protein  53.12 
 
 		 363 aa  335  7e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0287585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  53.47 
 
 		 357 aa  332  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  55.73 
 
 		 327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  53.57 
 
 		 353 aa  326  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2067  PhoH family protein  55.41 
 
 		 327 aa  325  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  50.91 
 
 		 351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3920  PhoH-like protein  53.5 
 
 		 348 aa  319  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0015  PhoH-like protein  49.85 
 
 		 349 aa  319  6e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.945712  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  52.47 
 
 		 348 aa  318  7e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  50.9 
 
 		 352 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1811  PhoH family protein  52.84 
 
 		 379 aa  318  9e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147763  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  53.09 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  51.37 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0047  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  50.95 
 
 		 345 aa  315  9e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  54.98 
 
 		 360 aa  314  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  50.31 
 
 		 349 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0451  PhoH family protein  50.77 
 
 		 351 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  52.56 
 
 		 335 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  52.24 
 
 		 335 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2063  PhoH-like protein  52.4 
 
 		 335 aa  312  5.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.590057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3181  PhoH family protein  52.58 
 
 		 365 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0246823  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0638  PhoH family protein  52.02 
 
 		 338 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3771  PhoH-like protein  51.92 
 
 		 322 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2896  PhoH family protein  51.39 
 
 		 355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.434704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  50 
 
 		 332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3205  PhoH family protein  49.58 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4241  PhoH family protein  52.24 
 
 		 316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0234  PhoH family protein  50.86 
 
 		 369 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  50.3 
 
 		 331 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  51.25 
 
 		 323 aa  305  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3239  putative phoH-like protein  53.29 
 
 		 338 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1244  PhoH family protein  50.63 
 
 		 370 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1056  PhoH family protein  49.39 
 
 		 341 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563658  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3400  PhoH family protein  48.76 
 
 		 368 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3529  PhoH family protein  49.44 
 
 		 368 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  49.69 
 
 		 332 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4067  PhoH family protein  51.56 
 
 		 316 aa  304  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  49.69 
 
 		 332 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3301  lipoate synthase  49.22 
 
 		 364 aa  303  4.0000000000000003e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  50.96 
 
 		 330 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  50.15 
 
 		 332 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0238  PhoH-like protein  50.92 
 
 		 330 aa  301  9e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0452  PhoH-like protein  51.27 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2747  PhoH family protein  49.85 
 
 		 348 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  51.11 
 
 		 341 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3780  PhoH family protein  48.99 
 
 		 350 aa  300  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.150452 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2713  PhoH family protein  49.04 
 
 		 356 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4666  PhoH family protein  52.09 
 
 		 316 aa  299  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3330  PhoH family protein  47.4 
 
 		 357 aa  298  7e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.128023 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2082  PhoH-like protein  49.41 
 
 		 348 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2694  PhoH family protein  49.41 
 
 		 348 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1733  PhoH family protein  50.47 
 
 		 326 aa  299  7e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2722  PhoH family protein  49.41 
 
 		 348 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.72441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2611  PhoH family protein  49.26 
 
 		 348 aa  298  8e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0604  PhoH family protein  49.26 
 
 		 348 aa  298  9e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1024  PhoH family protein  52.65 
 
 		 320 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2721  PhoH-like protein  47.3 
 
 		 354 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  51.6 
 
 		 328 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  49.84 
 
 		 340 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  51.15 
 
 		 319 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  51.15 
 
 		 319 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  51.15 
 
 		 319 aa  297  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  51.15 
 
 		 319 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  51.15 
 
 		 319 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  52.46 
 
 		 319 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2813  PhoH family protein  47.96 
 
 		 359 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2905  PhoH family protein  47.96 
 
 		 359 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.21329  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4095  PhoH-like protein  48.93 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  49.52 
 
 		 340 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1436  PhoH family protein  50.62 
 
 		 326 aa  296  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0411  PhoH family protein  48.12 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.234067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  48.76 
 
 		 334 aa  296  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0629  putative PhoH-family protein  46.55 
 
 		 359 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0509  PhoH family protein  51.13 
 
 		 345 aa  296  5e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0474  PhoH-like protein  48.9 
 
 		 322 aa  296  5e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0407  PhoH family protein  49.54 
 
 		 330 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0395  PhoH family protein  50.63 
 
 		 343 aa  296  5e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  51.32 
 
 		 320 aa  295  6e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  51.15 
 
 		 319 aa  295  7e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0735  PhoH family protein  50 
 
 		 335 aa  295  7e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.855144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  51.15 
 
 		 319 aa  294  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  51.15 
 
 		 319 aa  294  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2484  PhoH family protein  47.3 
 
 		 320 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  50.82 
 
 		 319 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  50.82 
 
 		 319 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0738  PhoH-like protein  50.31 
 
 		 338 aa  294  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0480  phosphate starvation-induced protein  51.78 
 
 		 353 aa  294  2e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1353  PhoH family protein  50.8 
 
 		 328 aa  293  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000248045  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>