More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1003 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1180  PhoH family protein  94.93 
 
 		 355 aa  669    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2856  PhoH family protein  93.5 
 
 		 349 aa  655    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1105  PhoH family protein  90.68 
 
 		 348 aa  637    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000125149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1003  PhoH family protein  100 
 
 		 354 aa  728    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00802061  normal  0.173492 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1068  PhoH family protein  100 
 
 		 347 aa  714    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3304  PhoH family protein  90.96 
 
 		 348 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1007  PhoH family protein  98.31 
 
 		 354 aa  716    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.109119  normal  0.0769537 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3440  PhoH family protein  90.78 
 
 		 341 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3262  PhoH family protein  90.78 
 
 		 341 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  80.67 
 
 		 365 aa  598  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2924  PhoH family protein  84.73 
 
 		 347 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071554 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3697  PhoH family protein  82.47 
 
 		 347 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104563  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2576  PhoH family protein  84.16 
 
 		 356 aa  570  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3138  PhoH family protein  83.48 
 
 		 346 aa  566  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504008  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  80.53 
 
 		 347 aa  566  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3472  PhoH family protein  82.34 
 
 		 347 aa  558  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.020153  normal  0.0289175 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02231  putative ATP-binding protein in pho regulon  78.77 
 
 		 370 aa  501  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2207  PhoH-like protein  73.55 
 
 		 345 aa  498  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.935668  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0787  PhoH family protein  72.33 
 
 		 348 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0823  PhoH family protein  72.33 
 
 		 348 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0714  PhoH family protein  72.33 
 
 		 348 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0457534  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0775  PhoH family protein  72.33 
 
 		 348 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.774508  normal  0.946623 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004212  phosphate starvation-inducible protein PhoH  73.03 
 
 		 365 aa  494  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00393498  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0728  PhoH family protein  72.33 
 
 		 348 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.93581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00628  predicted protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  72.3 
 
 		 359 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2966  PhoH family protein  72.3 
 
 		 359 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.069683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01229  hypothetical protein  73.33 
 
 		 365 aa  491  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0707  PhoH family protein  72.3 
 
 		 346 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0340161  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0682  PhoH family protein  72.3 
 
 		 346 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0121436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0753  PhoH family protein  72.3 
 
 		 346 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00493548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0689  PhoH family protein  72.3 
 
 		 346 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2985  PhoH family protein  72.3 
 
 		 359 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0587  PhoH family protein  72.01 
 
 		 346 aa  491  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.139571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00619  hypothetical protein  72.3 
 
 		 359 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0534  PhoH family protein  68.71 
 
 		 342 aa  491  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1107  PhoH family protein  71.63 
 
 		 351 aa  488  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1196  PhoH family protein  70.74 
 
 		 352 aa  487  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1186  PhoH family protein  71.39 
 
 		 348 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0119675 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2949  PhoH family protein  71.43 
 
 		 350 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3135  PhoH family protein  70.45 
 
 		 352 aa  486  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1218  PhoH family protein  71.68 
 
 		 351 aa  485  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0284374  normal  0.476314 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2916  PhoH family protein  72.75 
 
 		 357 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0010821  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1830  hypothetical protein  72.75 
 
 		 357 aa  483  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3006  PhoH family protein  72.75 
 
 		 357 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.425195  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0483  phoH family protein  72.42 
 
 		 367 aa  484  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000530716  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0995  PhoH-like protein  70.61 
 
 		 356 aa  479  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0457768  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3573  phoH family protein  68.42 
 
 		 368 aa  474  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189544  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  62.69 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0345  PhoH-like ATP-binding protein  60.5 
 
 		 370 aa  411  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  61.16 
 
 		 332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  60.54 
 
 		 332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  60.54 
 
 		 332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3780  PhoH family protein  61.85 
 
 		 350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.150452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  60.98 
 
 		 340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  60.49 
 
 		 341 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  60.24 
 
 		 332 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  60.67 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0474  PhoH-like protein  59.82 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3301  lipoate synthase  60.96 
 
 		 364 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09060  PhoH-like protein  60.06 
 
 		 336 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4346  PhoH-like protein  61.42 
 
 		 340 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0238  PhoH-like protein  60.83 
 
 		 330 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4805  PhoH-like protein  61.11 
 
 		 340 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0395  PhoH family protein  56.67 
 
 		 343 aa  388  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1353  PhoH family protein  60.88 
 
 		 328 aa  386  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000248045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0892  PhoH family protein  54.67 
 
 		 359 aa  383  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.427486  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  60.18 
 
 		 348 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00447  ATP-binding protein  60.25 
 
 		 328 aa  381  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000644199  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  60.75 
 
 		 328 aa  381  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1948  ATP binding protein  58.26 
 
 		 327 aa  376  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.875532  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2291  PhoH family protein  59.94 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0682  PhoH family protein  58.99 
 
 		 323 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1883  PhoH family protein  58.57 
 
 		 327 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114064  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1495  PhoH-like protein  58.99 
 
 		 323 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2335  PhoH-like protein  60.82 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  57.23 
 
 		 319 aa  364  1e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1183  PhoH family protein  56.86 
 
 		 337 aa  360  3e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1970  PhoH family protein  51.69 
 
 		 379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0372063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0591  PhoH-like protein  50.99 
 
 		 361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4666  PhoH family protein  56.19 
 
 		 316 aa  355  7.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0627  putative PhoH-like protein, ATPase  50.7 
 
 		 361 aa  352  8e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.121399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  58.71 
 
 		 323 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4241  PhoH family protein  56.17 
 
 		 316 aa  348  6e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  56.77 
 
 		 335 aa  348  6e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  56.45 
 
 		 335 aa  348  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2696  PhoH-like protein  55.45 
 
 		 346 aa  347  2e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0749  PhoH family protein  55.91 
 
 		 327 aa  346  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0597  PhoH-like protein  55.91 
 
 		 340 aa  346  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4067  PhoH family protein  54.29 
 
 		 316 aa  346  4e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3239  putative phoH-like protein  56.31 
 
 		 338 aa  345  6e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0866  PhoH family protein  54.95 
 
 		 339 aa  343  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3950  PhoH family protein  55.16 
 
 		 374 aa  342  7e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.493956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0738  PhoH-like protein  54.26 
 
 		 338 aa  339  4e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0411  PhoH family protein  54.03 
 
 		 362 aa  339  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.234067 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0604  PhoH family protein  54.13 
 
 		 348 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  55.48 
 
 		 330 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2138  PhoH family protein  54.94 
 
 		 331 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888079  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3330  PhoH family protein  53.39 
 
 		 357 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.128023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0509  PhoH family protein  56.68 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  53.01 
 
 		 341 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>