More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0022 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0015  PhoH-like protein  94.84 
 
 		 349 aa  666    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.945712  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  100 
 
 		 349 aa  703    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  89.43 
 
 		 352 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0047  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  89.74 
 
 		 345 aa  622  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0451  PhoH family protein  86.61 
 
 		 351 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  85.59 
 
 		 344 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  87.16 
 
 		 351 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1811  PhoH family protein  69.03 
 
 		 379 aa  472  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147763  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2896  PhoH family protein  61.29 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.434704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1056  PhoH family protein  62.78 
 
 		 341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563658  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3181  PhoH family protein  61.77 
 
 		 365 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0246823  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3529  PhoH family protein  62.58 
 
 		 368 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0234  PhoH family protein  63.01 
 
 		 369 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3205  PhoH family protein  62.58 
 
 		 368 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3400  PhoH family protein  62.26 
 
 		 368 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0638  PhoH family protein  62.86 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  61.27 
 
 		 327 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  58.89 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  61.08 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2067  PhoH family protein  60.63 
 
 		 327 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  60.68 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  60.57 
 
 		 350 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  59.94 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000833124 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3920  PhoH-like protein  59.34 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  56.37 
 
 		 342 aa  345  7e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1244  PhoH family protein  54.37 
 
 		 370 aa  340  2e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  53.27 
 
 		 360 aa  335  5e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  54.57 
 
 		 333 aa  335  5e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3771  PhoH-like protein  53.97 
 
 		 322 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3599  hypothetical protein  52.27 
 
 		 346 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3284  PhoH family protein  52.27 
 
 		 346 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3873  hypothetical protein  51.96 
 
 		 339 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  53.16 
 
 		 348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1016  PhoH family protein  51.1 
 
 		 337 aa  312  4.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0442383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0069  PhoH family protein  48.2 
 
 		 363 aa  312  5.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0287585 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0700  PhoH-like protein  50.3 
 
 		 373 aa  311  9e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3692  PhoH family protein  50.32 
 
 		 375 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2063  PhoH-like protein  52.55 
 
 		 335 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.590057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0188  PhoH-like protein  49.69 
 
 		 338 aa  301  8.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1436  PhoH family protein  49.69 
 
 		 326 aa  299  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  49.36 
 
 		 331 aa  299  5e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  49.06 
 
 		 323 aa  299  5e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2924  PhoH family protein  51.4 
 
 		 347 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071554 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  51.33 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  50.48 
 
 		 365 aa  296  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  47.45 
 
 		 333 aa  296  5e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3138  PhoH family protein  49.84 
 
 		 346 aa  293  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0574  PhoH family protein  48.33 
 
 		 322 aa  293  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184118  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3697  PhoH family protein  51.13 
 
 		 347 aa  293  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104563  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1105  PhoH family protein  50.15 
 
 		 348 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000125149 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  47.95 
 
 		 315 aa  292  5e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3472  PhoH family protein  50.78 
 
 		 347 aa  292  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.020153  normal  0.0289175 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  47.78 
 
 		 315 aa  291  8e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  47.78 
 
 		 315 aa  291  8e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3304  PhoH family protein  50.64 
 
 		 348 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3262  PhoH family protein  50.64 
 
 		 341 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3440  PhoH family protein  50.64 
 
 		 341 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  50.8 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13580  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  49.54 
 
 		 349 aa  290  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.340051 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1198  PhoH family protein  45.71 
 
 		 348 aa  290  3e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331138  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3950  PhoH family protein  50.61 
 
 		 374 aa  290  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.493956 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  50.8 
 
 		 330 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  51.75 
 
 		 341 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2576  PhoH family protein  48.91 
 
 		 356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  46.33 
 
 		 328 aa  289  6e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2295  PhoH family protein  47.45 
 
 		 354 aa  288  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4280  PhoH family protein  51.84 
 
 		 323 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0474  PhoH-like protein  48.25 
 
 		 322 aa  287  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3832  PhoH family protein  49.5 
 
 		 351 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0452  PhoH-like protein  49.54 
 
 		 331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1180  PhoH family protein  49.06 
 
 		 355 aa  286  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  48.9 
 
 		 339 aa  286  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2949  PhoH family protein  48.88 
 
 		 350 aa  286  5e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2762  PhoH family protein  49.19 
 
 		 361 aa  285  5.999999999999999e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0978111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  46.6 
 
 		 319 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  46.6 
 
 		 319 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  46.6 
 
 		 319 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  46.6 
 
 		 319 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  46.6 
 
 		 319 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1007  PhoH family protein  49.06 
 
 		 354 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.109119  normal  0.0769537 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2722  PhoH family protein  49.39 
 
 		 348 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.72441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2082  PhoH-like protein  49.39 
 
 		 348 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004212  phosphate starvation-inducible protein PhoH  49.04 
 
 		 365 aa  285  8e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00393498  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2694  PhoH family protein  49.39 
 
 		 348 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  50.49 
 
 		 319 aa  285  9e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  49.84 
 
 		 323 aa  285  9e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4666  PhoH family protein  48.73 
 
 		 316 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  47.23 
 
 		 319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1003  PhoH family protein  48.75 
 
 		 354 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00802061  normal  0.173492 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2856  PhoH family protein  48.44 
 
 		 349 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  46.75 
 
 		 340 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0866  PhoH family protein  51.96 
 
 		 339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0483  phoH family protein  49.04 
 
 		 367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000530716  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3467  PhoH family protein  48.17 
 
 		 357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0604  PhoH family protein  47.29 
 
 		 348 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1068  PhoH family protein  48.75 
 
 		 347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3159  PhoH family protein  50.5 
 
 		 343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00307849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  46.6 
 
 		 319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  46.73 
 
 		 340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3519  PhoH family protein  48.17 
 
 		 357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.311943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>