More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4663 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  99.4 
 
 
332 aa  672    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  98.8 
 
 
332 aa  669    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  100 
 
 
332 aa  677    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  97.29 
 
 
332 aa  665    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  89.33 
 
 
334 aa  600  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4346  PhoH-like protein  86.69 
 
 
340 aa  584  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4805  PhoH-like protein  86.69 
 
 
340 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09060  PhoH-like protein  87.77 
 
 
336 aa  569  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706372  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3780  PhoH family protein  85.05 
 
 
350 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.150452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  82.04 
 
 
340 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  82.35 
 
 
340 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  68.37 
 
 
328 aa  435  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2335  PhoH-like protein  70.62 
 
 
364 aa  435  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  69.13 
 
 
348 aa  434  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  66.88 
 
 
341 aa  430  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0238  PhoH-like protein  66.67 
 
 
330 aa  428  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2291  PhoH family protein  68.15 
 
 
334 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3301  lipoate synthase  64.44 
 
 
364 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3573  phoH family protein  60.9 
 
 
368 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189544  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0395  PhoH family protein  62.86 
 
 
343 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00447  ATP-binding protein  60.61 
 
 
328 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000644199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  62.34 
 
 
365 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1883  PhoH family protein  60.55 
 
 
327 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114064  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1183  PhoH family protein  62.07 
 
 
337 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  61.66 
 
 
347 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1353  PhoH family protein  59.44 
 
 
328 aa  398  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000248045  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0534  PhoH family protein  62.5 
 
 
342 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1948  ATP binding protein  60.24 
 
 
327 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.875532  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0483  phoH family protein  62.81 
 
 
367 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000530716  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2207  PhoH-like protein  62.39 
 
 
345 aa  394  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.935668  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0892  PhoH family protein  57.23 
 
 
359 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.427486  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1970  PhoH family protein  59.45 
 
 
379 aa  391  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0372063  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0627  putative PhoH-like protein, ATPase  59.7 
 
 
361 aa  391  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.121399  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2576  PhoH family protein  62.39 
 
 
356 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02231  putative ATP-binding protein in pho regulon  63.04 
 
 
370 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1105  PhoH family protein  61.26 
 
 
348 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000125149 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004212  phosphate starvation-inducible protein PhoH  62.46 
 
 
365 aa  388  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00393498  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3304  PhoH family protein  61.26 
 
 
348 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01229  hypothetical protein  62.46 
 
 
365 aa  388  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0591  PhoH-like protein  58.91 
 
 
361 aa  389  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0995  PhoH-like protein  61.52 
 
 
356 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0457768  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3138  PhoH family protein  63.44 
 
 
346 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504008  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00628  predicted protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  61.21 
 
 
359 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2966  PhoH family protein  61.21 
 
 
359 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.069683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0682  PhoH family protein  61.21 
 
 
346 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0121436  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00619  hypothetical protein  61.21 
 
 
359 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0753  PhoH family protein  61.21 
 
 
346 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00493548  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0707  PhoH family protein  61.21 
 
 
346 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0340161  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2985  PhoH family protein  61.21 
 
 
359 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189197  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0587  PhoH family protein  61.21 
 
 
346 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.139571  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2856  PhoH family protein  60.54 
 
 
349 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3262  PhoH family protein  63.04 
 
 
341 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3440  PhoH family protein  63.04 
 
 
341 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1003  PhoH family protein  60.54 
 
 
354 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00802061  normal  0.173492 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1007  PhoH family protein  60.84 
 
 
354 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.109119  normal  0.0769537 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0689  PhoH family protein  61.21 
 
 
346 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018585  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0714  PhoH family protein  60.3 
 
 
348 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0457534  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0474  PhoH-like protein  60.95 
 
 
322 aa  384  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3135  PhoH family protein  62.65 
 
 
352 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0787  PhoH family protein  60.3 
 
 
348 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0775  PhoH family protein  60.3 
 
 
348 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.774508  normal  0.946623 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1068  PhoH family protein  62.31 
 
 
347 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1196  PhoH family protein  62.65 
 
 
352 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1186  PhoH family protein  61.35 
 
 
348 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0119675 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0823  PhoH family protein  60.3 
 
 
348 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0728  PhoH family protein  60.3 
 
 
348 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.93581 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1830  hypothetical protein  62.11 
 
 
357 aa  378  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1180  PhoH family protein  62.31 
 
 
355 aa  381  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3006  PhoH family protein  62.11 
 
 
357 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.425195  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3697  PhoH family protein  61.59 
 
 
347 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104563  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1218  PhoH family protein  59.63 
 
 
351 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0284374  normal  0.476314 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2924  PhoH family protein  60.44 
 
 
347 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0071554 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2949  PhoH family protein  61.33 
 
 
350 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1107  PhoH family protein  61.03 
 
 
351 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2916  PhoH family protein  62.11 
 
 
357 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0010821  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3472  PhoH family protein  61.27 
 
 
347 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.020153  normal  0.0289175 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0682  PhoH family protein  57.23 
 
 
323 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1495  PhoH-like protein  57.23 
 
 
323 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2138  PhoH family protein  58.82 
 
 
331 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888079  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0345  PhoH-like ATP-binding protein  59.21 
 
 
370 aa  367  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0749  PhoH family protein  57.74 
 
 
327 aa  361  8e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0597  PhoH-like protein  57.74 
 
 
340 aa  361  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  58.26 
 
 
325 aa  358  5e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  58.68 
 
 
330 aa  358  6e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0452  PhoH-like protein  58.73 
 
 
331 aa  358  9e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  58.54 
 
 
341 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0604  PhoH family protein  56.63 
 
 
348 aa  354  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0650  PhoH-like protein  56.5 
 
 
328 aa  354  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3330  PhoH family protein  55.62 
 
 
357 aa  354  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.128023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3239  putative phoH-like protein  57.42 
 
 
338 aa  353  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0411  PhoH family protein  55.46 
 
 
362 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.234067 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0225  PhoH family protein  55.65 
 
 
352 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2721  PhoH family protein  55.65 
 
 
352 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2357  PhoH family protein  55.65 
 
 
352 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2437  PhoH family protein  55.65 
 
 
352 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0709  PhoH family protein  55.33 
 
 
354 aa  352  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95861  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0888  PhoH family protein  55.33 
 
 
354 aa  352  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0723  PhoH family protein  55.33 
 
 
354 aa  352  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0407  PhoH family protein  58.04 
 
 
330 aa  352  5e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0738  PhoH-like protein  57.61 
 
 
338 aa  352  5e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>