More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1056 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1056  PhoH family protein  100 
 
 
341 aa  691    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563658  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2896  PhoH family protein  79.34 
 
 
355 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.434704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3205  PhoH family protein  69.32 
 
 
368 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3400  PhoH family protein  69.91 
 
 
368 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161796  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3529  PhoH family protein  70.21 
 
 
368 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0638  PhoH family protein  70.43 
 
 
338 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3181  PhoH family protein  69.85 
 
 
365 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0246823  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0234  PhoH family protein  68.84 
 
 
369 aa  455  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1811  PhoH family protein  64.58 
 
 
379 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147763  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  63.95 
 
 
351 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  62.62 
 
 
344 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0047  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  63.41 
 
 
345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  62.78 
 
 
349 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0451  PhoH family protein  63.04 
 
 
351 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0015  PhoH-like protein  61.76 
 
 
349 aa  403  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.945712  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  60.56 
 
 
352 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  56.78 
 
 
327 aa  362  5.0000000000000005e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  56.15 
 
 
353 aa  361  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2067  PhoH family protein  56.47 
 
 
327 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  57.32 
 
 
357 aa  353  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  54.68 
 
 
351 aa  350  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000833124 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3920  PhoH-like protein  54.33 
 
 
348 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  52.98 
 
 
350 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  54.27 
 
 
349 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1244  PhoH family protein  50.3 
 
 
370 aa  334  1e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  54.83 
 
 
342 aa  329  4e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3873  hypothetical protein  53.12 
 
 
339 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3284  PhoH family protein  53.12 
 
 
346 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3599  hypothetical protein  53.12 
 
 
346 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  49.7 
 
 
333 aa  305  7e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  51.57 
 
 
360 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3771  PhoH-like protein  53.53 
 
 
322 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1016  PhoH family protein  50 
 
 
337 aa  301  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0442383  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3692  PhoH family protein  49.23 
 
 
375 aa  299  5e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316664  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0700  PhoH-like protein  48.81 
 
 
373 aa  297  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  49.39 
 
 
348 aa  296  3e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0069  PhoH family protein  46.57 
 
 
363 aa  296  4e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0287585 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0188  PhoH-like protein  48.46 
 
 
338 aa  285  7e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2063  PhoH-like protein  49.68 
 
 
335 aa  281  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.590057 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  45.14 
 
 
319 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  46.47 
 
 
329 aa  276  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  44.16 
 
 
331 aa  276  4e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  44.2 
 
 
319 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  44.2 
 
 
319 aa  275  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  44.2 
 
 
319 aa  275  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  44.51 
 
 
319 aa  275  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  44.2 
 
 
319 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0255  PhoH family protein  45.37 
 
 
328 aa  275  6e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  44.2 
 
 
319 aa  275  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  44.51 
 
 
319 aa  275  8e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  45.6 
 
 
319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  44.2 
 
 
319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  44.2 
 
 
319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  45.08 
 
 
315 aa  273  3e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  42.42 
 
 
328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2905  PhoH family protein  46.87 
 
 
359 aa  272  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.21329  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2813  PhoH family protein  46.87 
 
 
359 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1198  PhoH family protein  43.12 
 
 
348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331138  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  45.95 
 
 
359 aa  270  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  42.81 
 
 
333 aa  268  7e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2721  PhoH-like protein  46.58 
 
 
354 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  44.28 
 
 
341 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0574  PhoH family protein  42.95 
 
 
322 aa  268  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184118  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  44.44 
 
 
315 aa  267  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  44.44 
 
 
315 aa  267  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  46.28 
 
 
339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2713  PhoH family protein  46.11 
 
 
356 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1495  PhoH-like protein  43.89 
 
 
323 aa  263  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0395  PhoH family protein  49.37 
 
 
343 aa  264  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1024  PhoH family protein  44.92 
 
 
320 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1733  PhoH family protein  45.79 
 
 
326 aa  263  4e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0682  PhoH family protein  43.44 
 
 
323 aa  263  4e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0579  PhoH family protein  43.37 
 
 
318 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.818814  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1184  phosphate starvation-inducible protein PhoH, ATPase  47.21 
 
 
319 aa  262  6.999999999999999e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12600  PhoH family protein  42.95 
 
 
320 aa  262  8e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0749  PhoH family protein  46.49 
 
 
327 aa  261  8e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019197 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  45.66 
 
 
323 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2038  PhoH family protein  45.86 
 
 
319 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0597  PhoH-like protein  46.49 
 
 
340 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2064  PhoH family protein  45.86 
 
 
319 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  45.45 
 
 
320 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4280  PhoH family protein  43.67 
 
 
323 aa  260  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1353  PhoH family protein  46.34 
 
 
328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000248045  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2762  PhoH family protein  47.33 
 
 
361 aa  259  5.0000000000000005e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0978111  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1507  PhoH family protein  42.69 
 
 
345 aa  259  6e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048361  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4256  PhoH family protein  45.25 
 
 
323 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2303  PhoH family protein  46.33 
 
 
361 aa  258  8e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76142  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3519  PhoH family protein  45.82 
 
 
357 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3467  PhoH family protein  45.82 
 
 
357 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  46.6 
 
 
341 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  47.47 
 
 
319 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12394  phoH-like protein phoH1 (phosphate starvation-inducible protein psiH)  46.15 
 
 
352 aa  258  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3456  PhoH-like protein  45.82 
 
 
319 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.745001  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2163  PhoH family protein  44.95 
 
 
344 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0763863  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3832  PhoH family protein  45.75 
 
 
351 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1668  PhoH family protein  40.31 
 
 
317 aa  257  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.32569e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  46.58 
 
 
365 aa  257  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3697  PhoH family protein  47.19 
 
 
347 aa  257  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104563  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0480  phosphate starvation-induced protein  44.1 
 
 
353 aa  257  2e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1283  PhoH family protein  47.2 
 
 
333 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.395155  normal  0.918011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>