More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0591 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  100 
 
 		 344 aa  693    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  93.27 
 
 		 351 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0451  PhoH family protein  89.8 
 
 		 351 aa  617  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  89.35 
 
 		 352 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  85.59 
 
 		 349 aa  598  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0047  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  88.52 
 
 		 345 aa  595  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0015  PhoH-like protein  84.15 
 
 		 349 aa  585  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.945712  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1811  PhoH family protein  69.46 
 
 		 379 aa  472  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147763  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1056  PhoH family protein  62.62 
 
 		 341 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563658  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2896  PhoH family protein  64.33 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.434704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3205  PhoH family protein  61.98 
 
 		 368 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3400  PhoH family protein  61.98 
 
 		 368 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3181  PhoH family protein  63.64 
 
 		 365 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0246823  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3529  PhoH family protein  61.98 
 
 		 368 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0234  PhoH family protein  63.64 
 
 		 369 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0638  PhoH family protein  63.81 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  61.59 
 
 		 327 aa  388  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  60.63 
 
 		 353 aa  384  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  59.05 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  62.03 
 
 		 349 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2067  PhoH family protein  61.27 
 
 		 327 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  60.82 
 
 		 351 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000833124 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3920  PhoH-like protein  59.39 
 
 		 348 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  59.88 
 
 		 350 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  54.86 
 
 		 342 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1244  PhoH family protein  54.57 
 
 		 370 aa  338  5e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3284  PhoH family protein  53.64 
 
 		 346 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3599  hypothetical protein  53.64 
 
 		 346 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3873  hypothetical protein  53.33 
 
 		 339 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3771  PhoH-like protein  53.02 
 
 		 322 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  52.11 
 
 		 360 aa  326  5e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0700  PhoH-like protein  51.19 
 
 		 373 aa  321  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1016  PhoH family protein  52.01 
 
 		 337 aa  320  3e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0442383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  50 
 
 		 348 aa  318  7.999999999999999e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  51.9 
 
 		 333 aa  317  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3692  PhoH family protein  51.38 
 
 		 375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0069  PhoH family protein  46.71 
 
 		 363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0287585 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0188  PhoH-like protein  49.7 
 
 		 338 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1436  PhoH family protein  50.78 
 
 		 326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  49.84 
 
 		 331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  49.53 
 
 		 315 aa  299  4e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2063  PhoH-like protein  50.92 
 
 		 335 aa  299  4e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.590057 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  49.05 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  49.05 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  49.68 
 
 		 365 aa  293  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  46.96 
 
 		 328 aa  293  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3697  PhoH family protein  50 
 
 		 347 aa  293  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104563  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  52.38 
 
 		 341 aa  293  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  48.87 
 
 		 329 aa  293  4e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1105  PhoH family protein  50.32 
 
 		 348 aa  291  8e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000125149 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3304  PhoH family protein  50.32 
 
 		 348 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2924  PhoH family protein  49.53 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071554 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0452  PhoH-like protein  49.85 
 
 		 331 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  47.45 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3440  PhoH family protein  50.32 
 
 		 341 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3262  PhoH family protein  50.32 
 
 		 341 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1198  PhoH family protein  45.89 
 
 		 348 aa  290  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331138  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2949  PhoH family protein  49.68 
 
 		 350 aa  291  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  48.05 
 
 		 319 aa  290  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1180  PhoH family protein  49.84 
 
 		 355 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  47.02 
 
 		 323 aa  290  3e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  47.4 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  47.4 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  47.4 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  49.68 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  47.4 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  47.4 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  47.73 
 
 		 319 aa  288  6e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2856  PhoH family protein  49.52 
 
 		 349 aa  288  6e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  47.71 
 
 		 340 aa  288  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3138  PhoH family protein  49.2 
 
 		 346 aa  288  7e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504008  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0022  PhoH family protein  49.18 
 
 		 314 aa  288  8e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.123804  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  47.88 
 
 		 319 aa  288  9e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1007  PhoH family protein  49.84 
 
 		 354 aa  288  9e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.109119  normal  0.0769537 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  47.73 
 
 		 319 aa  287  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  49.06 
 
 		 339 aa  287  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2722  PhoH family protein  49.7 
 
 		 348 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.72441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  49.52 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2082  PhoH-like protein  49.7 
 
 		 348 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1003  PhoH family protein  49.84 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00802061  normal  0.173492 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1068  PhoH family protein  49.84 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3950  PhoH family protein  50.31 
 
 		 374 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.493956 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2694  PhoH family protein  49.7 
 
 		 348 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2163  PhoH family protein  47.42 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0763863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  48.25 
 
 		 328 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  49.53 
 
 		 325 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  47.4 
 
 		 319 aa  287  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3472  PhoH family protein  49.68 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.020153  normal  0.0289175 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0574  PhoH family protein  46.35 
 
 		 322 aa  287  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184118  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  47.4 
 
 		 319 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  47.39 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  51.62 
 
 		 323 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2576  PhoH family protein  49.03 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  49.04 
 
 		 347 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3301  lipoate synthase  46.82 
 
 		 364 aa  286  4e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0714  PhoH family protein  48.54 
 
 		 348 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0457534  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0823  PhoH family protein  48.54 
 
 		 348 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0728  PhoH family protein  48.54 
 
 		 348 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.93581 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0787  PhoH family protein  48.54 
 
 		 348 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0775  PhoH family protein  48.54 
 
 		 348 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.774508  normal  0.946623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>